統計結果顯示，浙江大學2006年度被SCIE收錄三類論文達3034篇，從2005年的全國高校第二位躍居第一位；EI收錄論文2760篇，ISTP收錄論文1432篇，CSTPCD收錄國內論文數6952篇，均居全國高校第三位。SCI論文被引2692篇6615次，從全國高校第五位上升到第三位； SCI10年累積被引13490篇43111次，從全國高校第三位上升到第二位；國內論文被引17789次，居全國高校第一位。MEDLINE收錄論文 1420篇，居全國高校第一位；SSCI收錄論文20篇，居全國高校第四位。浙大醫學院附屬第一醫院被SCIE收錄三類論文74篇，在全國醫療機構中居第六位，附屬第二醫院被SCIE收錄三類論文64篇，在全國醫療機構中居第九位。
浙大共有9個學科進入十大學科全國SCIE收錄論文高產機構前20名。其中，化學和生物學科列第一位，數學、醫學和農學學科列第二位，環境學科列第三位，材料學科列第四位，物理學科列第六位，地科學科列第十六位