CoV-2019 是實驗室泄露出來的說法沒有根據 (zt自賽先生)

評論:CoV-2019 是實驗室泄露出來的說法沒有根據

 

撰文 | 項焰(美國德克薩斯州立大學聖安東尼奧醫學中心教授)

 

石正麗帶領的團隊最近在《自然》上發表了一篇文章,描述了他們在武漢肺炎病人上發現一種新的冠狀病毒(nCoV-2019)的過程和分析。他們從五個病人的體內得到了病毒的全測序,並拿他們和已知的病毒序列進行了比較,發現是一種新的病毒。

 

這個新病毒和一種蝙蝠冠狀病毒 RaTG13 在一個短的區域有高序列同源性。RaTG13 是石正麗他們幾年前在雲南省的蝙蝠中檢測到的,但他們在此之前並沒有 RaTG13 的活病毒和全序列。於是他們從保存的 RNA 樣品裏測了 RaTG13 的全序列,發現 RaTG13 和 nCoV-2019 的全基因組序列有 96.2%的同源性,共有近 1100 個堿基的差異。

 

結合其他冠狀病毒的假定突變率估計,RaTG13 和 nCoV-2019 這兩種病毒可能在 25 到 65 年前有一個共同的祖先。這表明這兩種病毒是近親。相比之下, SARS 病毒和 2019-nCoV 有約80%的全基因組序列同源性,是更遠的親戚。CoV-2019 是一個從來沒見過的新病毒,在實驗室目前也沒有和 CoV-2019 最接近的蝙蝠冠狀病毒 RaTG13 的活病毒,說 CoV-2019 是實驗室泄露出來的是沒有根據的。

 

石正麗團隊為什麽要研究動物上的病毒呢?因為要有效防止像 SARS一樣的新發傳染病,就應該研究 SARS 病毒到底從哪來,還有沒有別的病毒會從動物上侵染人類。

 

自 2004 年開始,石正麗團隊到中國各個省市采集了數千隻中華菊頭蝠標本,並對其體內病毒進行基因組分析。2013 年,他們在雲南省一個洞穴中發現了一群攜帶有 SARS 樣冠狀病毒的中華菊頭蝠,通過測序及序列比對,他們發現該病毒與 2003 年爆發的 SARS 病毒具有高度同源性。這個結果說明 SARS 病毒極可能起源於蝙蝠。此成果獲得了中國國家自然科學獎二等獎。

 

2015 年美國北卡的 Ralph Baric 團隊根據石正麗發現的蝙蝠冠狀病毒序列,構建了一個活的蝙蝠冠狀重組病毒(這就是網上傳的 2015 年Nature Medicine 文章),發現它可以感染人細胞,並以此預測蝙蝠冠狀病毒可能會進化到侵襲人類,需要密切監控。和 RaTG13 比,這個蝙蝠冠狀重組病毒和 nCoV-2019 相差更遠,更不可能是造成武漢肺炎的病毒。

 

2018 年,石正麗聯合另外兩個團隊發現,導致2016 年廣州仔豬致死性疾病的冠狀病毒,與發生疫情豬場附近的蝙蝠洞穴中發現的冠狀病毒全基因組序列一致性高達 98.48%,從而認定廣州仔豬致死性疾病是來自於蝙蝠的冠狀病毒造成的。這些研究找到了新發病毒的源頭,對於防範未來的新發傳染病很有幫助。

 

參考資料

 

[1] V.D. Menachery, B.L. Yount, Jr., K. Debbink, S. Agnihothram, L.E. Gralinski, J.A. Plante, R.L. Graham, T. Scobey, X.Y. Ge, E.F. Donaldson, S.H. Randell, A. Lanzavecchia, W.A. Marasco, Z.L. Shi and R.S. Baric, A sars-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence, Nature medicine 21 (2015), no. 12, 1508-1513.

 

[2] X.Y. Ge, J.L. Li, X.L. Yang, A.A. Chmura, G. Zhu, J.H. Epstein, J.K. Mazet, B. Hu, W. Zhang, C. Peng, Y.J. Zhang, C.M. Luo, B. Tan, N. Wang, Y. Zhu, G. Crameri, S.Y. Zhang, L.F. Wang, P. Daszak and Z.L. Shi, Isolation and characterization of a bat sars-like coronavirus that uses the ace2 receptor, Nature 503 (2013), no. 7477, 535-538.

 

[3] B. He, Y. Zhang, L. Xu, W. Yang, F. Yang, Y. Feng, L. Xia, J. Zhou, W. Zhen, Y. Feng, H. Guo, H. Zhang and C. Tu, Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in china, Journal of virology 88 (2014), no. 12, 7070-7082.

 

[4] D. Paraskevis, E.G. Kostaki, G. Magiorkinis, G. Panayiotakopoulos, G. Sourvinos and S. Tsiodras, Full-genome evolutionary analysis of the novel corona virus (2019-ncov) rejects the hypothesis of emergence as a result of a recent recombination event, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases (2020), 104212.

 

[5] R. Lu, X. Zhao, J. Li, P. Niu, B. Yang, H. Wu, W. Wang, H. Song, B. Huang, N. Zhu, Y. Bi, X. Ma, F. Zhan, L. Wang, T. Hu, H. Zhou, Z. Hu, W. Zhou, L. Zhao, J. Chen, Y. Meng, J. Wang, Y. Lin, J. Yuan, Z. Xie, J. Ma, W.J. Liu, D. Wang, W. Xu, E.C. Holmes, G.F. Gao, G. Wu, W. Chen, W. Shi and W. Tan, Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: Implications for virus origins and receptor binding, Lancet (2020).

 

 

所有跟帖: 

我感興趣的是文中最後一段 -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (714 bytes) () 02/05/2020 postreply 15:21:25

Fatal swine acute diarrhoea syndrome caused by an HKU2-related c -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (26444 bytes) () 02/05/2020 postreply 15:29:13

請教個:自然界存在的病毒有不同種類,冠狀病毒是其中之一。 -pickshell- 給 pickshell 發送悄悄話 (263 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:35:47

見內 -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (622 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:43:37

謝謝,我覺得產生這些突變需多長時間這個真難說。。 -pickshell- 給 pickshell 發送悄悄話 (380 bytes) () 02/05/2020 postreply 19:02:35

關鍵是這些蝙蝠遠在雲南,浙江,廣東,卻出現在武漢,是誰把蝙蝠帶到武漢的? -5678910- 給 5678910 發送悄悄話 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 15:26:32

多種可能 -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (541 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:51:17

那為啥他們洞裏抓蝙蝠的時候沒有全副武裝隔離呢? -nowayitsover- 給 nowayitsover 發送悄悄話 (106 bytes) () 02/05/2020 postreply 15:48:58

倒不一定是生物武器,我倒是認為她最終是要得到SARS的疫苗。 -cindy2006- 給 cindy2006 發送悄悄話 cindy2006 的博客首頁 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:08:32

對, 不是生物武器, 是生物武器級別。 -nowayitsover- 給 nowayitsover 發送悄悄話 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:20:24

這個環節比較容易出問題 -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (83 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:54:58

她在演講裏專門講了這個問題 -greennew- 給 greennew 發送悄悄話 (125 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:56:35

這篇像是給石教授寫的成績列表,根本沒詳細解釋為什麽 -cindy2006- 給 cindy2006 發送悄悄話 cindy2006 的博客首頁 (468 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:06:58

RaTG13與2019新病毒一致性96.1% -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (149 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:49:42

知道SARS是野生動物吃出來的又咋樣?不是照吃嗎? -Michelangelo- 給 Michelangelo 發送悄悄話 Michelangelo 的博客首頁 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:15:13

同樣不相信是吃出來的。 如果吃出來的應該是邊遠地區最先出現病例。 -nowayitsover- 給 nowayitsover 發送悄悄話 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:22:21

嗯,提供了更多信息 -楊別青- 給 楊別青 發送悄悄話 楊別青 的博客首頁 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:17:26

我相信武漢2019新病毒不是他們泄露出來的 -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (128 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:59:47

現在沒有證據就應該無罪推定 -楊別青- 給 楊別青 發送悄悄話 楊別青 的博客首頁 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:15:51

多數研究都是先有個假說,然後再證實或證偽。 -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:18:42

我的觀點是,現在沒有證據表明實驗室相關,有一定數量的專家懷疑相關才會啟動調查 -楊別青- 給 楊別青 發送悄悄話 楊別青 的博客首頁 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:48:46

這件事也許要多年以後才能有結論,也許永遠沒有結論。 -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 19:03:39

+ -欲千北- 給 欲千北 發送悄悄話 欲千北 的博客首頁 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 19:32:07

老百姓缺乏知情權的地方,這種事能有什麽結論 -虎嗅薔薇- 給 虎嗅薔薇 發送悄悄話 (0 bytes) () 02/06/2020 postreply 05:38:45

怎麽證實他們沒有活病毒?從冠狀病毒的RNA package 冠狀病毒技術上很難嗎? -秋高氣爽92- 給 秋高氣爽92 發送悄悄話 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:58:47

這隻說明15年人造病毒不是CoV-2019, 如何得到‘CoV-2019不是實驗室泄露出來’的結論? -哼哈二將- 給 哼哈二將 發送悄悄話 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 20:01:41

看看這個證據,學過遺傳分子生物學的應該都知道有沒有可信度 -ephd- 給 ephd 發送悄悄話 ephd 的博客首頁 (320 bytes) () 02/06/2020 postreply 06:55:30

他那篇文章似有問題:把載體上的外源蛋白序列錯當初載體本身。 -吃與活- 給 吃與活 發送悄悄話 吃與活 的博客首頁 (557 bytes) () 02/06/2020 postreply 07:10:05

武漢那邊往gene bank裏提交了病毒的測序結果,複核一下應該沒有那麽難 -ephd- 給 ephd 發送悄悄話 ephd 的博客首頁 (0 bytes) () 02/06/2020 postreply 07:13:40

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