所有的生物表現，都是基因控製的結果，有的基因表達，有的不表達，所以有基因型和表現型，過去遺傳上是顯性和隱性。或者說是這些基因在某種條件下表達，在另外的條件下不表達。
雜-交就是把一個或幾個優良品質的不知道是什麽基因，不管是顯性和隱性，通過雜-交技術整合到一個作物裏。因為需要作物種植之後才能表現出來，過程複雜，周期長，工作量大，而且相對來說是盲目的，所以可能動不動就是幾十年，甚至還不一定有好結果。
轉基因是清楚地知道哪個基因有什麽特點，是不是在作物裏表達等等，然後通過一係列實驗室操作，做出轉基因作物，然後在做田間實驗，可能幾年就會出結果，而且結果可以預測。
雖然現在雜-交技術還在使用，但是，很快就會被淘汰的。將來的所有育種技術，都會是轉基因。
袁隆平關於雜-交不是轉基因的說法，其實就是白馬非馬論。下麵是網友轉載的袁隆平關於采訪的原文：
但中國國內質疑-雜交稻實為轉基因水稻的聲音不絕於耳。
“我們雜交稻不是轉基因，完全不同。”袁隆平斬釘截鐵地回應。
他解釋稱，雜-交水稻是一種常規技術，是把兩個遺傳性不同，但是優良性狀，特性能夠互補的（品種）雜交。比如說，有一個穗子很大，但是籽粒很小（很多），但另外一個品種，籽粒很大，這樣雜-交起來，這個雜-種就有優勢：又多又大。
他也表示，雜-種優勢是生物界小到細菌，大到人類的普遍現象。
這裏，他說的雜交技術是一項常規技術，實際上就是原始的，傳統的或者粗糙的意思。而轉基因技術，是現代化的或者精準的雜交新技術。因為發現雜-種優勢的時候，基因技術還不夠發達，人類還沒有認識到基因的重要性，還不知道是什麽基因控製穗子大，什麽基因控製籽粒小。現在已經完全清楚了，就可以通過轉基因技術進行操作了。
雜-種優勢在所有生物裏都存在，那為什麽是這樣呢？因為所有的生物的外在表現，都是基因控製的結果，目的是為了後代更好地適應外界各種各樣的環境。所以無性繁殖不如有性繁殖更先進，因為有性繁殖可以把兩個個體的基因整合到一起，形成雜-種優勢，讓那些適應當時條件的基因表達，不適應的不表達，有利於後代的進化和適應環境。如果有些基因在當時的條件下長期不表達，生物有可能把這些基因剔除，而接受一些更適應環境的基因，於是，一個新品種或者亞種就出現了
