潤濤閻的小天地

政治麵目:瓜子臉。要招人恨,恨得咬牙切齒;要惹人愛,愛得死去活來;要讓人服,服得五體投地。
個人資料
潤濤閻 (熱門博主)
  • 博客訪問:
歸檔
正文

潤濤閻:顏寧剽竊實錘與中國政府應該調查此案

(2019-07-29 12:11:34) 下一個

(一)顏寧2014年《自然》發表的葡萄糖載體論文剽竊他人成果的實錘

有用馬甲在網上幫顏寧洗地的建議潤濤閻去找《自然》雜誌揭發顏寧剽竊一事。我寫信了,也給當初在媒體上讚揚顏寧在2014年論文的大教授們寫信了。就是問他們顏寧論文裏的內容,他們能否幫她找到反駁的理由。如果能找到,告訴我。我還在等回音。

顏寧團隊剽竊他人成果的證據全部在她們的論文裏。根據法律用語,顏寧在該論文裏對剽竊他人成果供認不諱。證據確鑿,實錄如下:

1.論文剽竊的實錄原話是(The original sentence of her Nature paper(p.124) is quoted here:) "On the basis of our structural analysis and published biochemical data, we propose a working model for GLUT1 (Fig. 5)."

Where does the “published biochemical data” come from?

為了防止翻譯的不公平,那我用穀歌翻譯,把顏寧的論文剽竊實錘翻譯成中文:

顏寧團隊如此明顯地剽竊了他人“發表過的生化資料”,作為自己論文的科研成果。道理很簡單:

A + B = C; 

A = 顏寧團隊的結構資料; 

B = 顏寧論文剽竊來的“生化資料”;; 

C = 顏寧論文的成果---葡萄糖載體的工作模型 (Fig. 5  in the 2014 Nature paper). 

B = C (請看我以前的博文圖片,顏寧的圖5 與Yan/Maloney 發表過的一模一樣)

顏寧博士無法反駁她自己的論文,幫她洗地的無外乎以下幾個說法。詳情如下:

1. Yan/Maloney 研究的葡萄糖載體與顏寧團隊研究的葡萄糖載體不是同一個蛋白。那麽,我們看看顏寧的論文裏是怎麽說的:

 “Conclusions derived from such analysis may be generally applicable to other uniporters and proton-coupled symporters.” 

 

Uhpt, Glut1 和 “other uniporters and symporters” 都是同一家族的載體(Microbiol Mol Bio Rev. 1998, 62:(1)1-34), 顏寧說她們的研究結論(注意是結論,不是假說)可以用於同一家族的其它載體,也就是說,Glut1 的結果可以用於同一家族的Uhpt,那同一家族Uhpt 的結果也同樣可以用於同一家族的Glut1. 除非顏寧發現在同一家族的載體裏,還有不同的工作機理與模型。地球人連這樣的預測都沒有,她也沒說過她是這樣預測的。

 

顏寧自己論文的內容,完全徹底堵死了任何反駁她剽竊了他人成果的路。

 

2. 顏寧論文剽竊 “發表過的生化資料”可能不是來自於Yan/Maloney 兩篇論文,而是來自於另外的論文。

 

到目前為止,隻有Yan/Maloney 找到了一個生化途徑:“分子探針+半胱氨酸掃描+放射性葡萄糖分子底物”一步步探索葡萄糖載體的動態機理,是唯一能給顏寧團隊提供的“生化資料”來源,令她得出葡萄糖載體Glut1的工作模型。這其實不是最要命的,最要命的是:即使有另外的科學家找到了另外不同的辦法獲得了葡萄糖載體的動態模型,那絲毫不影響顏寧論文剽竊了他人成果的結論。

 

其差異隻在於:她要麽剽竊了Yan/Malony的科研成果;要麽剽竊了Yan/Maloney + 另外一實驗室的科研成果。因為如果還有另外一家,那這三家的結論都是一樣的,Yan/Maloney 發表在前,她無法繞過去。

 

3. 雜誌對參考文獻的總數限製不是剽竊他人成果的理由,因為顏寧可以減少自己論文的引用。

 

我的信隻問他們一個簡單的問題:顏寧博士自己論文裏的“發表過的生化資料”是誰發表過的?在哪裏發表的?我還在等他們的回應,如果他們能找到幫她反駁的理由就告訴我。

 

下麵的介紹並不重要,那是內行才能明白的科學細節。最重要的是:顏寧認可她的結論是靠“發表過的生化資料”而得出來的。她隻需要給出“發表過的生化資料”是誰的就完事了。如果是她自己發表過的,那當然不屬於剽竊。可她沒給出她在哪裏發表的,也搜不出來,她也拒絕回答這一最簡單最直接也是最核心的疑問。

 

Dr. Nieng Yan knows that “biochemical data” should be required to propose a working model. Structural analysis is based on crystalized protein so that there is no way to confirm that the conformational change really happens. For example, CFTR was believed by the field that the inward- outward-facing conformational change should happen as it was a carrier. In 1992, scientists published a paper and showed that the conformational change should not happen, because the biochemical data obtained from active CFTR protein confirmed that CFTR is a channel (Cell, 1992, 68:809-18). 

 

The first model prediction (outward- inward-facing conformational change) came from the Na+ pump study by Jardetzk in 1966 (Nature 211, 969-970). However, it must have scientific evidence to show that the sugar transporters really work the same way as the Na+ pump prediction. There should be at least one amino acid (aa) in the translocation pathway of an active form protein which can be approached from both sides of the membrane by a sugar analog probe, and at least one aa can be approached from only one side of the membrane. That’s what Yan/Maloney did and the results were published in Cell and PNAS.

 

英文大字典給剽竊的定義:plagiarism definition: the practice of taking someone else's work or ideas and passing them off as one's own. 就是說,把他人的結果或想法搞成是自己的行為就是剽竊。

 

(二)為何中國政府應該對此剽竊案進行調查?

 

在所有的論文不當行為裏,剽竊是最需要膽量的,因為那是自己白紙黑字寫上去的,一旦被揭穿,毫無反駁的可能。而造假就很難被揭穿,尤其是公開表明其技術登峰造極,他人難以做到的論文。這給想重複的科學家造成心理上的恐懼:你重複不出來,那是因為你的技術不行。那就需要很多人重複,最後證明所有的人都無法重複,造假才會被揭穿。可世界上沒有那麽多人去重複他人的研究成果,除非是可利用的技術工具,比如韓春雨的“第四代”。

 

顏寧博士在論文裏公開講她的結果是靠“發表過的生化資料”得出的,除非其“生化資料”來源於她本人的實驗室發表過的論文,否則,她就無法反駁她剽竊了他人成果的實錘指控。那麽,一個連剽竊都敢為的科學家,其科學態度是極其令人擔憂的。

 

人類曆史上有過慘痛教訓,比如上世紀裏的蘇聯最著名的科學家李森科。他的成果就好比潤濤閻家的水果樹:碩果累累,壓斷了枝條級別的。他有斯大林和蘇聯政治局的強力支持,加上他揚言他的論文技術要求極高,都是他人沒辦到的他辦到了。就等於給想重複他試驗的人巨大的心理壓力:你花精力和時間重複我的試驗,你重複不出來,那是因為你笨,水平不夠。

 

那高產大科學家李森科的科學騙術是如何被揭開的呢?因為他的成果具有強大的利用價值,無數科學家們就跟著他的結果繼續搞下去。然而,任何結果都不會有。久而久之,就有越來越多的科學家懷疑他的試驗結果是偽造的了。當權者總誤以為自己才是玩弄政治手腕的,而事實上,蘇聯政治局包括斯大林都被李森科玩弄於股掌之上,為他站台,給他無數資金,被他騙得跟傻子似的。

 

科學研究,能想到新的方法,或開辟出新的學科,是最難的。重複出來他們的試驗結果則是不難的。當你聽到某科學家反複表白自己搞出來的是他人由於技術水平低的原因而搞不出來,你如果不繼續投資下麵的研究,你無所謂損失。如果你想根據這樣的結論繼續搞下去,你需要想想這裏邊的貓膩。

 

我這陣子在查看顏寧團隊的研究結果在中國媒體的報道,結果發現有數萬條搜索出來的她的蛋白結構研究結果與造新藥有關。我用“百度一下就可知道”搜索:“根據顏寧論文,造出的新藥”,看看有沒有在這方麵的結果,搜出來的數以萬計的媒體報道, 逐條查看特別耗時,到現在也沒找到任何新藥上市了,就是說新藥是根據顏寧博士發表過的論文作為靶點造出來的。當然,這不是說就真的沒有,隻是說還沒搜出來。搜不出來不等於沒有。我不是在造藥領域,隻能靠網絡搜索,上萬條地查。中國政府就簡單多了,有審批新藥上市的機構,哪些藥是根據顏寧團隊的解構論文造出來的新藥,政府部門清清楚楚。

 

中國政府的媒體包括電視台都為顏寧、施一公的解構能造新藥站台過,這在西方是絕不會發生的,因為這樣的宣傳會令無數投資人看準了能賺大錢造出新藥的機遇而不惜血本也上馬,到頭來如果是巨資打了水漂,那電視台就會被告。

 

那麽,中國政府是否投資了?民間是否有人根據電視台的宣傳而不惜血本依照顏寧團隊的論文而從事造新藥了?我查不出來情況到底如何。如果顏寧剽竊他人成果的事都敢幹,那對她總是說她們技術高到頂級的言論其目的值得懷疑。這當然不是說她們的技術水平不是超一流,這很可能是真的。然而,作為在生物技術領域幹了幾十年的我認為,生物技術就是生物技術,是應該很容易被掌握的。就算中國隻有清華那三台昂貴的千萬元級別的冷凍電鏡儀器,可世界上還是有超過200台這樣的儀器在使用。我的意思是說:中國政府應該調查顏寧博士的2014年的葡萄糖載體工作模型是否是剽竊=“發表過的生化資料”是否出自她早前發表過的論文,對她的科研道德與遵守規則的定性是非常重要的。如果剽竊都敢幹,那在投巨資造新藥開始前就應該找到另一實驗室就用清華昂貴的儀器重複一下用於造新藥的論文,以防止血本無歸。如果顏寧博士能給出她2014年葡萄糖載體工作模型的論文裏“發表過的生化資料”是來自於她自己的論文,那她的科學態度是毋庸置疑的,即使搞不出新藥,那她發表過的論文也是不需要懷疑其真實性的。

 

我的懷疑是有根據的:如果“發表過的生化資料”是她自己的論文,那她一定在參考文獻裏標出來,讓讀者對她以前的貢獻更認可:“她並非隻在解構領域成績斐然,也在生化領域有傑出貢獻。”那她為何不這麽做???據她自己的回應抱怨有很多人電郵給她,她反而不回答簡單的問題:“published biochemical data”是從哪裏來的?

 

用馬甲幫她洗地“挺顏恨閻”的,無外乎是說那“生化資料”不是來源於 Yan/Maloney,而是來源於他人。這對Yan/Maloney來說的確有差異,但對中國政府來說,沒有絲毫差異:不論你是從哪裏剽竊來的,是張三的還是李四的,其性質是一樣的。

 

別說那篇論文還有結構的成果。潤濤閻沒指責過結構的部分。在她電視演講時,她拿出來的是她的圖5:葡萄糖載體的機理既工作模型。在美國大科學家最近出版的教科書裏介紹的是顏寧的圖5,葡萄糖載體的工作模型,沒有圖3圖4的結構內容介紹。

 

讀者都以為“發表過的生化資料”是她以前自己發表過的論文成果,不敢相信她膽敢把他人“發表過的生化資料”作為自己結論的來源而不給出參考文獻。這是最典型的剽竊案例。中國政府有責任調查此案,因為此論文的研究經費來源根據她自己在論文裏的介紹是:"was supported by funds from the Chinese Ministry of Science and Technology (grant number 2011CB910501), Projects31321062-20131319400,  31125009 and 91017011 of the National Natural Science Foundation of China, and funds from Tsinghua-Peking Center for Life Sciences. The research of N.Y. was supported in part by an International Early Career Scientist grant from the Howard Hughes Medical Institute." 這是她論文給出的資料。為了防止翻譯偏見,用穀歌翻譯資金來源如下:中國科技部(撥款號2011CB910501),中國國家自然科學基金會31321062-20131319400,31125009和91017011,以及清華生命科學中心。N.Y.的研究部分資金來自霍華德休斯醫學院國際早期職業科學家。

 

那麽,中國科技部、國家自然科學基金會、清華大學都有責任對此剽竊案是否屬實進行調查。

 

(三)為何會有很多人披馬甲在網上幫顏寧洗地?

 

人類的人性中最大缺陷就是群羊效應,這是弱肉強食叢林法則的進化結果。多數人不看真相,而是根據誰後台硬就跟隨誰。如果當年汪東興聯手四人幫逮捕了華國鋒葉劍英鄧小平李先念四人,人民大眾照樣敲鑼打鼓慶祝一舉粉碎“四人幫”。這是科學不可能在中國誕生的原因。

 

西方人在這方麵就好很多,科學家們的求真精神打從燒死布魯諾後就井噴式發展壯大。因為科學家們終於明白了:當時幾乎所有的科學家都站在教皇一邊譴責哥白尼布魯諾的說法是錯的,即使燒死布魯諾,照樣改變不了地球圍繞太陽轉最終被接受的事實。這是我給當時讚揚顏寧論文的大科學家們寫信“如果他們能找到幫顏寧反駁的理由立刻告訴我”的最根本的支撐,因為他們當初自然認為“published biochemical data”是顏寧自己發表過的論文。他們不可能跟中國人一樣披上馬甲就認為隻要用力洗、隻要洗的人多,煤球就可以被洗白。

 

顏寧又不是第一次寫科學論文,非常清楚用“發表過的生化資料”以推理出自己的結論時必須給出該“生化資料”來自何處。不論是自己的還是別人的,都必須給出參考文獻。不給出,遇到質問,就得給出自己發表過的論文並對質疑者道歉說當時文章裏沒給出。如果不是自己的成果,那解釋與不解釋都是一樣的:剽竊。這就是科學的規則,是科學家們都必須遵守的道德和法律。你不能拿中國傳統文化裏三十六計那一套來對待科學。是你自己發表過的,就是你的;不是你自己發表過的,就不是你的。黑就是黑,白就是白。這就是科學的特征。

 

有一個案子非常說明這件事:一位醫生在古董專賣店裏看到了一件小古董,一看四下無人就悄悄放入自己提包裏最底下,不交錢就悄悄溜出去。由於店裏有隱形攝像頭,保安到門口等著他。當他在出了付款櫃台邁出店門的時刻被保安擋住,讓他在攝像頭的監視下打開提包。後來法庭上他的辯護律師滔滔不絕,講這醫生救了多少人,每年捐款的錢就比這古董價錢多雲雲。原告律師讓他停,回答一句簡單問話:這古董是不是醫生偷的?少說廢話,就回答這一句。辯護律師說不僅僅這家古董店有這東西,其它地方也有。原告律師讓他拿出哪個店裏還有這東西,因為根據古董店的資料,這件就這家有。辯護律師滔滔不絕也沒用,因為醫生偷盜的視頻在那擺著。別說你忘記了交錢,你一開始就沒打算交錢,否則憑你醫生的智商和經曆,根本就不會忘記付錢。

 

顏寧的剽竊實錘就是她自己論文裏白紙黑字寫的內容,用小學生的說法就是:A+B=C,A是她自己的,B是剽竊他人的,C是她論文的結論,C跟B是一樣的,也就是B=C。對此指控,唯一的反駁就是拿出B來源於她自己發表過的論文。否則,剽竊實錘,一錘定音。

[ 打印 ]
閱讀 ()評論 (178)
評論
Dalidali 回複 悄悄話 "剽竊"!
同行,內行之間, 瞟一眼就明白了. 根本用不著大段的Copy/Paste.

這和同班同學的期終考試一樣, 一個自己不會的題, 有時隻要瞟一眼同桌的就明白了!

cowwoman 回複 悄悄話 小顏文章當然可以被質疑,但老閻的質疑沒有什麽道理。難道微積分推導不許人用阿拉伯數字?現在轉運蛋白已經被行業推到這一步了,小顏又在這裏邁進一步,有什麽可叫抄襲的?老閻歇歇幹點別的吧。
枕寒流 回複 悄悄話 南俠 發表評論於 2019-08-01 20:46:42
見過爭作者排名的,沒見過非要讓別人引用自己文章的。

不要搗漿糊。相關度是關鍵詞。俺還沒見過假裝沒看見Cell,PNAS近年文章,然後吹自己是半世紀以來首次發現XX機理的呢。此事是關乎學術界所有科研人員如何引用相關文獻的嚴肅話題,怎可聽之任之?
Fanreninus 回複 悄悄話 還有就是人家在那麽說以後,從此再也沒有那麽說了,不信看看我介紹他寫的這篇綜述吧?
http://blog.wenxuecity.com/myblog/73963/201905/24210.html
oceanblue2 回複 悄悄話 顏沒有給前輩credit,不應該,因為無論如何不影響她自己什麽。老閻的論文是間接推理,結論仍然是假想。而顏的結果是實實在在看到了,不再是假想,而是證實了。
Dalidali 回複 悄悄話 回複 'Attractivewl' 的評論 :
同感!
南俠 回複 悄悄話 見過爭作者排名的,沒見過非要讓別人引用自己文章的。

老閻你到圖書館看了Oleg Jardetzky的文章,然後硬說是你發明的交變結構模型?別鬧了。
Attractivewl 回複 悄悄話 回複 '潤濤閻' 的評論 : 自從五月份閻潤濤博士在文學城裏披露出大Yan(大閻,閻潤濤)與小Yan(小顏,顏寧)關於糖通過膜傳輸進入細胞的機理誰先提出之爭,我一直跟蹤。大閻的一係列發表在文學城裏的文章論點清晰而到位。反過來,小顏隻在五月份在其微博中說大閻“碰瓷”,就再無下文了。大閻給”Nature”雜誌去了信,但還未有回音,可能需較長時間才收到回複,也可能沒有下文。在這漫長的等待期間。我建議大Y閻與雙方有關的Princeton 和John Hopkins聯係一下,贏得他們的參與與調查,把真相弄個水落石出。我本人在國內的碩士論文以及在美國的博士論文都是關於化學反應動力學與機理研究的。當然也做過合 成,也長出過晶體,雖然不是生物大分子。盡管所研究的反應體係不一樣,但原理是相通的。隻培養出晶體並分析其結構,沒有動態的數據,是推不出反應機理的。另外一點,作為一位作基礎科學研究的科學家,在科研項目立項時,大規模、全方位的有關前人的研究文獻之學習、鑽研並歸納、總結成綜述報告是必須的一環。難以置信,怎麽小顏就露掉了大閻的兩篇重要文獻呢?
oceanblue2 回複 悄悄話 不能說剽竊,因為顏確實分析的自己的數據。但她確實沒有給前輩作出的貢獻以credit
Stegy223 回複 悄悄話 回複'Keyo'的評論: “不知為何在你那裏無法評論,將我的意見貼在這:”
謝謝專門在此留言。Good points. 回頭俺在自己貼下細談。
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 別不好意思,直接投稿去Nature吧。說不定上封麵呢。說你要看精神醫生,你還不相信。真是沒治了。
山丘- 回複 悄悄話 艾瑪 真是網絡時代了呀 小學生也好意思寫科普了 還到處一遍遍的打廣告 哈哈哈
SwiperTheFox 回複 悄悄話 不好意思, 下麵這貼本來不是想貼這兒的, 說明一下。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 借寶地又喊一聲,對科學本身有興趣的請移步 批閱拙文。

讀懂顏三篇的基礎(二)--蛋白質的四級結構

http://blog.wenxuecity.com/myblog/49113/201907/35784.html

讀懂顏三篇的基礎(一)--什麽叫機理

http://blog.wenxuecity.com/myblog/49113/201907/35699.html
Keyo 回複 悄悄話 回複 'Stegy223' 的評論 : 不知為何在你那裏無法評論,將我的意見貼在這:

有道理,提兩點意見:

1. “俗稱喇叭口朝外”和“俗稱喇叭口朝裏”兩構相似無比要,去掉這兩個構相就會形成一個完整循環。

2.循環應該是順時針方向。嚴格一點的話,順時針方向為長箭頭,逆時針方向為短箭頭。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'Stegy223' 的評論 :

都來這兒做廣告:)

對科學本身有興趣的讀者請移步:

http://blog.wenxuecity.com/myblog/49113/201907/35699.html

讀懂顏三篇的基礎(一)--什麽叫機理
Stegy223 回複 悄悄話 回複'SwiperTheFox'的評論: “顏2014圖5所依據的基本模型(注四構象循環)是行內“路人皆知”的”

基本同意Fox這一說法。拙文也從一個角度對此做了一點解析。“三腳貓看閻顏之爭 - 俺也有個構象轉換模型”。http://blog.wenxuecity.com/myoverview/75502/
歡迎光顧敝舍並指正。
ft 回複 悄悄話 回複ans 的評論:
閻說已經寫信給自然雜誌了,正在等回信。說明閻對自己的質疑是很嚴肅認真的。如果出版社不回複,閻仍然有權利質疑。

你說在小顏眼裏,潤濤閻什麽都不是。請問此話怎講? 為什麽?誰賦予小顏這樣蔑視別人的權力?這話是你代表小顏說的嗎?
有理說理,如果你也是所謂的科學家,說出這樣潑婦罵街的話你不覺得無恥嗎! 一眾數不勝數的著名科學家們,比如居裏夫人,愛因斯坦,牛頓等等等等,他們對科學和人類的貢獻巨大無比,他們當中的任何一個人都不會說出這樣無恥傲慢的話。顏有你這樣的支持者真是丟臉啊。希望你這無恥的話僅出自你的口,不是代表顏說的。

*************
ans 發表評論於 2019-07-31 14:33:47
小顏不需要回答你任何問題。在她眼裏你什麽都不是。 就像物理學家需要回答自稱造出永動機的民科嗎?要鬧,你去找發表她文章的專業期刊,找評審她工作的同行教授科學家,找評她院士的美國科學院。別扯沒用的,把回信拿出來。
冥王天蠍 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 :
我不得不說,目前我沒有發現博主說的在邏輯上有任何問題。顏寧的工作的確應該受到質疑。感覺你的反駁都較牽強,不過反駁精神可嘉,值得鼓勵。所以,我建議更多科學家參與論證評判此事,不僅僅限於某個窄的行業圈,也不僅僅限於文學城博客。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 '冥王天蠍' 的評論 :

還有一點必須受清楚:
Their data provide compelling physical evidence for a general model of facilitative membrane transport derived solely on the basis of kinetic transport data."

這句話,說該模型以前是有動力學實驗提供的證據。 也就是說模型存在於閻文之前。

閻這篇提供了Compelling physical evidence。 證據再Compelling, 模型也不是閻潤濤的。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 '冥王天蠍' 的評論 :

我認同你對閻潤濤文章貢獻的評論,但是你的評論與閻潤濤的Claim是不同的。

早想說這句話: 如果閻潤濤說: “我為顏寧的工作,特別是為AAM模型,第一提供了重要的生化證據“。 我們大家都為他歡心鼓舞, 表示佩服。 但是他非說

1。 這模型是他的 --與事實不符。
2。 做出葡萄糖模型的隻有他與顏寧兩家--這與事實不符。 早有1973年動力學實驗,後有2013年Iancu和 Madej兩篇論文,都基於與顏2014相同的基本模型。

而且這是回答了閻潤濤的吹毛求疵。 至少四五個實驗室, 研究的相似的蛋白:LacY, GlpT 等等等等,都是用類似的模型。 顏2014圖5所依據的基本模型是行內“路人皆知”的。 怎麽就成了閻潤濤的了? (注: 顏在2014圖5中加了自己重要的貢獻, 所以稱為"working model" 。 )

1966年經典都不可以與牛頓定律比肩, 更別說閻潤濤提供了證據。


冥王天蠍 回複 悄悄話 以我個人的審稿經驗和經曆,一般來講,使用“compelling”來評價一個人以前的工作是非常少見的,除非被評價的這個工作的確做得非常好,基本上就是最高水平了。“general”也是一個非常高的評價,也這是一個“model”所最應追求的。
冥王天蠍 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 :

“compelling”意指“引人注目的”、“令人信服的”、“緊迫的”等,不僅僅隻“重要的”。“for a general model”確有建立自己模型的含義。一個已經建立的模型沒有所謂“過時”一說,隻有對與錯,就好比量子力學與相對論的建立不會使得牛頓三定律過時一樣。但錯誤的模型就不同了,例如,早建立的地心說是錯的,而之後的日心說是對的,就太陽係來說。
Wtp003 回複 悄悄話 回複 '潤濤閻' 的評論 :
“細菌與人體葡萄糖載體相差十萬八千裏?”
這裏指的是實驗材料,所以支持顏的就想當然。
正話反說而已。
自然雜誌連收到信的回複都沒有嗎?
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 '冥王天蠍' 的評論 :

請看人家的用詞說: Their data provide compelling physical evidence for a general model of facilitative membrane transport derived solely on the basis of kinetic transport data."

閻潤濤為模型提供了重要證據,不是說閻建立了自己的模型。

Mueckler從1999到2009年發了12篇GLut1的論文, 加這一篇13篇。 1999兩篇還引閻,2004後的好幾篇都沒引。 為什麽: 閻的貢獻已經“過時”了。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 '潤濤閻' 的評論 :

你那些沒有專業知識,沒看過paper的粉絲就算了,你到底看過顏2012沒?

誰說做結構晶體的文章就不(可以)做生化實驗了?

顏2012 圖2b, 3c, 4d, 5c 是晶體,是結構實驗還是生化實驗? 她這一篇用於生化實驗的突變數量就跟你1995那篇差不多。

她在2014年討論裏引了一篇Iancu的結構的文章,但是引得生化實驗的結果,你是沒看見還是沒看懂?
冥王天蠍 回複 悄悄話 "Yan and Maloney (21), using a cysteine substitution experimental approach, have defined three distinct regions within putative transmembrane helix 7 of the bacterial glucose 6-phosphate antiporter, UhpT. They discovered that amino acid residues were either accessible to pCMBS only in intact cells, accessible only in inverted membrane vesicles, or accessible in both circumstances, depending on their relative location within the transmembrane helix. Residues close to the exoplasmic membrane face fell into the first category, residues close to the cytoplasmic membrane face fell into the second category, and residues near the middle of the helix fell into the third category. They interpreted their observations in terms of the classic single-site membrane carrier model (3, 4), where one would expect amino acid residues involved directly in substrate binding (in the middle of helix 7 in the case of UhpT) that become exposed to both aqueous compartments during the course of the transport cycle. Residues that lie on the exofacial side of this region may only be exposed to the exoplasmic compartment, and residues that lie endofacial to this region may only be exposed to the cytoplasmic compartment. Their data provide compelling physical evidence for a general model of facilitative membrane transport derived solely on the basis of kinetic transport data."

THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY Vol. 272, No. 48, Issue of November 28, pp. 30141–30146, 1997

博主不妨也直接聯係Mike Mueckler和Carol Makepeace以及更多直接引用Yan and Maloney的工作的論文作者試試。
ans 回複 悄悄話 小顏不需要回答你任何問題。在她眼裏你什麽都不是。 就像物理學家需要回答自稱造出永動機的民科嗎?要鬧,你去找發表她文章的專業期刊,找評審她工作的同行教授科學家,找評她院士的美國科學院。別扯沒用的,把回信拿出來。

潤濤閻 發表評論於 2019-07-31 13:45:24
細菌與人體葡萄糖載體相差十萬八千裏?
去讀顏寧本人在2012年《自然》發表的人體葡萄糖載體Glut1細菌homologue是如何詳細描述葡萄糖載體從細菌到人體的保守性的。我就用她自己的觀點堵死替她辯護的路。說別的沒用,她就需要回答一句話:她論文裏的“published biochemical data"哪裏來的?是她發表過的嗎?

我沒提她論文其它內容,就需要她回答這句話。簡單不?
潤濤閻 回複 悄悄話 回複 'Nekono_88' 的評論 :

他就是顏寧的高級黑啊。都是抹黑顏寧的。顏寧把結構的分析結果與生化數據是平行表達的,中間用And連接。顏寧什麽時候發表過生化數據研究葡萄糖載體的論文?那她用的是誰發明出來的方法?
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 看過心理醫生了?小閻2014文,圖5裏提到兩篇參考文獻(28,29),是結構,不是biochemical data,你還好意思跟在Fanreninus後麵亂噴。
潤濤閻 回複 悄悄話 顏寧的論文裏就提到她的人體Glut1 的結論適用於proton symporter,細菌的LacY就是啊。外行在這裏胡言亂語,給顏寧抹黑。

她文章就有D-xylose transporter,細菌的xylE,不就是細菌的?
儒子牛 回複 悄悄話 在這件事上我相信閆先生。拋開閆先生的政治觀點,這麽一把年紀想來不會像顏寧說的碰瓷這麽簡單。閆先生也算子女成功事業有成,犯不著趟這趟混水,稍微想想就應該能想到。
顏寧用碰瓷這個詞,也忒沒水平了。
科學界的事,我不懂,但腦子稍微過一點邏輯,裏麵的水還是挺深的, 支持閆先生較這個真。
潤濤閻 回複 悄悄話 細菌與人體葡萄糖載體相差十萬八千裏?
去讀顏寧本人在2012年《自然》發表的人體葡萄糖載體Glut1細菌homologue是如何詳細描述葡萄糖載體從細菌到人體的保守性的。我就用她自己的觀點堵死替她辯護的路。說別的沒用,她就需要回答一句話:她論文裏的“published biochemical data"哪裏來的?是她發表過的嗎?

我沒提她論文其它內容,就需要她回答這句話。簡單不?
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'Wtp003' 的評論 :

不知道有多少人看了顏寧的原文. Fanreninus把顏寧2014整篇論文翻譯成了中文.

http://blog.wenxuecity.com/myblog/73963/201907/34528.html
Wtp003 回複 悄悄話 回複 '枕寒流' 的評論 :
”此事的是非曲直顯而易見啦”
什麽意思?你是說顯可易見老閆發失心瘋,明明自己用的細菌小顏用的人材料 差的十萬八幹裏還腦子進水要求credits?

奇怪的是這麽顯而易見的證據都是外行反反複複說起來沒完沒一個真懂行的看出來??!!
Wtp003 回複 悄悄話 回複 '潤濤閻' 的評論 :
“英文原話:“Their data provide compelling physical evidence for a general model”
這裏general model 翻譯成一般模型沒有完全表達其含義。general 這裏有普遍,一般性,通用的意思。也就是說其數據任何(做這種)模型的都有用。
山丘- 回複 悄悄話 打錯字了 是“博主”不是“博士” 更正一下
山丘- 回複 悄悄話 回複 'ans' 的評論 :
首先先不要那麽激動 你心平氣和的看下博士提到的為啥他覺得中國政府應該介入調查此事 你就明白我為啥這樣說了
ans 回複 悄悄話 這就是閆粉的水平????。發表小顏文章的是國際專業雜誌,評審她的是國際專業學者,選她當院士的是美國科學院,跟中國政府中國學術界有什麽關係!!!這種潑汙水的伎倆太弱智了。祥林嫂讓人同情,閆與閆粉手段讓人厭惡。還是那句話,別扯沒用的,老閆把專業雜誌和專業科學家的回信拿出來


回複 '潤濤閻' 的評論 : 祝一切安好!支持您的求真執著精神。相信您會從自然雜誌社得到公正合理的回應
不過 我對中國政府學術界是不抱希望的 一是中國學術界已經非常腐敗了 這種事對他們而言不算什麽 二是中國政府現在維穩意識到了一個新高度 好象網上給維權的帖子點讚都要被約喝茶 大家都事不關己高高掛起 盡量不惹麻煩.... 這種氣氛下 給他們寫信可能是浪費時間
山丘- 回複 悄悄話 回複 '潤濤閻' 的評論 : 祝一切安好!支持您的求真執著精神。相信您會從自然雜誌社得到公正合理的回應
不過 我對中國政府學術界是不抱希望的 一是中國學術界已經非常腐敗了 這種事對他們而言不算什麽 二是中國政府現在維穩意識到了一個新高度 好象網上給維權的帖子點讚都要被約喝茶 大家都事不關己高高掛起 盡量不惹麻煩.... 這種氣氛下 給他們寫信可能是浪費時間
ans 回複 悄悄話 別扯沒用的,老閆把專業雜誌和專業科學家的回信拿出來
山丘- 回複 悄悄話 回複 '康霖' 的評論 :
“相信正直較真的學者專家們會鼎力支持老閻的正義求真精神,以保學界不被剽竊捷徑所汙染,以公道鼓勵後輩們努力工作,真正為科學發展作出貢獻,並得到應得的認可和回報。” 讚!
同相信!

康霖 回複 悄悄話
Yan/Maloney模型不光是Yan/Maloney的成果,也是John Hopkins的成果,應該知會John Hopkins相關部門,相信正直較真的學者專家們會鼎力支持老閻的正義求真精神,以保學界不被剽竊捷徑所汙染,以公道鼓勵後輩們努力工作,真正為科學發展作出貢獻,並得到應得的認可和回報。


NATURE現在正以XX速度高速擴張,旗下新雜誌幾乎覆蓋了大多數領域,魚龍混雜的可能性是存在的。
ft 回複 悄悄話 回複潤濤閻:你的質疑十分簡單明確,就是讓顏提供她論文中引用的數據的來源,這個數據是她論文中所建立的model的基礎,沒有這個數據,她的model也不可能建立起來。對這樣決定model的數據她在論文中不給出引用的來源實在是讓人wonder why why why! 根據你引用她的英文原句,那個句子給人的信息是這個數據是她們提出的,即便如此,也應給出數據出處。
支持你追下去,采納枕寒流的建議。
在此,也建議顏公開回應閻的質疑,幾分鍾幾句話給出數據來源和出處,如果數據完全是顏自己團隊的,到那時,閻公開誠摯道歉。
康霖 回複 悄悄話

Yan/Maloney模型不光是的成果,也是John Hopkins的成果,應該知會John HopkinsJohn Hopkins,相信正直較真的學者專家們會鼎力支持老閻的正義求真精神,以保學界不被剽竊捷徑所汙染,以公道鼓勵後輩們努力工作,真正為科學發展作出貢獻,並得到應得的認可和回報。


NATURE現在正以XX速度高速擴張,旗下新雜誌幾乎覆蓋了大多數領域,魚龍混雜的可能性是存在的。
ENTP 回複 悄悄話 聯係中國政府好,有了反獨裁和推廣民主價值
在網上聯係廣大網友更好,妥妥的民主實踐
這下好了,民主和反獨裁都有了,一定成功,沒跑
潤濤閻 回複 悄悄話 研究Glut1(也是顏寧論文的材料)權威,第一個提出由12個穿膜螺旋組成的Glut1葡萄糖載體蛋白的Mike M. Mueckler,利用Yan/Maloney的方法對Glut1的研究發表了超過10篇論文,驗證了Yan/Maloney的“生化數據”對葡萄糖載體研究的廣泛適用性。他論文的評論:"Yan/Maloney的數據為完全基於動力學機理數據得出的膜載體的一般模型提供了令人信服的物理證據。”

英文原話:“Their data provide compelling physical evidence for a general model of facilitative membrane transport derived solely on the basis of kinetic transport data.

這也就是說,顏寧論文裏提到的“published biochemical data" 到目前為止隻能是Yan/Maloney的方法提供的。包括Glut1 的生化數據。

別扯沒用的。看葡萄糖載體生化領域頂級權威專家的評論。
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 閣下,你的認知(Cognition)和短期記憶(short-term memory)已經有非常嚴重的問題了,建議你去看心理醫生。大閻此貼的第一段已經清清楚楚表明,他已經給寫信Nature了,正在等回音。如果你是真的有精神問題,而不是假裝看不懂中文的話,我要向你表示歉意,因為此前我一直認為我是在和一個身心,心理都正常的網友交流。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 '枕寒流' 的評論 :

我支持閻潤濤上書給自然雜誌,普林斯頓,和美國科學院。也懇請閻潤濤不管對方回信是什麽內容都公之於眾。

再陳述一個事實: 閻潤濤喊著給自然雜誌寫信是5月份的事了。 到現在也沒告訴大家他寫了沒有, 發出去沒有。 希望見到老閻的行動。
枕寒流 回複 悄悄話 支持學術打假。現在國內對學術腐敗不像先前了。沒有誰能一手遮天。對顏寧的質疑若是一追到底,應該直書普林斯頓大學和美國科學院了。此事的是非曲直顯而易見啦。
城頭還有一篇JessAB的評論文。我沒有點擊。根據其以往立場,也不值得懷著好奇心增加其點擊率。
ft 回複 悄悄話 回複newgarden246:不要偏離閻在此文中的關鍵點,即請顏給出她論文中所提及的"published biological data"的來源,直接針對閻的這個問題回答就行了,這是個極易看懂的問題。
Keyo 回複 悄悄話 沒有覺得博主是在網上吵,要討個公道。
閻文和顏文白紙黑字放在那,就意味著結論已經有了,所有的爭論,包括閻和顏的,實際上都改變不了什麽。曲解,胡亂引申顏文來洗地不但與事無補,反倒使護顏方麵更被動 (博主文中的“實錘”是取自洗地言論的吧?)。解決問題最簡單的辦法是顏在她下一片有關綜述(或論文引言)中,給閻文credit.

至於跟貼中提到的“打假”, 實在是不恰當。博主隻是提到“剽竊”,而且並沒把話說死,目的是要看顏那邊如何反應。顏文中作假不太可能吧?不給閻文credit, 也不是完全不留餘地的,所以才有那麽多爭論。
zhonghuaren 回複 悄悄話 對不起、錯點了兩次。這要是最後能達到一個有利的結果那就算是拍案驚奇的傳世經典了
zhonghuaren 回複 悄悄話 老閻打假、有理(論模型)有(實驗根)據有節(奏)、希望最後結果是正本清源有利於科學道德規範
zhonghuaren 回複 悄悄話 老閻打假、有理(論模型)有(實驗根)據有節(奏)、希望最後結果是正本清源有利於科學道德規範
newgarden246 回複 悄悄話 回複 'ft' 的評論 : 從5月 份到今天, 顏寧對相關的問題的回答是”碰瓷”, 解釋是: 她是以鈉泵的模型作為推理動態模型的…..這樣的素養再加上這麽長的時間, 這答案不是很明顯的嗎? 還能指望她怎麽解釋呢? 那不是為難她嗎?

而這個答案就是:

“ 如果不是自己的成果,那解釋與不解釋都是一樣的:剽竊.”
北佛風光 回複 悄悄話 回複 '潤濤閻' 的評論 :閻博主你這麽在網上吵沒啥用, 這麽隔空要求中國政府介入調查沒人會理你。 你給 自然雜誌 寫了信, 也許雜誌社會給你有個回複。

你要是心裏真的沒法接受顏說你碰瓷, 建議你把這篇博文轉成英文直接寄給顏寧的係主任(Bonnie L. Bassler, Chair, Department of Molecular Biology, Princeton University), 事關學術聲譽係裏和Princeton校方自然會過問這這事兒, 會由係裏或校方成立一個委員會審查一下。 不過這樣做你得考慮承受後果, 就是顏也可以在美國法庭告你誹謗罪。
ft 回複 悄悄話 我並不是閻的粉,也沒有馬甲。

如果顏不能給出"published biochemical data"出處並且有已經發表的論文證明這些數據是顏自己團隊做的,顏著實有剽竊的嫌疑。沒有數據做基礎一切成果都是空談又怎麽會發展出model。所以讓人納悶不解,這麽簡單的問題顏為何不答閻。
嘎德 回複 悄悄話 回複 '危言' 的評論 : “就往壞了說,這事在學術界不了了之。”

為什麽最終結果是不了了之?

這還要從張益唐的故事說起,張益唐是混數學界的,數學界是出名的沒啥油水,就是沒錢,數學教授的工資都不好意思拿出來和人講,所以業內都是一幫書呆子nerd,是真愛數學的人,所以數學家才會追求真理以及詩和遠方。

老閻所混的生化界就不一樣了,是要砸大把錢才能做實驗的,做出來的成果如果可以做成藥物等等那更是不得了了,換句話說是在金山銀山滴幹活懂嗎?做生化的科學家也許有真愛,但是很大部分已經鑽到錢眼裏去了。所以每個生化的山頭都是一個涉及巨額金錢的利益集團,任何人想動他們的cheese不是明明白白地找抽嗎?

人性在海量金錢麵前是那麽的渺小脆弱,真理等等值幾個錢?明白不?
sensei321 回複 悄悄話 很奇怪:剽竊這麽大的事,還有實錘,怎麽他本人不想,也沒有閆粉建議走正常法律程序,起訴她?
唐西 回複 悄悄話 真笑噴了,老閻來打假,方舟子不來都給老閻麵子了。
ft 回複 悄悄話 更正:
問網友一個英語問題:
"On the basis of our structural analysis and published biochemical data, we propose a working model for GLUT1 (Fig. 5)."
這句英語裏的"published biochemical data"我理解為"our published biochemical data",即是顏團隊自己發布過的生化數據。即使是她們自己的,也應該給出出處,因為她們是在這個已發布的數據基礎上搞得此項科研成果。
如果是別人的數據,是否應該這樣寫:"On the basis of our structural analysis and the published biochemical data....", 我在此加了一個 "the"。
不管是哪一種情況,顏都應給出數據的出處。如果是別人的數據,就更應該給出數據出處。
如果該數據是她們自己從前發布的,那就不是剽竊。顏隻要公開澄清回答閻即可。回答有那麽難嗎?
自然雜誌審稿專家睡著漏看了。
ft 回複 悄悄話 問網友一個英語問題:
"On the basis of our structural analysis and published biochemical data, we propose a working model for GLUT1 (Fig. 5)."
這句英語裏的"published biochemical data"我理解為"our published biochemical data",即是顏團隊自己發布過的生化數據。即使是她們自己的,也應該給出出處,因為她們是在這個已發布的數據基礎上搞得此項科研成果。
如果是別人的數據,是否應該這樣寫:"On the basis of our structural analysis and a published biochemical data....", 我在此加了一個 "a"。
不管是哪一種情況,顏都應給出數據的出處。如果是別人的數據,就更應該給出數據出處。
如果該數據是她們自己從前發布的,那就不是剽竊。顏隻要公開澄清回答閻即可。回答有那麽難嗎?
自然雜誌審稿專家睡著漏看了。
lostman 回複 悄悄話 中國政府絕對不會管這個事,除非滿世界都知道是顏寧剽竊,這往自己臉上貼金的事政府搶著幹,像楊振寧的諾貝爾,政府趕緊去監獄看望他老丈人,調查顏寧剽竊這種往自己腦袋上扣屎盆子的事,政府無論如何也不會做的
絕對運動 回複 悄悄話 十億人民九億騙,總部就在駐馬店。曆害國裏最不缺的就是騙子。
曆害國老科學家還畝產萬斤呢。
blue6albion 回複 悄悄話 就往壞了說,這事在學術界不了了之。那顏美女總還有機會上電視,總會有好事者問起2014年解決50年一遇的雄文吧?

顏美女要理直氣壯並怒斥無恥碰瓷之輩,俺就服了她。要是她象韓寒被問到三重門那樣顧左右而言它,那對俺來說這就證明大俠有理了。

估計大部分人跟俺一樣,對洞察別人在大庭廣眾之下的肢體語言是有點信心的。譬如新中國好不容易拿得出手的文藝作品“梁祝”號稱是陳剛、何占豪合寫的。但有次看完有他倆和於麗拿參加的電視節目,俺就偏向功勞太半應歸陳剛,而何和於責說了虧心話。
嘎德 回複 悄悄話 回複 'Dalidali' 的評論 : “而顏稿, 記得有說審稿人是搞晶體-X-射線的.”

審稿都是匿名的,你上麵說法是怎麽推斷的?
喜洋洋2014 回複 悄悄話 非常贊同梁慎勤兄的評論!
通過這這件事我們也了解到潤濤博士除了有冷眼觀世界的銳利視覺,也有與世界頂級科研成果相類比的科研論文,這是非常了不起的人生,值得欽佩。
名利雖是過眼煙雲,但是名譽還是要維護的。自從「碰瓷」回覆之後,這個爭論己經不僅僅是科學的是非之爭,也是雙方的名譽之戰,爭戰的方式不限於文學城內外,爭戰的地點不止於中國美國。所以此爭不會停止此戰終會有結論。
嘎德 回複 悄悄話 回複 'ft' 的評論 : “閻用了這麽大的篇幅來質疑顏,顏不會不看的”。

要我來猜,小顏不光是看了老閻的質疑,包括你我的評論小顏也看了!

所以小顏你聽聽我的最佳建議:不回不回打死也不回,風頭自然會過去的,小顏你將來飛黃騰達吃香喝辣的時候不要忘記請我吃飯喲。
Dalidali 回複 悄悄話 回複 'blue6albion' 的評論.

張益唐的審稿是同行審同行.
而顏稿, 記得有說審稿人是搞晶體-X-射線的. 而閻-顏之爭是模型-機理. 請高手"科普"!

嘎德 回複 悄悄話 回複 'blue6albion' 的評論 : “為驗證張益唐證明的正確性,普林大教授燒了一理拜多的腦。”

說句實話,我很佩服數學界的實證求真精神!

老閻的生化界嘛就不好說啦,過幾年後我們看看結果就知道了。猜猜最有可能的是什麽?是不了了之沒有結果!
ft 回複 悄悄話 嘎德,我澄清一下關於政治家和科學家的評論。我指的是他/她們各自的理念而不是人際關係。科學家的理念最終可能會成為科研成果。對於這些成果,無論是抄的還是發明的都是像黑與白那麽分明。即使抄也要抄成功和認可的東西。基於這個前提,顏回應閻的質疑是很容易的,尤其作為一個生化專家。閻用了這麽大的篇幅來質疑顏,顏不會不看的,為何不回應。
閻的問題也不是刁難性的問題,就是要事實:引用的數據出自哪裏。
搞科研的人在讀有關論文時,通常也會根據作者引用的論文去進一步閱讀追根溯源,這是常識做法。這麽簡單直接的問題顏為何不回應呢。
blue6albion 回複 悄悄話 恰恰相反,為驗證張益唐證明的正確性,普林大教授燒了一理拜多的腦。

理清B=C,生化界大佬隻怕沉思半晌可以搞定。我就不信這些人裏沒人會覺得說真話是上選。
Dalidali 回複 悄悄話 回複 'blue6albion' 的評論 : "看好真相水落石出,大俠維權成功。"
----------------

非常難! 非常非常難!
除非顏以這項成果(或文章)獲得大獎如諾貝爾獎! 否則, 做做學術報告,提提職稱, 甚至評院士等等都很難引起轟動, 變成醜聞, 達到撤稿,道歉. 最大可能是不了了之.

Nature , Science,也沒那麽神聖. 早晚會被中國人玩壞!
想想當年宋祖英的維也娜金色大廳的演唱多麽了不起啊! 後來中國歌手成群結隊去金色大廳去演唱, 原來給錢就行啊!
可口可樂的"秘方", 國外的"專利"多麽神秘,多麽讓中國人仰視! 結果王立軍一年就搞了幾百個專利! 用某無毛的話說:"中國目前的專利比美國,日本,歐洲加起來還多"(大意). 原來也是給錢就行啊!
同樣, Nature , Science,也沒那麽神聖.早晚會被中國人玩壞! 指望Nature, Science,主持正義? 太難了!

也許這次不一樣! 兩個"YAN"! 這麽巧? 也許出來混, 這次真得還了!
Justness 回複 悄悄話 不去光明正大的地方僅在無人光顧的偏僻小巷討公道,光腚拉磨轉圈丟人。
嘎德 回複 悄悄話 回複 'blue6albion' 的評論 : “其實就是黑道也有良心發現”。

好,我就等著看德高望重的黑幫元老(自然雜誌)出來主持公道,把油麻地大佬(小顏)這樣占了中環(發現機理)而不給元朗小混混(聲稱最早到中環)抽成(引用老閻文章)的“騙吃騙喝”之輩繩之以法,鞭刑五百下,花枝亂顫......殘酷的現實是你我等不到那一天了!

人家油麻地大佬(小顏,混普林斯頓的)多有風光,元朗小混混(老閻,混哪個不起眼學校?)也就是在元朗穿著白衣服偶爾毆打黑衣人解解悶了(來博客隔岸鞭策)。

說起張益唐逆襲是有原因的,數學界證明對不對是一清二白的,是最不黑的幫派,老閻的生化界嘛我隻好嗬嗬了……
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 '雨女' 的評論 :
1. 我是指顏寧回答過閻的質疑, 不是說顏寧有新的質疑。
2。 顏寧看沒看過閻的文章,我覺得我直接回答了,我說不知道。 但假設她看了也無妨。

3 一個晶體的構象不容易推機理(不是不可能), 但是顏寧與其他人做了幾個類似的蛋白,每個蛋白做了兩三個構象的晶體結構。 這是現在標準的推機理的辦法。

blue6albion 回複 悄悄話 有人的地方必有政治是沒錯,可硬把學術界往黑幫上套也未免太以偏蓋全了。

總有人自以為什麽都看透了,什麽都是黑道白道陰謀陽謀。其實就是黑道也有良心發現,也可以有真善美,隻是相對難得些而已。

相信學術界講理的人多。張益堂的審稿人難道不是認理不認人?看好真相水落石出,大俠維權成功。
嘎德 回複 悄悄話 接著上麵的講。

小顏相當於混油麻地的黑幫,是大幫派,人多勢眾,地盤龐大,相互提攜引用文章。

老閻相當於是混元朗的黑幫,是邊緣地帶的小幫派,人少有誰也少,當然在黑道上沒有地位名氣,老閻文章引用的少也是沒辦法。

現在元朗小混混(老閻)想挑戰油麻地大佬(小顏),還去找老黑幫德高望眾的頭子(自然雜誌)討回公道,你覺得會有戲嗎?
嘎德 回複 悄悄話 接著上麵的講。

小顏相當於混油麻地的黑幫,是大幫派,人多勢眾,地盤龐大,相互提攜引用文章。

老閻相當於是混元朗的黑幫,是邊緣地帶的小幫派,人少有誰也少,當然在黑道上沒有地位名氣,老閻文章引用的少也是沒辦法。

現在元朗小混混(老閻)想挑戰油麻地大佬(小顏),還去找老黑幫德高望眾的頭子(自然雜誌)討回公道,你覺得會有戲嗎?
時不時來看看 回複 悄悄話 顏寧自詡新發現的蛋白質轉運進細胞膜的機理就是博主之前發現的,是剽竊。
博主果然不食言,給Nature及一些相關知名科學家寫了信說明這一事實,相信那些科學家判斷這個事實猶如判斷1+1=2。
這個求真過程本身就是科學的一個重要部分,結果也是可預見的:顏寧必將恥辱地跌下神壇。這在一定程度上也是對她的幫助,拿別人的不對,認錯改正並物歸原主才是正道。
嘎德 回複 悄悄話 回複 'ft' 的評論 : “科學家和政治家不能相提並論”

你象老閻一樣混跡過科學界的話,你就不會這麽天真了。

科學界比政治界還黑,科學界就象黑社會,也是需要拉山頭的!新來的混混(博士)先拜見老大(博導),老大先給你一條街道(科研課題)管管。小弟在街道上混的時候都要按黑幫老大的規矩辦事(要吹捧博導以前的工作),如果小弟以為自己了不起想獨立出來(不安博導思路做研究或推翻博導以前的理論),那肯定是被黑幫大卸八塊屍首不全(拿不到博士或不推薦工作,前不久大出風頭的數學家張益唐就是例子,當然張益唐後來算逆襲了,苦盡甘來自己混成了老大)。

小弟混成黑幫幹部後(當上tenure教授)還必須繼續給黑幫老大上供(引用主流文章),這樣老大才會叫你來參加黑幫大會(科學年會),在分贓的時候賜你一份(審批通過你的科研經費)。

你說,科研界黑不黑?
blue6albion 回複 悄悄話 某叔表現真輕浮低俗,怪不得被賣幫人數錢還自鳴得意。
雨女 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 在哪裏?我非常想看她是怎麽回答的?不是碰瓷那一次。彥寧有新的回答了嗎?

另外,你上次沒有直接回答我的問題。我問你:你覺得彥寧讀過潤濤閻的文章嗎?同樣的問題我也問了凡人。凡人回答我:肯定讀了,因為彥寧是一個很好的科學家。你的回答是:無論彥寧讀沒讀,都不需要引用潤濤閻。其實我隻需要知道,讀了,還是沒讀。你也許跟我一樣不知道。但是我猜她讀了。

最後我有一個新問題:對於一個蛋白質,如果隻做晶體結構,沒有機理部分。那麽他的意義是不是就像做DNA序列分析一樣。我們搞清楚了身體裏的所有DNA的序列。再原始一點,就是我們搞清楚了人體的結構。我們有搞清楚了DNA序列。現在我們又搞清楚了蛋白質的晶體結構。我們搞清楚了這麽多結構,序列以後的目的是什麽?

最近天氣炎熱,順祝夏安!





lilywanda 回複 悄悄話 @firstuncle: 你調侃得太過了, 老閻是認真的。對待學術科研嚴謹的態度是應該的。畢竟不是每個人都有天賦和毅力做科研的。
firstuncle 回複 悄悄話 老閆啊,我真有點同情你了。如果你沒有100%的把握扳倒對方,幹嘛撅著屁股給蹭你熱度的小蝦米機會?人老了健康第一,氣大傷身。寫寫小說,到世界各地轉轉多好啊。你反複糾結,不但心理受損,菊花還不斷被聞屁的騷擾何苦呢?
firstuncle 回複 悄悄話 老閆啊,我真有點同情你了。如果你沒有100%的把握扳倒對方,幹嘛撅著屁股給蹭你熱度的小蝦米機會?人老了健康第一,氣大傷身。寫寫小說,到世界各地轉轉多好啊。你反複糾結,不但心理受損,菊花還不斷被聞屁的騷擾何苦呢?
lilywanda 回複 悄悄話 SwiperTheFox 是顏的托;fanreninus 是趁機提高自己的關注度。
ft 回複 悄悄話 回複Wtp003,科學家和政治家不能相提並論。政治是一個模糊和黑箱作業的東東,此處不是討論政治,本人止步於此。而科學的東東大多和黑與白一樣分明。如果一個享譽科學界的科學家不能用科學的態度和言辭來回答質疑,扔出一句"碰瓷",這難道不是和市井罵街一樣嗎。
如果除了回答碰瓷外,她的另一個選項就是像神秘的木大人一樣一問三不知,哈哈,這質疑就更大了。
Wtp003 回複 悄悄話 預言一下若真有一天真相出來,顏的experiment 就是在閆的基礎上designed.
理由?
走過Maze的應該知道最困難的是什麽?若有人指明方向意味著什麽?
顏的工作可以說做的又快又好,不是一般的快可以說整體工作出奇的順利沒什麽彎路,隻能有二個可能;
1.顏是天才,不僅這個是這樣,其它工作也差不多。
2.前人工作就是指路明燈
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'Stegy223' 的評論 :

這個我也早已回答過了: 四象圖不是顏寧的發明, 顏寧也沒說四象是自己的發明。 在四象的基礎上加上門閂與大門是顏寧對機理的貢獻。

顏寧傑出的原因不是因這四象圖,而是結晶Glut
Stegy223 回複 悄悄話 有一個事實好象還沒人提及。俺也是最近才讀到,感腳應該拿出來,至於如何解讀恐怕仍會是仁者見仁,智者見智。小顏2013 三月己發一篇綜述。“Structural advances for the major facilitator superfamily (MFS) transporters”. Trends in Biochemical Sciences 2013. 38:151-159. 文中一節專門討論了"Alternating Access". 圖3a畫了四象循環圖 (名為schematic diagram to illustrate the alternating acc as mechanism)。這是MSF大家庭的共同屬性之一,當然包括了GLUT. Nature2014'工作模型中的四象循環圖實非首次發行的驚豔之作。
Wtp003 回複 悄悄話 “ft 發表評論於 2019-07-30 04:32:11
當初用"碰瓷"來回答實在是太low了,真有損於她在科學界享譽的形象。有理說理,科學家不更應如此嗎。”

不用”碰瓷”回答用什麽回答呢?真要講道理就隻能像Mueller 一樣一問三不知了
https://m.youtube.com/watch?v=lYgKrDMPHm8
當被問什麽時候知道用的政治對手提供的假材料?隻好裝糊塗,可惜不知道”碰瓷”一詞
同樣當被問到什麽時候認識到通俄們根本不存在(因為第一天就知道),怎麽回答?不回答是唯一選擇
Stegy223 回複 悄悄話 回複'Tang71'的評論 :
2. 實指 Based on our structural analysis and (our as well as others) published biochemical data. 那樣的話此處應該列出具體引文來。
3. Based on our structural analysis and (others) published biochemical data. 此處應該列出具體引文來。
Stegy223 回複 悄悄話 回複'Tang71'的評論:
關於“Based on our structural analysis and published biochemical data”目前己知有數種解讀法:
1. 實指 Based on our structural analysis and (our) published biochemical data.
a) 按英文很好的網友JessAB 第二個“our” 就是多餘的了,去掉就是了。
b) SwipeTheFox有篇博文指出過這biochemical data 指Nature2012'中關於ICH 的突變和生化測定實驗結果。ICH 確為工作模型中的第二點。如果完全是這樣,Nature2014在此處應列出自己的Nature2012( 前麵己引了,不會增加引文數目)。
ft 回複 悄悄話 當初用"碰瓷"來回答實在是太low了,真有損於她在科學界享譽的形象。有理說理,科學家不更應如此嗎。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'ft' 的評論 :
顏寧已經回答過了, 不止一次。 時間用來做研究,比用在澄清已經澄清過的事實更有用
Tang71 回複 悄悄話 Maybe the language was meant to be “On the basis of our ... published biochemical data ... ...”.
ft 回複 悄悄話 回複SwiperTheFox,即使閻的結果與顏的不是最相關的,閻質疑了顏這麽多次,顏至少可以回答閻的問題。如此視而不見豈更增加了別人對她的質疑。
ft 回複 悄悄話 Fanreninus和閻是一個政治戰壕裏的戰友,尊敬你們對顏閻有關科研結果一絲不苟和認真爭辯的態度。

此處調侃一下。因為壇子裏也需要輕鬆的氣氛啊:)
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'ft' 的評論 :
老閻的論證很核心的內容是顏寧與他做的結果一樣,所以用客觀事實比較他們的結果非常必要。

退很多步講, 由於雜誌對引用數量的限製,隻能引最相關的。Muckler 2009一文以及前麵發的11篇都比老閻的更相關。 Mueckler排不上號,老閻的更排不上。
ft 回複 悄悄話 認同梁慎勤的評論。我堅信顏在寫論文甚至研究過程中絕對做了大量的有關文獻檢索和review,這是所有科學家們的必經之路。基於這些review,在她發布的論文裏,完全可以一筆點到和帶過她是在那個基礎上添磚加瓦並有所創新的,這是很容易做到的也是對有關科學家的尊重。顏顯然是在有意淡化和不提前人的研究成果。這件事讓時間來說話吧。
有人反複比較顏和閻的研究結果有多少不同,這是毫無意義的。每一篇論文都有自己的創新,它的創新都是在前人研究的基礎上創新的而且無一例外,空中樓閣是不存在的。顏至少可以回答閻的質疑:她已發表的生化數據來自哪裏,是自己的還是引用別人的還是在別人的基礎上的進一步發展。
Dalidali 回複 悄悄話 回複 '梁慎勤' 的評論 : "我突然有一個感慨:搞清楚一件事情的真相真的很不容易。"!
-----------------

沒錯! 記得閻先生以前就寫過一篇"夢鴿要還原真相是多麽艱難"(大意)的文章或短評.

但,"出來混總是要還的"! 覺得是上帝就設計了兩個,"YAN"和"YAN".
唐爽粉絲團 回複 悄悄話 老閻懟小顏,肯定有點兒鹹。
sensei321 回複 悄悄話 標題黨!實錘呢?那句話你拿來當實錘,貽笑大方。剽竊可是大事,小顏可要告你誹謗的。不過,這正是你想要達到的目的:碰瓷。借小顏來揚名老閆。嚴重懷疑你的人品。
wodedongxi 回複 悄悄話 回複 '梁慎勤' 的評論 : 這是我看到的最好的回複, 我讚同. with history the final judge of our deeds. 時間會給兩人一個公道的.
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 你在讀了大閻的故事(一)後,不是反複表示“看了這麽多文獻,沒有一篇文獻用模型一詞來提閻的兩篇論文”嗎?怎麽又說大閻模型了,能不能不要顛三倒四,自打嘴巴。
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 又開始轉移話題,看過就說看過,沒有就說沒有。不敢回答嗎?
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'Nekono_88' 的評論 :

我評價的是:大閻在“潤濤閻的科學故事(一)Yan-Maloney模型“一文中他自己描述的模型。

請問我們是不是可以認為: 大閻在“潤濤閻的科學故事(一)Yan-Maloney模型“裏準確地描述了Yan Maloney模型?

如果不準確的話,那麽的確有必要拿原文來讀一讀。
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 你就簡單一句話,你看沒看過大閻1993的全文?你已經對大閻的模型發了這多了的議論了。如果還是沒看過,是不是有點搞笑?
山丘- 回複 悄悄話 回複 '梁慎勤' 的評論 : 這就是“stand for yourself” 的意義所在 一方麵為己尋求公道 另一方麵為別人維護創造一個好的社會環境。
引一個別人說的:It's important to stand up for yourself because if something is wrong it should be known and brought to the light. It's good for the soul because no-one should live the wrong. Standing up to anything that's wrong is showing strength in the character. By doing so creating a better life for yourself and others.
五穀不分 回複 悄悄話 回複 '梁慎勤' 的評論 : 認同!
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'Nekono_88' 的評論 :

既然你提我讀他老師2011年那篇文章, 現在就告訴你為什麽要讀這一篇. 這一篇用了老閻同樣的方法做了第11個跨膜區的研究.

1. 這篇文章裏, 他老師兩次引用了閻Cell這篇文章: 第一次在介紹閻和另一組做的實驗時說: has provided a way to probe the functional and structural signifcance of specific amino acid residues in LacY, UhpT, and the oxalate.... 第二次在討論中說的是細節, 不必在此詳談。

重點是: 沒有評價說,根據閻潤濤發明了Yan/Maloney模型.

2. 這篇文章與閻1995年那篇一樣, 做了二十幾個突變,如果象閻說的那樣他1993年就把整個蛋白455個氨基酸都突變了,那1995與2011兩篇文章就不用發了。
梁慎勤 回複 悄悄話 我突然有一個感慨:搞清楚一件事情的真相真的很不容易。閻顏事件是有白紙黑字的文章的,從原則上來說,我們隻要從文章本身出發進行判斷就可以了。然而,就目前的爭論而言,似乎人們對文章內容和字句的理解也是有所不同的。所以,我覺得這件事情恐怕在短時間內很難有一個明確的結論,很可能在兩三年內都不會有一個明確的結論。不過長期來看,如果閻顏事件所涉及的研究成果的確非常重要的話,那麽曆史一定會給出一個明確的結論,而且這個結論一定是實事求是的。在網絡不發達的時期,潤濤閻基本上沒有任何維權的可能。而現如今網絡已經足夠發達,加上潤濤閻已有的人氣,從他實名指控顏寧有學術不端行為的那一天起,曆史就一定會給這個指控一個說法:要麽潤濤閻完全有理,要麽潤濤閻完全無理,要麽潤濤閻有部分道理,而且這一部分道理也會被厘清。有人說潤濤閻不應該在博客中對顏寧進行指控,而我覺得這是潤濤閻的一個選擇,我們要尊重他的選擇。潤濤閻在做這個選擇的時候,其實也承擔了很大的風險,因為如果他的指控失實的話,那麽將來顏寧是可以告他誹謗的,搞不好潤濤閻要付出巨額經濟賠償。我想潤濤閻也是明白這樣的風險的。不過不論這件事的結果如何,這件事本身就有意義:做學術研究,在聲稱自己有一個重大成果之前,一定要好好查一查前人的工作成果,盡量避免有意或者無意地誇大自己的貢獻,當然更不能將前人的任何工作成果占為己有,不可存任何僥幸的心理。
五穀不分 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 謝謝你的回複。我記得閻先生說過是他和他的老板提出了葡萄糖傳輸喇叭口模型並用實驗證明了這個機製。這個應該是非常了不起的。
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論我把你5月23日和網友 -達姆TU辯論時說的話,貼出來。

? 你所有的信息都是從閻的博客得到的,兼聽則明,你先讀懂了顏三篇論文再來發表意見。我是看了閻的所有博客和閻和他老師的兩篇論文的。  -SwiperTheFox- ♂ (0 bytes) (10 reads) 05/23/2019 postreply 07:11:48

5月裏就說“看了閻的所有博客和閻和他老師的兩篇論文的”,7月裏又說,隻看了摘要,你有誠信嗎?網友達姆TU表揚你“戲精”,看來還是合適。不過話說來,你也有自知之明,也自稱過“街鼠”。不好意思,打擾了,祝夏安。

對我以上的提問你的回答很奇葩,你說你讀了1995大閻的文章和他老師2011年的一篇論文, 加起來兩篇。但是我們都知道大閻的摸型是在1993和1995的兩篇文章裏提出來的,為了支持自已的說法,這裏你又來個移花接木。
Zucker 回複 悄悄話 最近在烏友之鄉上看到一篇非常長的文章叫《毛澤東與文革大起底》,覺得寫的非常好推論非常準確靠譜,把我對建國以後到文革結束所有的疑惑尤其是林彪事件的疑問全部有了答案,真不象烏友之鄉風格的文章,不知閻兄是否看過有無看法?
山丘- 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 你後麵接下來的第三點到第六點我的理解就是:閻是首創 後來的後人繼續進一步驗證了這一機理
山丘- 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 再接著一條條說說 這些其實以前也都說過 老閻也都給過詳細的詳細。
1966年Jardetzky總結了前人的研究, 提出/“標準化”了轉運蛋白的Alternate Accessing Model (AAM)。
這個是鈉離子泵機理 主體講的是鈉離子如何在膜上轉運的 與大分子糖不同 因為糖與小分子不同 需要糖轉運載體的協助 在閻糖轉運載體機理模型出來以前 誰知道這兩者機理的相似性?這個是靠閻做了大量的分子生物生化實驗做出來的 是首創
2。從1966年到1992年, 為數不少的科學家為這個模型提供了大量動力學實驗的證據, 其中包括紅細胞葡萄糖轉運蛋白。 
對的 前人做了大量的工作 不過還是回到閻問質的重點來:分子生物生化實驗數據!!! 動力學實驗證據是動力學實驗證據 兩碼事 還是代替不了
SwiperTheFox 回複 悄悄話
回複 'Keyo' 的評論 :

對不起,我上一個回答沒有答到要點上:做晶體的不是看不起生化實驗。  顏三篇與Iancu這篇都做了生化實驗。並且Iancu在結果一節裏說: The glucose-binding site was identified by comparison with the XylE structure (13--顏寧2012) and was corroborated by biochemical findings with GLUT1 (31-33--即Mueckler從1992 到2009年的三篇生化實驗文章)。

小顏引Iancu的主要原因是討論中討論:Symporter與 uniporter轉運機製的不同,而引的證據也是Iancu 的(和顏寧自己的)生化實驗:。。。the mutation D27N in XylE or D22N in GlcP led to abrogation of proton-dependent active symport, but not the counterflow activity.

晶體結構用不同構象提出的蛋白質的運作機理,的確是生物化學無法比擬的。 比如Forrest 2011 文中幾次提到, 僅舉一例:Currently, the most stimulating contribution to our understanding of secondary transport is the fast growing amount of structural data on transport proteins. This impact is particularly significant when crystal structure are available for a given transporter in different states.


=======================================================================================
有點好奇:Mueckler組和 Iancu組都是做晶體結構的嗎?我覺得Iancu組是做晶體結構的,所以得到顏寧引用。讀過並掌握論文內容的可做解答。

雖然不能令人信服,對晶體解構領域以外的生化實驗結論不屑一顧很可能是顏寧被困的原因。目前看來各種洗地並不能為顏解套。
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 你在回複 '山丘-' 的評論是說:
“我沒有看不順來老閻,從沒有攻擊他的個人。 在這裏隻討論科學事實, 不知道什麽叫挑釁。” 然後在7月25日你又說,“閻潤濤把這麽多科學家幾十年來辛苦工作"據為己有", 說自己第一個闡述了葡萄糖轉運蛋白機理. 欺世盜名, "偷竊"別人成果的不是顏寧, 而是閻潤濤.”,你這難道不是攻擊他的個人?
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 在大閻7月8日帖子“顏寧博士無法反駁的第五個事實”下麵,你有反複發言,我相信你是看了帖子再發言的。帖子中大閻清清楚楚寫著“在葡萄糖載體領域,Yan/Maloney 模型早被廣泛接受。比如,Dr. Milton Saier, Jr. 在他長達34頁的綜述裏給出Yan/Maloney的發現是該家族(顏寧團隊與Yan/Maloney 研究的載體家族)“最詳盡的動態模型”,英文原話: “The best characterized members of the family are UhpT and GlpT, both of E. coli, for which detailed topological models have been presented (29, 90, 91). 其中第90,91就是我們分別發表的《細胞》與《美國科學院院報》論文”。但是你選擇是無視,或裝看不見,在7月15日的帖子“轉運蛋白模型一日遊 (五)總結”的最初版本中,我和你討論,你說“目前看過的文獻來看, Yan_Maloney模型隻出現在閻的博客裏,沒有出現在科學雜誌裏,就是說在科學界不存在”。我隻好問你“‘The best characterized members of the family are UhpT and GlpT, both of E. coli, for which detailed topological models have been presented (29, 90, 91).’ 這是被引用了1281次的綜述“Major facilitator superfamily(1998)”文章裏的原話。其中文獻90, 91分別是大閻1993和1995的文章。隊友閣下,在這裏"models"是啥意思?”。我再說“這就是你‘看了這麽多文獻,沒有一篇文獻用模型一詞來提閻的兩篇論文’。反證”,到這時你才無奈地承認有大閻的模型。
山丘- 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 不好意思就你下麵的邏輯關係反駁你一下 你說“Iancu在顏寧2012做的一個細菌糖蛋白晶體結構以後, 做的是另一個細菌的葡萄糖糖蛋白晶體結構, 這是與顏寧的工作直接相關的,也被引了” 這跟閻問質的沒有關係 閻不做晶體結構 做的是生化機理模型 顏引多少晶體結構的文章都替代不了研究工作機理模型的生化數據
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 '五穀不分' 的評論 :

在問為何老閻的貢獻沒有得到重視之前, 要先問老閻的貢獻到底是什麽?

我為了這件事, 前後細讀了5篇文章,瀏覽了不下二十篇的文章,其中有不少引了老閻的。 覺得給老閻工作的正確評價是:

老閻對一個跨膜區的氨基酸“窮舉”的辦法, 第一給轉運蛋白的Alternating Access Model提供了分子生物學的證據。

這個評價是Mueckler 1999 年的文章裏給的。 我覺得比較中肯,但也同時說明Mueckler給老閻應有的肯定,但同時也說明,模型不是老閻發明的。

至於老閻是否應該獲得更大的評價? 給讀者一點非常粗糙的曆史:
1。1966年Jardetzky總結了前人的研究, 提出/“標準化”了轉運蛋白的Alternate Accessing Model (AAM)。
2。從1966年到1992年, 為數不少的科學家為這個模型提供了大量動力學實驗的證據, 其中包括紅細胞葡萄糖轉運蛋白。 
3。1993和1995年閻潤濤發表了他的兩篇論文, 用一個細菌的葡萄糖轉運蛋白的一個跨膜區為AAM提供了分子生物學證據。
4。從1999到2009,Mueckler用同樣的方法研究了人體葡萄糖轉運蛋白12個跨膜區的拓撲結構與底物結合位點。 
5。從2006到2013,至少四個實驗室為MFS家族的轉運蛋白提供了晶體結構,並推動了機理的研究。 這四個實驗室分別是:Kaback, Forrester, Wang, 顏寧, 
6。2014年,顏寧第一個結晶了人體葡萄糖蛋白, 並進一步闡述了機理。 

老閻的貢獻得到的承認也許稍顯不夠,原因之一是他的摘要沒有象Mueckler給他的評價一樣說出“我為AAM第一個提供了分子生物學證據",  而背後的原因也許是(象老泉說的),他老板當時不認Jardetzky的AAM.

但是老閻的貢獻遠沒有他說的那麽大。 一個構象的晶體是死的,但多個構象的晶體推的機理原比他的實驗詳細得多。 最重要的是,他第一篇裏寫的“喇叭口”專利是Jardetzky的。





========================================================================
回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 你好像是這行的。說說為何老閻的貢獻沒有被重視。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'Keyo' 的評論 :

Mueckler做的不是晶體, 用的是跟老閻一樣的方法,也給了老閻credit.

Iancu在顏寧2012做的一個細菌糖蛋白晶體結構以後, 做的是另一個細菌的葡萄糖糖蛋白晶體結構, 這是與顏寧的工作直接相關的,也被引了。
Keyo 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : "Mueckler 做的是glut,顏寧做的跟他更近。 Iancu引了Mueckler, 顏寧引了Iancu. "

有點好奇:Mueckler組和 Iancu組都是做晶體結構的嗎?我覺得Iancu組是做晶體結構的,所以得到顏寧引用。讀過並掌握論文內容的可做解答。

雖然不能令人信服,對晶體解構領域以外的生化實驗結論不屑一顧很可能是顏寧被困的原因。目前看來各種洗地並不能為顏解套。
Wtp003 回複 悄悄話 回複 '不言有罪' 的評論 :
”這 Nature 雜誌的editor 們也夠糊塗的。”

editor多半是搞結構。
Wtp003 回複 悄悄話 回複 'Nekono_88' 的評論 :
挺顏需要用謊言本身不是很說明問題嗎?
不言有罪 回複 悄悄話 看來,小顏確實有些做賊心虛。那麽重要的“published biochemical data”,居然不給出出處?
這 Nature 雜誌的editor 們也夠糊塗的。
Wtp003 回複 悄悄話 對真關心這事無立場同時不具備專業知識的人一個建議;
誰能沒有個親朋好友沒直接的間接的找個搞生物作用機製(糖轉運最好隻要是關於作用機製的都行)
私底下!
問一下看法。

fonsony 回複 悄悄話 古狗的翻譯,?
Wtp003 回複 悄悄話 我前麵提到
”隻要不是別有用心,挺顏的對具體爭論問題的(scientific)實質完全無idea.”
為什麽這麽說,因為看到一些寫慱文的好似知道事情或是分析蛋白結構具體位置或是什麽什麽其他模型怎麽怎麽樣,可是都沒got the point,不知道爭論事情的本質是什麽。下麵就說二點為了好理解可能不夠精確但絕對(要點上)正確。
1。做蛋白結構,用的技術無創新能發Nature?門都沒有,(早幾十年可能可以),顏的文章能發是因為其Biological significance!
2.什麽是Biological significance? 第一一個發現糖轉運機製轉which actually is excatly the same 老閆早就發表過了。事情本質就是這麽簡單明了。
這裏多說二句,”第一”很關鍵,若沒這第一估計發自然也難。,若顏不張揚這個估計也沒現在這熱鬧。有人否讓這個。除了宣傳上這是亮點(顏不說寫文章怎麽知道)而且nature論文本身也是這個意思。另一個常見挺顏的是什麽一個用細菌一個人材料...隻好說不????專業一時半會也教不會。
Nekono_88 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 我就知道你會跳出來,說生化資料是小顏自己做的。你已經其它地方說過多次了。估計你到現在也沒有讀過大閻1993的全文,但是你卻發了成百上千的質疑大閻的機理模型。一開始你說沒有任何文獻承認大閻的模型,當我指出你假裝看不見時,給你看文獻原文時,你又改口說是,拓撲模型,不是機理模型。大閻明明白白告訴你做了455突變,你又選擇無視,在後來貼子說大閻隻做二十幾突變。我說在1993年的論文中還有多個突變的詳細說明。你又說你的“哥的不好”猜想隻根據1995的文章和1993的文章摘要來推測。你說小顏用自已的生化數據,也是你的“哥的不好”猜想。看看你,明明看到了,讀到了,為了狡辯,你可以矢口否認。你說過的話都掛在網上,看到你這樣,全然不顧前麵自己說過的話,隻為了找理由支持自己後來說法,可翻手為雲,覆手為雨。真不知道你平日和周圍的人如何相處。
五穀不分 回複 悄悄話 如果小嚴有數據,她不提高文獻出處是不是認為行業的人都知道,所以不必寫明出處?
五穀不分 回複 悄悄話 回複 'SwiperTheFox' 的評論 : 你好像是這行的。說說為何老閻的貢獻沒有被重視。
Fanreninus 回複 悄悄話 大閻,恭喜又出新文了!不過這次好像也沒有新證或新意,是想轉換一下焦點吧?我有話說,請看拙文,一條條回複您那幾點,借光了,謝謝了!
http://blog.wenxuecity.com/myblog/73963/201907/33278.html
warara 回複 悄悄話 好,接著幹仗老川能耳根子清靜幾天
SwiperTheFox 回複 悄悄話 老閻還在追這件是事? mueckler從1999到2009發了12篇論文,用的是你的方法,。1999年兩篇跟你更接近,可以說結果跟你“一樣”,也引了你。 2004後來也不引你了。

你做的是UphT。 Mueckler 做的是glut,顏寧做的跟他更近。 Iancu引了Mueckler, 顏寧引了Iancu. 你隻做了一個跨膜區的拓撲。 顏寧做了與其他實驗室做了三個構象的晶體,推理哪些跨膜區中的哪些殘基礎與哪些跨膜區的哪些殘基的相互作用,實現AAM. 這些結果你文章裏有嗎?


GoBucks! 回複 悄悄話 讓中國調查?太搞笑了。可能嗎?方舟子有可能,給他吧。

看了審稿很馬虎,你說的地方的確應該注明來處。支持你!總感覺這個顏寧不大靠譜。
Wtp003 回複 悄悄話 “顏寧又不是第一次寫科學論文,非常清楚用“發表過的生化資料”以推理出自己的結論時必須給出該“生化資料”來自何處”;不同的思路。

“雜誌對參考文獻的總數限製不是剽竊他人成果的理由,因為顏寧可以減少自己論文的引用。”
據說自然雜誌有規定引用文獻最多50篇,若沒記錯那篇論文引用的文獻有60多篇。
Wtp003 回複 悄悄話 自然雜誌是完全沒有回應還是沒有結論?
凡是對具體(專業)問題有基本了解而且做過科研的,這事再明顯不過。隻要不是別有用心,挺顏的對具體爭論問題的(scientific)實質完全無idea.
嘎德 回複 悄悄話 回複 'smithmaella' 的評論 : “老閆您要不要招方舟子入隊?”

你這不是害老閻嗎?方舟子不是被人打過了嗎?老閻這把年紀經不起摔打了,放過老閻吧!

老閻“事業有成”,網上有一大群閻迷大媽大叔,子女也很有出息,好好地怡享天年,犯得著和方舟子這樣的“被打人士”為伍嗎?
wodedongxi 回複 悄悄話 回複 'smithmaella' 的評論 : 找方舟子也許是個好辦法, 畢竟這個博客不是做科研討論的, 受眾也有限. 找方舟子可以引起更大的討論, 倒逼彥寧回複, 倒逼相關機構做調查.
嘎德 回複 悄悄話 回複 '危言' 的評論 : “如果她的文章真有問題,首先應該找《自然》雜誌”

你太天真了,老閻當然是寫信給自然雜誌了,要求自然雜誌當包青天大人,主持公道,吧剽竊犯繩之以法,嚴懲不貸……

哦等等,你真以為自然雜誌要趟這灘渾水?你太天真了!自然雜誌有各種方法拖延時間搗糨糊打太極磨洋工推卸責任等等等等......老閻等到黃花菜都涼了也是白搭……
smithmaella 回複 悄悄話 老閆您要不要招方舟子入隊?他幹過寧顏,可惜,他一人力量太soft,所以不了了之。現在證據看起來非常充分確實。清華大學人渣多了去了。希寧顏不是。
五穀不分 回複 悄悄話 能不能說一下為何您的數據和提出的運輸模型為何沒有引起關注?這個published biochemical data聽上去就是您的唯一貢獻。引用數據出處是必須的,不是自己的東西為何要往自己身上挪或故意回避。利欲熏心。太丟人了。
wodedongxi 回複 悄悄話 回複 '危言' 的評論 : 這和打假有啥關係? 連博主自己都不懷疑彥寧的發現, 博主氣的是彥寧忽視了他的credit, 沒有引用博主的文章, 沒有承認博主是第一個發現這個模型的人. 這個屬於學術不嚴謹的範疇, 不是作假.
危言 回複 悄悄話 政府本身不是專家,政府調查也要專業領域的權威發言之後才可能開展。《自然》雜誌發表她的文章,就說明她的研究被專業權威認可,如果要否定她的文章,也要先從《自然》雜誌開始。曆史上,被專業雜誌打假撤稿的文章很多。如果她的文章真有問題,首先應該找《自然》雜誌。
wodedongxi 回複 悄悄話 不知道彥寧看不看這個博客. 根據博主的表述, 我看她頂多是學術不嚴謹, 談不上剽竊. 學術屆這種不嚴謹多的很, 最終不是剽竊與否的問題, 而是這個credit的歸屬問題. 比如有一天諾獎要發給這個結構, 這個獎和credit該給誰的問題.
嘎德 回複 悄悄話 老閻窮追不舍,一定要討個說法,可以理解。

小顏那邊呢?是完全不理不睬嗎?

不過小顏打死也不回是最高境界,當初“碰瓷”這樣簡單粗暴的回複是下下策。不回不回打死也不回,估計老閻也沒有辦法:科研界是以搗糨糊為己任的,老閻死心吧……

小顏挺過這段風頭後隻會更風光,吃香喝辣,前途無量,我先祝賀小顏了!
潤濤閻 回複 悄悄話 顏寧的論文是中國政府部門資助的研究項目,不是普林斯頓大學資助的。

美國專家我在慢慢找,聯係。這不著急。倒是中國政府更應該調查她對科學的態度,對數以萬計的媒體報道根據顏寧發表的論文造新藥負責。我退休了,離開了科學界,又不投資造藥,沒損失。

不能因為她離開了中國,中國投資人或政府部門投資造新藥就停止了。政府的錢,可以用於精準扶貧。私人企業的錢可以投資其它領域。過幾年後,看看造新藥的結果是怎樣的。不是因為她到美國了,就跟中國投資人沒關係了。去百度搜索,就會發現那是多麽的熱門。
潤濤閻 回複 悄悄話 她找不到任何葡萄糖載體機理模型的生化數據,去讀LacY的文章,依然堅持衍射結晶蛋白得出的結論是“假說”,英文原文:“possible happens"。她的回複隻能找到的生化數據是1966年的鈉離子泵,那時候基因克隆還沒開始呢,基因克隆始於1973年。連任何載體分子的氨基酸構成都還不清楚,如何給她生化數據?在這領域的權威都找不到其它生化數據幫助證明載體的動態機理。她如果找到了,那她就必須給出參考文獻,否則就是剽竊人家的成果。

三星狀告蘋果剽竊了三星的知識產權,就因為除了三星外還沒有他人申請了那個專利的知識產權。蘋果律師再怎麽反駁也無效。科學比公司專利更黑白分明多了。公司專利往往可以用錢解決,而科學則不能。黑就是黑,白就是白。最後科學界都會一清二楚。
危言 回複 悄悄話 再說,顏寧現在在普利斯頓大學,又剛當選美國院士,要打假也要找美國。而且,科學界打假要在正規雜誌上投稿,由專家內行來定,網上寫作是不算數的。
actigraph 回複 悄悄話 biochemical data是生化數據,不是生化資料,資料範圍更廣,可以包括數據,信息和知識。利用公開數據並不構成剽竊,當然要注明引用。隻是憑這一點就指責剽竊,沒有說服力。
playnice 回複 悄悄話 打假要支持。
達姆TU 回複 悄悄話 回複 'iced91030' 的評論 : 白癡,科學上求真,就得追到底,跟祥林嫂無關。關於祥林嫂,再免費教你幾句。祥林嫂是封建禮教的的受害者,她受 夠了命運的欺辱,心裏的苦楚不靠絮絮叨叨,你給她找找第二條路?
blue6albion 回複 悄悄話 相信大俠的人品和做事的分寸:能拋出剽竊和B=C這樣的狠話,肯定是胸有成竹了。樂見真相最後水落石出。
達姆TU 回複 悄悄話 你這類白癡能不能少發言?
是不是你老婆給你戴綠帽子,你老母被強奸你也let go? 哪怕這兩件事你都let go,這件事也不能let go,科學上抄襲剽竊比你老婆給你戴綠帽子和你老母被強奸更嚴重,科學上就得求真,白癡。

—————————————-
iced91030 發表評論於 2019-07-29 13:43:39
Let it go, man. Just let it go.

You are getting to be a "祥林嫂" now.
滿池嬌 回複 悄悄話 騙子 真的是太多了。
遍野無塵 回複 悄悄話 建議去找在這個領域的同行評論這事, 除了《自然》以外。
不僅僅是找那些讚揚過她的科學家(估計不會回答你。)
潤濤閻 回複 悄悄話 我是最不需要著急的。
求真,需要時間。盡量把支持她的大科學家們都查出來,讓他們幫她的忙找到反駁我的理由。
鄧小平厲害不?他把英明領袖華主席變成不英明還需要好幾年呢。

最需要調查真相的是中國政府。我不知道有沒有投資人根據宣傳而投資造新藥?如果早就有,那是否血本無歸了?要知道,即使那些聰明的投資人也是科盲,也有崇拜基因,說不定下大賭注造新藥,最後血本無歸而跳樓。對我來說,我又不投資造新藥,沒影響。

搜不出來她發表過的葡萄糖載體機理的生化資料論文,可搜索引擎也不是絲毫不差的。需要繼續搜。

支持她的大科學家們也會搜索的。萬一發表在PubMed都不列入的雜誌上了呢?據一位印度人跟我說印度就有私人科學雜誌不被世界上的任何搜索搜到。詳情不知。美國有私人大學沒房子就一名字。信不信由你。這事真有。這世界什麽事都可能有例外,所以,我們不能著急。說不定幫她洗地的就能搜索到她發表過的葡萄糖載體的生化資料論文。再過兩三年,就可能接近真相大白了。你去百度搜索一下顏寧論文造新藥,你會震驚那是多麽熱的熱門啊。到時候就知道結果都是怎樣的了。曆史,有其自身的發展規律,我們個人最多是看熱鬧而已。如果她膽敢剽竊的指控屬實,那她的科學態度是靠不住的。我才不著急呢。
iced91030 回複 悄悄話 Let it go, man. Just let it go.

You are getting to be a "祥林嫂" now.
危言 回複 悄悄話 On the basis of our structural analysis and published biochemical data, we propose a working model for GLUT1
使用公開的數據構造一個模型,模型才是她們的研究成果,為什麽說這是剽竊呢?
lin13590 回複 悄悄話 確實在“published biochemical data”處沒給出文獻索引確實有點不可思議,作為嚴謹科學家不管文獻是別人的還是自己的都應該給出索引。
wodedongxi 回複 悄悄話 博主你這事也有幾個月沒解決了吧. 這事說實話, 外行也不好評價對錯. 你在博客這裏說, 也很難得到解決. 我建議你投訴給清華大學和普林斯頓大學, 國內的基金委隻怕也不會真正有興趣去處理. 投訴給大學, 他們應該會組個調查組的, 找幾個小同行, 最後給你和彥寧一個公正.
遠在他鄉1997 回複 悄悄話 看過老閆幾乎所有的博文。堅定支持老閻打假,相信老閻一定能拿回公道。
[1]
[2]
[3]
[4]
[5]
[>>]
[尾頁]
登錄後才可評論.