首先疫苗公司公布的保護率不是在同等試驗條件（如注射劑量，人群等）下統計的，難直接比較。此外安全性同樣重要。這裏從原理上比較一下。
1。傳統滅活疫苗是對病毒經過滅活處理製成。滅活的通常是病毒分子外圍的蛋白質，讓其變性而失去活性。但是病毒內部的基因組很難被殺死，注入人體後不排除有潛伏的可能。此外由於病毒分子蛋白質變性後會失去部份原有特征，使人體產生的抗體識別病毒特異性能力降低。滅活疫苗的好處就是研製簡單。
2. 腺病毒載體疫苗是僅將新冠病毒分子進入人體細胞的鑰匙-S蛋白加載到 腺病毒分子上製成。它去除了新冠病毒的其它危險蛋白，因此比滅活疫苗安全。但是它增加了腺病毒這個累贅，會影響人體抗體識別新冠病毒的能力。此外腺病毒不是對每個人都是安全的。
3. mRNA疫苗是將複製新冠病毒分子的S蛋白的信使RNA加以改造製成。由於它隻和S蛋白相關，沒有新冠病毒的其它危險蛋白和基因，同時也沒有腺病毒這個累贅，mRNA在人體內也很容易降解，因此它是最安全的疫苗。它在人體內隻生成S蛋白，其它幹擾成份少，因此抗體識別病毒特異性也是最高的。mRNA疫苗還有一個好處就是可以根據病毒變異輕鬆調整程序。mRNA疫苗要解決穩定性，細胞傳遞性和特征放大性等問題，因此有研製難度。但是研製思路清晰，主要是材料優化和改造突變點選擇問題。不清楚他們困在那一點上。
