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冠狀病毒當前,國內的“支援”要來了

(2020-03-02 06:19:39) 下一個

沏一杯茶,犒勞一下自己---手填稅表做完了

昨天就搞完了聯邦稅,今天把州稅填完,能拿回來總共1800,夠交五月份就要來的房地產稅賬單的三分之一了。。。

LOL,窮人就是這麽計劃著每分錢的用途的。今天帶領導去看open house,真不錯的房子,就是太貴啊,房地產稅就比我現在的多出差不多一倍。問領導:你是願意多幹三年住這個房子呢,還是早三年退休?領導毫不猶豫地選擇後者。。。

不錯不錯,春天來了,今天帶領導去湖邊走了一英裏。懶蟲走不動,我隻好自己多走了幾圈,四英裏吧。馬上可以種菜了,先把體力提升點,翻地有力氣才行。領導問要不要買一卡車top soil,我說等退休後再買,現在沒時間一桶一桶從driveway搬到房子後麵的菜園子呢。。。

(二0二0年二月二十三日)

昨晚回家,給領導交待了家底

我家領導是甩手掌櫃,從來不知道家裏的財政狀況的。她的口頭禪就是:你辦事,我放心。。。

這不,冠狀病毒當前,昨晚整理完稅表,準備今天寄出去的時候,就把她叫過來,在她的記事本上,寫好各個賬戶的大致情況,從life insurance找雇主的那個部門,到退休賬戶的密碼,再到銀行戶頭的雙重保護密碼。。。看完了,人家鼻子一歪:我們賬戶不少,錢倒不多麽。。。

斜了她一眼:不是讓你多幹兩年麽。。。

(二0二0年二月二十六日)

 

科普--冠狀病毒的核酸檢測

所謂病毒核酸檢測,就是檢測病毒的遺傳物質。冠狀病毒是RNA病毒,就是檢測病人樣品裏有沒有冠狀病毒的特異RNA,原理上和犯罪現場檢測犯人的DNA差不多:就是通過上世紀八十年代末九十年代初發明的PCR技術。

前麵的科普提到DNA/RNA是由四種不同的核苷酸的單體形成的聚合物。有了一條現成的聚合物(X),它對應的另一條(Y)可以通過核苷酸的配對原則(A:T/U或者G:C)來合成。也就是現成的一條作為模板(X),合成另一條(Y)。新合成的一條(Y)在下一輪也可以作為模板,反過來合成最先的X。。。這個循環反複進行,一變二,二變四,四變八。。。條件容許一個X分子,經過30個循環,就可以變成2^30條X,自然可以達到檢測需要的量了。

上麵這個循環就叫Polymerase Chain Reaction(PCR)。它需要一個起始的小片斷,我們叫引物。引物一般是20個左右的核苷酸組成的聚合物,隻要引物找到配對的模板,Polymerase就根據模板的序列,在引物上麵不停地按配對原則加核苷酸,把一個20左右核苷酸長度的引物變得和模板一樣長。所以,是引物的特異性(序列)決定了PCR能擴增那個特異的DNA/RNA模板。假如一個引物的序列是:5’AGGTCGGATGCTCCTTAGGAG,21個核苷酸,按照配對原則,它找到的模板一定很難得。這就是知道了冠狀病毒的RNA序列之後,可以很快設計出冠狀病毒特異引物的原理。一個引物隻能延伸出一條DNA鏈,要兩條鏈都擴增,PCR就用兩個引物,來回擴增。。。所以,保證這個擴增出來的PCR產物一定是冠狀病毒的,有兩個引物的特異性把關,還有PCR產物的大小也是已知的。

PCR的模板隻能用DNA,不能用RNA。所以,對RNA病毒,用PCR方式來檢測,就是先提取樣品裏的RNA,然後進行一步叫“逆轉錄”的反應,也是按核苷酸配對原則,合成DNA後,再PCR檢測DNA。。。

從中國發表冠狀病毒全序列後,核酸檢測就可以實施了,所以核酸檢測是最先實施的。一個有經驗的博士後或技術員,一個分子生物學實驗室就可以做,或者每個州的forensic實驗室也基本能勝任。這個方法的問題出在病毒是RNA上----RNA沒有DNA穩定。我早期在國內做RNA,都很仔細的,主要是降解RNA的RNase無處不在,還特穩定,所以,那時候裝試劑的玻璃瓶都是攝氏400高溫烤四個小時才能用的。現代實驗室都是一次性塑料製品,好了很多。但就是現在我們用商業kit提取RNA後,都是負70度保存的。所以,從病人身上取樣後,保存不好;或取樣量不夠;或病毒RNA被降解等等,就會檢測不到。這個也是早期中國用核酸檢測武漢病毒碰到的問題,很多陽性病人檢測不出來。

PCR檢測的另一個問題是樣品汙染。這個往往發生在試驗操作人員的不小心上。PCR擴增產物是指數級增長的,一般我們作PCR循環,到了35個還檢測不到,我們就定型陰性。如果還往上增加循環次數,往往就會有產物出來了,這樣的結果我們度算不可靠的。一個實驗室天天作同一個PCR產物,往往很容易產生交叉汙染,陰性樣品也會顯示產品。所以,一般實驗室會非常小心,經常會postive/negative control同時進行,確保PCR反映成功(positive control);同時沒有交叉汙染(negativecontrol)。

RNA不穩定性決定了最好是拿到樣品後馬上處理檢測。美國病人不多,也就沒有緊迫感。武漢湖北可是太緊迫了。而核酸檢測可以同時處理大量樣品,幾個小時就可以出結果。就是有一些不準確也值得啊。。。可以邊做邊調整邊改進。

我們也常做細胞培養micoplasma汙染的。用商業Kit的感覺是需要高汙染才能檢測到。很多時候我憑經驗就知道很可能有汙染了,但PCR的kit經常檢測是沒有汙染。碰到這種情況我們往往人為地讓細胞多長幾天,不換medium,等micoplasma累積多了就能看出來。實驗室無所謂。但針對這個疾病,應該是寧願把陰性搞成陽性,然後再檢測確認,也不能放過陽性的。所以,kit的設計思路上可以有很大的調整餘地。另外,檢測是有和無,是定性的,PCR現在可以定量或傳統方式的半定性。如PCR方式的循環次數多少,就可以改變測試的靈敏度的。我沒用過CDC的測試kit,就不能提具體建議了。

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前幾天還有一個研究生找我請教,如何通過PCR,克隆一個人的基因。他們都知道我有magic,用計算機software設計好了,還找我改進。我看了一下他的思路,問明了他要克隆的人基因在細胞裏表達量高低和基因的大小和結構,指出了他設計的PCR引物偏小,每個引物多加兩三個核苷酸就好;然後讓他在作逆轉錄時別用kit裏提供的通用引物,而是改成他要的基因的specific引物。昨天給我看PCR結果,高興壞了:都浪費了一百多塊錢去買公司的產品,然後自己花了一個禮拜時間,最後發現根本就沒有他要的基因。找公司,公司自己試了,最後承認是沒有,產品下架。。。我這30分鍾就解決了他的問題。。。我開玩笑說,20年前的老知識還是有用的。


(二0二0年二月二十七日)


領導?把我的生日忘了


昨晚都上床了,就聽見電話鈴響:“喝不喝一杯?” 電話那頭是酒鬼。

“啊,這麽晚了。。。聽背景你在開車?” 我問。

“是。剛給學生上完討論課,回家路上呢。”酒友說。

“我家領導忙著給她爹娘打電話呢。”

“哦,我以為她記得你生日呢。。。” 酒友玩笑著。

 
咱生日多,農曆陽曆農曆推選的陽曆,那個方便就過那個啦。。。所以,領導忘了往往有辦法補救的。這不,今早一起來,領導就嚷嚷:生日今天過。我做饅頭給你吃。。。

晚上叫上老酒友,兩人分享了一瓶瀘州老窖。


兒子大學第三年的financial aid package下來了

寒假的時候就抓住兒子趕緊把申請送進去,誰想FASFA送回來的confirm郵件,說的是2019-2020的數字。我們查了幾遍,明明我們填的表格是2020-2021的。糊塗了,去兒子學校網站查,說申請收到,等FASFA的數據。。。隻好給兒子說:3/31之前還能送一輪申請。萬一FASFA搞錯了,等你春假回來我們再填一次吧。。。

昨晚兒子短信把學校的結果轉給我:兩萬獎學金,一萬出頭的grant,work-study 2200,還有就是loan 5000了。今天趕緊把學校的開銷調出來,七萬出頭。。。算了算,除了loan,我還要掏35000呢。邊喝咖啡邊給領導匯報:到五月份我今年的工作合同結束,要完成的任務很重啊--兒子第三年的錢夠了,可換房頂的錢,五月份要來的房地產稅,還有夏天全家度假的錢還沒著落呢。。。

給兒子短信:貸款是政府補貼的,雖然比上年多了很多,你四年下來的總數也就17000。如果象姐姐一樣大學畢業就找到工作,應該不是問題。work-study的錢爹媽來cover,你掙多少就花多少。老爸老媽還是match你掙的錢,但必須放Roth IRA。。。

窮人家就是這麽數著錢過日子的。。。


(二0二0年二月二十九日)

 

冠狀病毒當前,國內的“支援”要來了


昨天接到國內北京朋友的微信,她兒子在這裏上學,擔心美國的冠狀病毒擴散,要寄口罩來。怕兒子上課忙,校園人雜,要寄到我家。順便給我們分一百個。。。嗬嗬,我家就沒囤口罩,這下終於有了。。。

這個朋友其實以前不認識的。因兒子要來上學,鄰居是我表妹,就介紹過來了。送兒子來的時候見過一麵,再以後就是孩子有事找找我,過節我們有空就叫過來吃個飯。父母知道了,很客氣,每次孩子回來都不忘帶點禮品給我們。上次兒子的信用卡被盜用後,怕寄丟了麻煩,不敢郵寄,找我們幫忙。正好我有鄰居在國內,回來路過北京,馬上讓他們聯係上,帶過來。寒假兒子回去後,還托兒子帶茶葉給我鄰居,我們也跟著沾光。

朋友也是慢慢處出來的。。。

(二0二0年三月一日)

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閱讀 ()評論 (4)
評論
路邊的蒲公英 回複 悄悄話 亂,下回分三篇文章寫。
spot321 回複 悄悄話 這時候你要經常出來科普!群裏,網上都要多走幾步!~~~
ali88 回複 悄悄話 “賬戶不少,錢倒不多”!哈!
敢跟管錢的領導頂嘴,膽子不小。
我們也有國內朋友要給這邊上學的孩子寄口罩。正好,讓他們寄給我們國內正急需的親戚,我們給他們孩子寄。
兵團農工 回複 悄悄話 善事善報。嗬嗬
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