亞臨床甲低（Subclinical hypothyroidism）的治療在醫學界是有爭議的。

查 出TSH高後，一般要複查，因為很多時候 TSH可以短暫地高後回到正常。另外還要查 T4。有的醫生也查 Anti-TPO. Anti-TPO 若高，今後得甲低的可能行很大。

如果TSH超過10，幾個醫學協會（包括美國內分泌協會，甲狀腺協會）都推薦治療。

如果 TSH 在 4 - 10 之間，而又無證狀的話，治療是有爭議的。但是如果病人的TSH值在4和10之間，伴有甲低的症狀 （便秘，易疲勞，記憶差，怕冷，虛胖，說話辦事慢騰騰，等等），或是 Anti-TPO 值高的話，需要治療。

到底從那個劑量開始用藥？ 老年人要從低劑量 （25 -50 MCG)開始，以免過量。身體健康的年輕人中年人，可以低劑量開始，也可以以略低於治療量 （1.6 mcg/kg/day）的高劑量開始。開始服藥後一般至少六周以上再查TSH和T4。間隔太短查，藥物還沒達到平衡穩定狀態。