沒有統一的確定算法來確定“難度”。一般采用所使用邏輯的複雜程度，（計算時間，等等）比如說，一個swordfish 比一個x-wing難（算法類似，參數大一級），但是沒有x-y wing難（算法不同）。但是大家公認某些邏輯的算法比另一些要難。因為sudoku explainer 可以解決所有已知的數獨，所以大家以它作為難度參考。它大致使用解題中使用的“最複雜的”邏輯算法來確定難度。不一定百分之百的可靠，（比如說，人們有時發現，在一個數獨上增加一個線索，sudoku explainer 報告難度上升！但是這很少見。）其他類似的、基於邏輯的程序並不一定認可我所引用的例子是前三名，但是，它們都會認可這三個例子的確有頂級難度！
當然，你可以用一個基於backtracking的算法使用的回溯的次數來確定某個數獨的難度，往往會得到１７線索數獨有較大的回溯次數。不過，因為數獨迷們認為回溯是猜測，不是邏輯解法，並不認可。的確，這四萬多個１７線索數獨從邏輯算法角度來說並不難。
