從機理上來說，過敏是一種免疫反應，是人體抗體與外來抗原的結合。
抗體，也就是免疫球蛋白，是由B型免疫細胞分泌的一種特殊蛋白，是防禦體係的重要組成。人體大約有10億左右的抗體，每一個結構都不同，結合能力也不同，這是為了對付可能遇到的抗原，包括病毒和細菌感染。我們平時所說，每一個抗體對應一個抗原，實際是一個誤解。
打個比喻，世界上有10億男人，10億女人，你可以說每一個男人或女人，一定能找到適合自己的另一半，這是從幾率上來說。但是，這是一個隨機碰撞，最終遇到什麽人，受很多因素製約。而且，雖然法定是一夫一妻，但是並不是一個男人隻有這個女人可以結婚，也不是一個女人隻有這個男人可以結婚。在不同環境，你遇到人不同，結果也不同。
所以，抗體並不是為抗原量身打造，而是隨機碰撞。如果某個抗體跟抗原空間結構相配，兩個分子可以形成穩定結合，形成了抗體和抗原複合物，分泌這個抗體的細胞被激活，這就是免疫中的抗體抗原反應。需要記住的是，某一個抗體分子並非隻對一個抗原有結合能力，隻是親和力有強弱之分。
很多常見的自免疾病，特別是病毒感染細菌感染引起的，外源抗原（病毒細菌蛋白）激活了人體某種抗體，但是純屬巧合，這種抗體也可以和人體某種自身細胞結構或者蛋白分子有較高的親和力，造成破壞。
原則上來說，可以跟菠蘿反應的抗體，並不是不能跟蘋果反應。就某種特定抗體來說，它可能誘發的過敏反應在不同人群，不同環境，可能不同。
