總統選舉於1913年10月6日在憲法會議議場舉行,由國會議員根據《大總統選舉法》開會選舉大總統。總統選舉期間,由袁世凱手下偽裝組成的公民團包圍國會,叫喊“今日非將公民所屬望的總統選出,不許選舉人出會場一步”[1]。然而,在前兩輪投票中,袁世凱仍然分別隻得到471票和497票[1],不滿法定3/4之票數。於是舉行第三次投票,以第二次投票較多的袁世凱及黎元洪進行決選。結果,在出席的722名議員中,袁世凱得507票,超過法定的票數,當選中華民國第1任大總統[2]。10月7日,在同地點選舉副總統,結果出席議員719名,黎元洪以610票,當選中華民國第1任副總統[3]。