| 主要民族 | 維吾爾族－47% 漢族－38% 哈薩克族－7% 回族－5% 柯爾克孜族－0.9% 蒙古族－0.8% 東鄉族－0.3% 塔吉克族－0.2% 錫伯族－0.2% |
四世紀前
前209年，匈奴冒頓單於即位，爾後統一漠北，殲滅河西的月氏，賓服西域三十六國，騷擾中原。
公元前138年，漢武帝決心聯合西域各國，夾擊匈奴，遂使張騫出使西域，前後兩次，皆為匈奴所虜，竟得脫。前115年，張騫第二次出使西域歸來。此後西域成為溝通中西方的要道絲綢之路的關鍵地帶。漢宣帝神爵二年（前60年）於烏壘城（今新疆巴音郭楞蒙古自治州輪台策大雅南）建立西域都護府，取代匈奴勢力。由於都護府的建立，新疆地區開始由中原朝代控製。
 顯示▼中國歷史上的
新疆 |
4世紀－6世紀
4世紀初，西晉因來自北方的遊牧民族入侵而覆滅；曆史進入五胡十六國時期。中國西北部建立了一個又一個的不同民族的國家，包括前涼、前秦、北涼、後涼和西涼。這些政權都試圖保持對西域諸城邦國家的控製。最終鮮卑族的北魏重新統一中國北方，控製了今天新疆東南的一部分。疏勒、於闐、龜茲和且末等政權控製了西部，而中央吐魯番附近則被北涼的延續者高昌所統治。
5世紀末，吐穀渾和柔然開始分別侵入新疆南部和北部，中原政權（北朝）逐漸喪失對此地的控製。從6世紀中葉開始，突厥在阿爾泰山地區崛起，數年間擊敗柔然，建立了西至裏海、東抵大興安嶺、橫亙中亞的突厥汗國。583年突厥分裂為東西二部，新疆屬西突厥。
7世紀－13世紀
隋煬帝大業五年（609年），由楊廣親自率領的隋軍占領吐穀渾之後，控製了今日的新疆東南部。開始之後中原王朝經營西域。
唐太宗貞觀十四年（640年），唐軍佔領高昌，於該地置西州，又於可汗浮圖城（今吉木薩爾）設庭州；同年在高昌設安西都護府，後遷至庫車，改置為安西大都護府。在之後的二十年間，唐朝發動了對西突厥的一係列遠征，西突厥最終於657年滅亡，670年安西四鎮被吐蕃攻佔，而後十次易手；在693年最終被武周收複。702年在庭州設置北庭都護府，後又升為北庭大都護府，管理天山北麓及新疆東部地區的軍政事務，而安西大都護府管理天山南部和蔥嶺以西的廣大地區。唐玄宗開元年間，曾在兩大都護府之上設磧西節度使，是當時全國八大節度使之一。非漢族聚居區，則設置羈縻府州。同時，還在龜茲、於闐、疏勒、碎葉（一度是焉耆）設軍事建製，史稱安西四鎮。
8世紀中葉安史之亂發生時，吐蕃和回鶻再次在之後的三十二年內逐步占領了天山山脈南部的和河西走廊的廣大地區，甚至在763年洗劫了唐朝京城長安。同時，回鶻人在之後的五十年時間內逐步控製了今新疆北部的廣大地區。9世紀中葉後，吐蕃和回鶻都衰落下來，這一地區進入混戰時期。
9世紀之後，西域出現了幾個國家並列存在的局麵。其中主要有高昌、黑汗王朝和於闐等地方政權。844年後西遷西域的回鶻人匯同其他操突厥語諸族建立地方政權。比如回鶻建立的高昌與喀喇汗王朝。於闐是古老的塞人居地，後被回鶻人合並。
黑汗王朝在10世紀—11世紀時控製今日的新疆西部，同一時期回鶻的一支在今日新疆中部定居。1132年，遼國皇族耶律大石躲避金朝人追擊，從遼河上遊地區逃入新疆，建立流亡政權西遼，統治今日新疆地區八十多年。
13世紀初葉—14世紀時，新疆的天山以北地區大部分屬於蒙古窩闊台汗國。今伊犁河流域曾設置阿裏麻裏（阿力麻裏）等處行中書省，但不久就並入察合台汗國。阿姆河南岸曾設立行中書省，後並入伊兒汗國。今烏魯木齊一帶曾設置別失八裏行中書省，後新疆大部分地區長期被察合台汗國占據，僅東部為大元帝國轄地。
14世紀之後
明朝初年，為防範漠北的韃靼和瓦剌勢力，於哈密等地區設置衛所；而以西則為蒙古人統治。16世紀中葉，吐魯番部強大，1472年，哈密等衛所一度被吐魯番攻破，諸衛內遷，之後收復；1514年再度被併。15世紀後半期後，西北諸衛全部喪失，明軍退守嘉峪關。明末清初，蒙古的一支準噶爾部以伊犁為中心建立汗國。經過激烈的戰爭，1697年，清軍擊敗了準噶爾入侵，控製了今新疆東部，哈密、吐魯番首先歸附清朝。1755年，清軍攻占伊犁，最終平定準噶爾。1757年又平定了準噶爾輝特部阿睦爾撒納叛亂。1759年，清軍平定回部宗教首領波羅尼都、霍集占發動的大小和卓之亂，最終統一了新疆全境。周邊的哈薩克、布魯特、浩罕、巴達克山等國也臣服於清朝。
19世紀中葉，俄國威脅清帝國的整個北部邊境。1864年的塔城條約將新疆西北部巴爾喀什湖以南大片土地割讓給俄國，這些土地現在分別屬於哈薩克斯坦、吉爾吉斯斯坦和塔吉克斯坦。也是在1864年，整個新疆發生叛亂，1865年春，鄰國浩罕汗國的阿古柏從喀什進入新疆，統治新疆大部分地區長達6年。1871年，俄國又侵占了伊犁河穀，當時清朝在新疆隻剩下塔城等少數據點。
1875年，清朝陝甘總督左宗棠就任欽差大臣，督辦新疆事務。到1877年底，清軍陸續收複了中亞阿古柏控製的天山南北諸地，史稱「清軍收複新疆之戰」。1881年，清政府收複被沙俄占領長達11年之久的伊犁地區。1884年（光緒十年）11月19日，清政府頒發上諭，設立新疆省，任命劉錦棠為甘肅新疆巡撫，魏光燾為新疆布政使。新疆建省後廢除了伯克製，裁汰各地駐紮大臣，設置廳、府、州、縣，實行與內地各省一樣的行政製度，使戰亂後的新疆社會得到恢複和發展。[5]
近現代
1911年辛亥革命後清朝被中華民國取代，革命黨人湖南人劉先俊等在伊犁策動起義，殺死伊犁將軍誌銳，成立伊犂臨時軍政府。新疆巡撫袁大化電奏清廷保阿克蘇道尹楊增新為新疆都督，自己逃離新疆。楊增新在1912年和軍政府議和，逐漸取得全疆控製，並擁護中華民國大總統袁世凱。革命黨人或被殺死，或回到內地。同年底在沙俄的支持下喀爾喀蒙古宣布獨立（詳見外蒙古獨立）。1912年庫倫當局攻陷科布多後，又入侵蒙古與新疆之間的阿爾泰，被楊增新派軍擊敗。1919年，北洋政府同意將阿爾泰並入新疆，設立阿山道，即今之阿勒泰地區。
1928年6月，北伐結束，7月1日楊增新自行就任新疆省政府主席兼總司令，7月7日被刺身亡。11月17日省政務廳長金樹仁成為新疆省主席。由於金樹仁的獨裁統治，各地民變迭起，和加尼牙孜等人首先在哈密發生暴動，導致甘肅軍閥馬仲英入疆。1933年馬仲英攻打迪化，被新疆督辦公署參謀長盛世才擊敗。同年4月12日在一些不滿金樹仁的軍官利用流亡新疆的白俄歸化軍發動政變，推舉盛世才為新疆督軍。金樹仁取道蘇聯逃往天津。
1933年11月，在英國的支持下，和闐人穆罕默德·伊敏、沙比提大毛拉等人在疏附宣佈成立東土耳其斯坦伊斯蘭共和國，推舉和加尼牙孜為總統。1934年2月，東土耳其斯坦被馬仲英部下馬福元所滅。穆罕默德·伊敏逃回和闐，又擁立其兄滿素爾為帕夏，成立“和闐伊斯蘭王國”，隨即被馬虎山所部消滅。
盛世才前期依靠蘇聯支持鞏固政權，進而控製了新疆全境。為表示其親共，盛世才前往蘇聯考察，還邀請中共陳潭秋、毛澤民、林基路等人到新疆工作。後期和中共決裂，1943年國民黨軍隊進入新疆。在整個抗戰期間，新疆相對獨立，是抗戰的大後方。盛世才還派軍支持了綏遠抗戰等戰役。
1944年，在蘇聯支持下，新疆爆發了反對國民黨統治的“三區革命”（“三區”是指當時新疆的伊犁、塔城和阿勒泰三個地區），再度打出“東突厥斯坦”的旗號，並殘酷屠殺當地的漢族回族人民。1944年9月，蔣介石將盛世才調到重慶任林業部長，派吳忠信任新疆省長，並命令馬步芳派一個軍的騎兵駐紮在新疆各地，對東突厥斯坦獨立運動的活動進行鎮壓。1946年6月，“三區革命”領導人阿合買提江、阿巴索夫等撤消了艾力汗·吐烈的職務，將“東突厥斯坦共和國”改組為伊犁專區參議會。
1949年，國共內戰末期，在彭德懷的人民解放軍第一野戰軍8月26日占領蘭州繼而占領甘肅全境之後，新疆的國民革命軍軍政長官陶峙嶽、包爾漢等宣布脫離廣州的臨時國民政府起義。期間已經投向共產黨一邊的張治中在中斡旋，而中共方麵的談判代表是鄧力群。同年前蘇聯讓起義軍停止進入烏魯木齊，並讓起義軍投降於中華人民共和國政府。9月25日第一野戰軍第一兵團在王震將軍率領下攻佔烏魯木齊，成為中華人民共和國的省。
| 2000 年新疆主要民族分地區統計 | ||||
|---|---|---|---|---|
| 維吾爾族 | 漢族 | 哈薩克族 | 其他 | |
| 新疆 | 45.2% | 40.6% | 6.7% | 7.5% |
| 烏魯木齊市 | 12.8% | 75.3% | 2.3% | 9.6% |
| 克拉瑪依市 | 13.8% | 78.1% | 3.7% | 4.5% |
| 吐魯番地區 | 70.0% | 23.3% | <0.1% | 6.6% |
| 哈密地區 | 18.4% | 68.9% | 8.8% | 3.9% |
| 昌吉回族自治州 + 五家渠市 | 3.9% | 75.1% | 8.0% | 13.0% |
| 博爾塔拉蒙古自治州 | 12.5% | 67.2% | 9.1% | 11.1% |
| 巴音郭楞蒙古自治州 | 32.7% | 57.5% | <0.1% | 9.7% |
| 阿克蘇地區 + 阿拉爾市 | 71.9% | 26.6% | <0.1% | 1.4% |
| 克孜勒蘇柯爾克孜自治州 | 64.0% | 6.4% | <0.1% | 29.6% |
| 喀什地區 + 圖木舒克市 | 89.3% | 9.2% | <0.1% | 1.5% |
| 和田地區 | 96.4% | 3.3% | <0.1% | 0.2% |
| 伊犁哈薩克自治州1 | 16.1% | 44.4% | 25.6% | 13.9% |
| - 奎屯市 | 0.5% | 94.6% | 1.8% | 3.1% |
| - （原）伊犁地區 | 27.2% | 32.4% | 22.6% | 17.8% |
| - 塔城地區 | 4.1% | 58.6% | 24.2% | 13.1% |
| - 阿勒泰地區 | 1.8% | 40.9% | 51.4% | 5.9% |
| 石河子市 | 1.2% | 94.5% | 0.6% | 3.7% |
| 1 伊犁哈薩克自治州包括奎屯市、塔城地區、阿勒泰地區和伊犁地區。 伊犁地區已被撤銷，轄區由伊犁哈薩克自治州直轄。 |
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