簡單講胃鏡檢查很多時候會做活檢，即使鏡檢下未發現明顯異常也會做“隨機/Random活檢”。常規結腸鏡隻對息肉和鏡下可疑病變做活檢，一般不做常規隨機活檢。原因直接和做胃鏡結腸鏡的目的有關。
首先胃鏡和結腸鏡不一樣，不應該是常規普查性的檢查。做胃鏡是要有臨床指症的，是對症檢查。最常見的原因是上消化道症狀比如疼痛反酸吞咽障礙等等，其次是排除上消化道出血。出血原因多見的是食管靜脈血栓曲張，其次是潰瘍，再就是癌症。美國的胃癌發病率較低，食管癌更少見，排除癌症做胃鏡時是有目標的活檢。因為大多數病人是因為有上消化道症狀才做胃鏡，而且很多常見的慢性病變（比如不同類型的慢性胃炎）又很難在肉眼觀察下診斷，所以盡管胃鏡下未見明顯異常，醫生也會“隨機”取活檢做病理診斷。這個“隨機”隻是鏡下沒有看到病變這個意義上的隨機，而活檢的部位不是完全隨機的，一般是在有臨床意義的部位，比如胃食管結合部食管下端胃竇等等。
大多數結腸鏡檢查都是防癌普查，這種情況下如果鏡下沒有看到息肉，一般不需要活檢。原則上醫生應該在鏡下檢查全部結腸一直到回盲瓣，並記錄下來。現在的做法是鏡下一直看到回盲瓣，並拍照留念，留在病曆裏以便日後審查。醫生不需要通過做活檢來證明自己檢查了全部結腸。影響醫生檢查全部結腸的因素很多，比如病人清腸不徹底，病人結腸解剖異常比如做過手術等等，當然也包括醫生的技術水平和細心程度。如果醫生不能檢查全部結腸，那這個醫生應該首先如實地記錄下來並直接告訴病人，然後必須安排進一步的檢查，比如更徹底的清腸後再做結腸鏡，或者安排鋇灌腸/CT等等。
