ZT 轉篇科普文章 :新冠Delta毒株為何如此凶險?

來源: pickshell 2021-08-06 05:46:29 [] [舊帖] [給我悄悄話] 本文已被閱讀: 次 (12681 bytes)

原文來源: https://wallstreetcn.com/articles/3637070

Nature長文揭秘:新冠Delta毒株為何如此凶險?

來源: 醫藥魔方
 
新冠病毒的變異主要出現在S蛋白中。Delta變種出現了更多的突變,使S蛋白與細胞膜上受體的結合能力提高,逃避免疫係統的能力也有所增強。

近期,全國多地再現新冠疫情。目前公開的病毒基因測序結果顯示,此次疫情的“幕後黑手”正是B.1.617.2(Delta)變異株。

最早在印度發現的Delta毒株可謂來勢洶洶,正在成為全球流行的主要新冠病毒變異株。與2020年11月在英國發現的B.1.1.7(Alpha)變異株相比,Delta變種潛伏時間更短,傳播速度更快。據世界衛生組織統計,目前Delta毒株已傳播至全球逾80個國家或地區。

2021年7月12日,廣東省疾控中心上傳到medRxiv的研究顯示,Delta毒株確診病例的病毒載量是感染原始毒株患者的1260倍。此外,原始毒株在人體內可被檢測出來的時間為6天,而Delta毒株僅暴露4天後就能被測出。這說明Delta變種的複製能力更強。

新冠病毒SARS-CoV-2是怎樣入侵人體的?Delta毒株為何如此凶險?7月28日最新發表在Nature雜誌上的一篇文章帶給我們很多啟發。

有數十年對冠狀病毒的研究作為基礎,科學家們通過19個月的努力,詳細描述了新冠病毒入侵人體的過程,期望能從病毒的生命周期中找到破解病毒傳播的方法。

從S蛋白說起

冠狀病毒SARS-CoV-2表麵布滿凸起的S蛋白(Spike Protein)。S蛋白屬於第一類病毒膜融合蛋白,是病毒依附並入侵人體細胞的關鍵。S蛋白表麵包裹著聚糖,可以掩護病毒躲過人體免疫係統的偵查。

從S蛋白開始,SARS-CoV-2就表現出比其他冠狀病毒技高一籌。拿流感病毒來說,其外部的融合蛋白相對剛性。而SARS-CoV-2的S蛋白非常靈活,可以與三個點鉸接,這就使它更易於吸附在人體細胞上。

S蛋白大體上分為3個部分,頂部的受體結合域(RBD)、S1亞基和S2亞基。S1亞基與RBD相連,負責與細胞膜上的受體結合;S2亞基主要促使病毒與細胞膜的融合。

新冠病毒的變異主要出現在S蛋白中。序列出現突變時,會導致RBD更有可能出現在頂端的位置,病毒就更容易進入細胞。Delta變種的S1亞基比Alpha變種出現了更多的突變,僅在RBD中就發生3處突變。使S蛋白與細胞膜上受體的結合能力提高,逃避免疫係統的能力也有所增強。

細胞膜上的兩個“叛徒”

SARS-CoV-2又是如何入侵細胞的呢?

這就不得不提到細胞表麵的一個關鍵受體——血管緊張素轉化酶2(ACE2)。病毒想要入侵人體細胞,必須借助S蛋白抓住細胞膜表麵的ACE2蛋白,並與之結合,才能進入人體細胞“為非作歹”。

也就是說,如果把細胞比作一個房間,那麽ACE2蛋白就像房間“門把手”。在SARS病毒中,ACE2蛋白也是病毒與細胞的對接點。而由於新冠病毒RBD的特殊性,它與ACE2結合的強度是 SARS病毒SARS-CoV的2-4倍。而Delta毒株的S1亞基發生了突變,導致S蛋白與ACE2結合的能力更強。

一旦S蛋白抓住了ACE2這個門把手,SARS-CoV-2就立即啟動與細胞膜的融合過程,準備“破門而入”。

入侵過程中不得不提到另一個關鍵分子——跨膜絲氨酸蛋白酶(TMPRSS2)。TMPRSS2可以在S蛋白的S2亞基上切出一個小口,暴露一係列疏水氨基酸。這些氨基酸迅速隱藏到最近的宿主細胞的細胞膜裏。接著,S蛋白像拉鏈一樣把自己折疊起來,迫使病毒和細胞膜融合。

如果把ACE2比作“門把手”,那TMPRSS2可謂是名副其實的“潤滑油”。在TMPRSS2和ACE2這兩個“叛徒”的幫助下,SARS-CoV-2就順利入侵人體細胞了。與SARS病毒隻能通過組織蛋白酶L利用內吞機製進入細胞相比,這種入侵方式可謂更高效。這也解釋了為什麽抗瘧疾藥物氯喹不能阻止SARS-CoV-2的入侵,對治療新冠肺炎無效。

挾持細胞變成“病毒工廠”

入侵細胞後,SARS-CoV-2開始“為非作歹”。

病毒將自己的RNA注入人體細胞,迅速“攻城略地”。利用細胞質中的核糖體,製造合成自身RNA所用的蛋白質和結構蛋白(如S蛋白)等。接著,病毒開始大量複製自身的遺傳物質。那怎樣打壓宿主mRNA的翻譯,使細胞全力支持自己蛋白質的製造呢?SARS-CoV-2有它的高招。

首先,病毒從根源上減少了這種競爭。當病毒到達細胞時,最早翻譯的一批蛋白質中有一種叫作Nsp1。這種蛋白非常有意思,它可以在宿主細胞內發號施令,召集細胞內的相關酶,把沒有病毒標簽的mRNA全部切碎。

其次,當細胞被病毒感染後,蛋白質的翻譯量減少了70%。這次的“罪魁禍首”還是Nsp1,它會阻斷mRNA進入核糖體的通道,餘下的產能全部用於病毒自身蛋白的翻譯。

再者,病毒關閉了細胞的報警係統。病毒阻止了人體細胞的mRNA從細胞核進入細胞質的過程,使原本可以提醒免疫係統注意的信號蛋白翻譯受阻。

魏茨曼科學研究所的病毒學家表示,這三種機製都不是SARS-CoV-2所特有的。但SARS-CoV-2能同時利用三種機製,且速度之快,效率之高,在所有病毒中幾乎是獨一無二的。

改造“病毒工廠”

挾持細胞成為“病毒工廠”還不夠,病毒剛站穩腳跟,就要對這個“工廠”內外來一個徹底的大改造。

先看細胞外部。病毒的S蛋白會移動到細胞表麵,從細胞內破膜而出。此時細胞膜上的鈣離子通道被打開,病毒將一種特殊塗層送到細胞外。這種塗層與人體自然融合到一起的細胞(如肌肉細胞)表麵上的塗層是一致的。這樣,被感染的細胞與鄰近能表達ACE2的細胞發生融合,最終甚至能形成包含20多個細胞的合胞體。

表達新冠病毒S蛋白(綠色)的細胞的融合細胞結構(合胞體),藍色為細胞核,紅色為細胞骨架(來源:Nature)

病毒的最終目的是不斷增殖下去,這就需要人體細胞生存的時間盡量長,這也是為什麽病毒要讓這些“工廠”合並起來。中國醫學科學院的科學家團隊甚至發現,SARS-CoV-2感染的細胞甚至能與淋巴細胞發生融合來躲避免疫係統的偵查。要知道以前這項技能可是腫瘤細胞才有的。

與此同時,細胞內部結構也發生了巨大變化。內質網、高爾基體、溶酶體等一些細胞器都被病毒一一改造,使人體細胞更適宜它的增殖。還有許多SARS-CoV-2病毒的行為目前沒有得到很好的解釋,例如為何病毒選擇從溶酶體離開細胞,而不是與大多數冠狀病毒一致,從高爾基體離開。

再出發

離開細胞時,SARS-CoV-2也有高招讓自己變得更容易傳播。

其他冠狀病毒中,S蛋白的S1亞基和S2亞基之間通常隻有一個氨基酸相連。而SARS-CoV-2的S1和S2之間足足有5個氨基酸,這對病毒入侵肺部細胞至關重要。人體細胞中有一種叫作Furin的蛋白酶可以識別並剪切這段氨基酸,暴露出S蛋白上的開放結構域。

還記得前麵提到的病毒進入細胞的幫凶TMPRSS2嗎?有了Furin的切割,TMPRSS2對S蛋白的二次切割才會更高效。這樣一來,S蛋白與ACE2的結合能力更強,進攻人體細胞也更容易了。

科學家們發現,相比於其他冠狀病毒,SARS-CoV-2經過Furin加工過的S蛋白比例有明顯上升。SARS病毒中這一比例隻有不到10%,新冠病毒的Alpha變種中上升為50%左右。而在高傳染性的Delta變種中,這一比例高達75%。

比起傳播能力的增強,更讓人憂心的是病毒變種是否會受影響疫苗的有效率。7月21日,由英國公共衛生部完成,刊登在頂級醫學期刊NEJM的一項研究顯示,研究調查的兩種疫苗預防Delta變種感染的有效率稍有下降,但在兩劑接種完成後,仍能提供較好的保護效果。

具體來說,研究結果顯示,接種完兩劑mRNA疫苗BNT162b2(開發商:輝瑞/BioNTech/複星醫藥)後,預防有症狀Alpha變種病毒感染的有效率可達93.7%,針對Delta變種的有效率仍有88.0%。接種完兩劑腺病毒載體疫苗ChAdOx1 nCoV-19(開發商:阿斯利康/牛津大學等)後,預防有症狀Alpha變種病毒感染的有效率達到74.5%,針對Delta變種的有效率為67.0%。

小 結

麵對SARS-CoV-2,我們仍有很多未知。期待在全球科學家的共同努力下,我們能夠早日揭開SARS-CoV-2及其多種變體的真正“軟肋”,找到打敗COVID-19的製勝之道。

參考資料:

[1] How the coronavirus infects cells — and why Delta is so dangerous(來源:Nature)

[2] How the Delta variant achieves its ultrafast spread(來源:Nature)

[3] Effectiveness of Covid-19 Vaccines against the B.1.617.2 (Delta)Variant(來源:New England Journal of Medicine)

本文作者:海默,來源:醫藥魔方,原文標題:《Nature長文揭秘:新冠Delta毒株為何如此凶險?》

 

 

所有跟帖: 

標題驚悚,但文中也說:“接種完兩劑mRNA疫苗後,預防有症狀Alpha變種有效率93.7%,對Delta變種效率88%” -業餘城管- 給 業餘城管 發送悄悄話 (0 bytes) () 08/06/2021 postreply 06:16:30

簡單小結:Delta變異毒株的詭異狡猾在於,使S蛋白與細胞膜上受體的結合能力提高,逃避免疫係統的能力也有所增強。Delta變種 -pickshell- 給 pickshell 發送悄悄話 (943 bytes) () 08/06/2021 postreply 06:16:58

總之就是戰鬥力全方位增強。我們需要針對delta的疫苗。 -viewfinder- 給 viewfinder 發送悄悄話 viewfinder 的博客首頁 (0 bytes) () 08/06/2021 postreply 09:04:22

是。我近期最關注的是,重症住院和死亡數據,和第3劑疫苗信息。 -pickshell- 給 pickshell 發送悄悄話 (0 bytes) () 08/06/2021 postreply 09:14:04

謝謝! -鍋沿- 給 鍋沿 發送悄悄話 (0 bytes) () 08/06/2021 postreply 09:26:53

不客氣哈,總體感覺這篇科普寫得蠻清楚實在的。 -pickshell- 給 pickshell 發送悄悄話 (0 bytes) () 08/06/2021 postreply 10:04:17

謝謝總結! -Shine20- 給 Shine20 發送悄悄話 Shine20 的博客首頁 (0 bytes) () 08/06/2021 postreply 13:44:46

有圖,易讀,謝謝 -SAR- 給 SAR 發送悄悄話 SAR 的博客首頁 (0 bytes) () 08/06/2021 postreply 14:45:49

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