一個衣衫襤褸的植物學家

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評“疫情不一定是發源在中國”和中科院那篇論文

(2020-04-11 12:09:16) 下一個

前段時間,微信裏有兩位國內植物學博士朋友,跟我分享一篇推文,題目是“版納植物園基於全基因組數據解析新型冠狀病毒的演化和傳播”。結論是,據最新的結果,新冠病毒的來源可能有鬼。其中一位朋友還信誓旦旦地說:“如果最後證明了病毒源頭在美國,那就大大的悲劇了!”

我和他常在微信裏爭論,類似於“社會主義好,資本主義糟”這樣的話題。我當即反擊:“枉你還學植物分類!這種弱智的話都敢相信!”朋友堅持:“拭目以待咯,反正沒有最終定論,一切皆有可能!”

今天在劉教授的“亞美藝術聯盟”群裏,看到有群友很氣憤地提到:“鍾南山被吹捧上天了。現在他說病毒根源不是中國,暗指美帝!”我以為,前段時間甚囂塵上的“美國陰謀論”應該沒有市場了呀!沒想到,這樣的判斷出自咋們院士之口。鍾院士前段時間預測拐點,屢屢誤判,已經讓人大跌眼鏡了:他最先說,拐點2月初就會來臨;等快到2月初了,又改口說2月中;等快到2月中了,又改口說2月底,。。。想不到,鍾院士也持有類似於我那兩位植物學博士朋友的觀點。

有位群友把相關的推文分享給我,這篇推文是一個叫“無冕財經”的作者寫的、題目為“鍾南山最全講話:疫情不一定發源在中國!有信心四月底基本控製”。我看了錄像,鍾院士的意思是:對疫情的預測,我們首先考慮中國,沒考慮國外,現在國外出現一些情況,疫情首先出現在中國,不一定是發源在中國。

兩位擁有植物學博士學位的科學家和鍾院士都暗指或者相信,新冠病毒的源頭不一定在中國。言下之意,源頭可能在美帝。可見,這種觀點現在在大國成了主流。

我又想起,前段時間有數篇影響很大的推文的主流觀點是,美國這個冬天的流感死了1.4萬人,其實不是死於流感,而是死於新冠病毒;那麽,很顯然,新冠病毒源於美國。這種謠言,還有“日本媒體”的支持,但網上有很多人反擊過,不值一駁!首先,美國統計的方法跟中國不同,中國的流感致死率大約是美國的2-3倍(主要原因有二:醫療條件美國更好;美國40%左右的人打流感疫苗,而中國隻有2%左右);再次,新冠病毒和流感病毒感染人後的症狀確實類似,兩者都是RNA病毒,但兩者從分類學角度看,完全沒有多少親緣關係,它們在分類上的門、綱、目都不同,差異太大,很容易區別。美帝的科學家們不至於那麽弱智。再說,就算川普政府想隱瞞什麽秘密,美帝有強大的私立媒體,作為皿煮的第三力量,秘密不容易被隱瞞。在醫學上,一個簡單的流感快速核酸擴增試驗(A rapid nucleic acid amplification test (NAAT) for influenza),就可以搞定,很容易。

鍾院士等“科學家”暗指,新冠病毒的源頭可能在美帝的重要“科學依據”,是最近一位西雙版納植物園的Yu博士,也是植物學家(看來植物學家喜歡跨界搞點名堂!)及合作者投出去的一篇還沒有審稿的在線稿子:
http://www.chinaxiv.org/abs/202002.00033

Yu博士本人根據自己的英文文稿,寫過一篇中文的推文,名曰“中科院重磅研究:新冠病毒12月8日和1月6日發生過2次明顯的種群擴張 !11月下旬或已人傳人,華南海鮮市場並非發源地”。

這些作者用種群遺傳學population genetics的方法,分析新冠病毒93個全基因組數據裏的單倍型haplotype的關係,來推斷新冠病毒的來源。首先要承認,這種應用很有新意,他們得出的一些結論,有一定的說服力。這裏的給“美帝是源頭”提供“證據”的是,他們推測的兩個“古老的” 單倍型H13和H38,其中H38隻存在於美國的首例新冠病毒病人。這就暗示,有可能這個美國人,把病毒帶到了武漢。但是這個人是今年1月15號才從武漢回到美國的。網上差不到,他說明時候回的武漢。就算他把一年一個月的休假全部用在呆武漢,也不會早於12月16號?。現在普遍認為,新冠病毒11月?中旬到下旬就開始了。他難道能把病毒隔空從?美國帶到武漢?
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001191

從專業的角度看,Yu博士他們的論文還有一定的局限,他們自己也承認。

首先,mv1是假設中的消失了的祖先單倍型。這是否成立,還難說。

其次,他們推測的兩個“古老的” 單倍型,H13和H38,之所以沒有在武漢檢測到,最大原因的可能性是,武漢病人的病毒取樣不足,特別是最開始被感染到的病人。想想,很多人開始並沒症狀,可能一直都沒症狀,就過了。就算有政狀的病人,大多數的病毒沒有RNA序列。所以,Yu博士他們的結論應該改為:“新冠病毒的源頭不一定是武漢的華南海鮮市場,也可能是武漢的華南海鮮市場。”

從GenBank裏的新冠病毒的基因組數據看,有很多樣是在今年2月份測的。在這些樣裏,當然很難找到“古老的” 單倍型。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore?term=sars-cov-2&cmd=DetailsSearch

就算他們的取樣是完美的,文中說“新冠病毒的源頭不一定是武漢的華南海鮮市場”,但無論如何,他們也沒法下結論說,新冠病毒的源頭就是美帝。相反,Yu博士的推文中有一句話:“對“古老的”單倍型H13和H38的病毒樣品溯源發現分別是來自深圳的病患(廣東首例)和美國華盛頓州的病患(美國首例)。他們的旅行記錄表明應該都是2019年12月底至2020年1月初在武漢探親期間被感染的。”他們認為,兩個“古老的” 單倍型H13和H38來自於武漢。也就是說,病毒源自武漢。

根據Yu博士那篇中文推文,來判斷“新冠病毒的源頭就是美帝”,不止是對Yu博士的論文的過度解讀(overinterpretation),而且是錯誤解讀(misinterpretation)。

致謝  弘參加討論!

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feiteng 回複 悄悄話 回複 '阿留' 的評論 : 謝謝
阿留 回複 悄悄話 這篇有理有據,也讚!
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