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最近看到一個震驚的消息,中國的新冠PCR陽性閾值Ct設置在40, 而國際標準是30,整整少了(Ct值越大,病毒量越少)2^10, 也即很多按國際標準陰性的人,按中國標準是陽性。這也就是為什麽很多旅客在國外測定是陰性的,到了中國變陽性,這不但造成本人的旅程延誤,連帶航班也被熔斷,還有官司,在中國被測定陽性的人要告國外測定的機構。現在,這事又延燒到奧運會相關人員,很多運動員在國外測定陰性,進入中國複查陽性。
怎麽會這樣!到底是哪一方錯了?這些邊緣人,到底是假陽性,還是假陰性。
前幾天寫過一篇《統計學地看待疫情》https://blog.wenxuecity.com/myblog/70246/202201/27078.html, 認為對疫情放開的好處極大,壞處極小,這個論斷的出錯率在萬分之一以下(P<0.0001)。這被很多聽了不入耳的人辱罵,或者說我是文科生在班門弄斧賣弄統計學。統計學和生物學是我賴以為生的技能,不說是專家,也算professional。 PCR的CT值我也很熟悉,就來科普一下,由讀者來決定,到底是假陽還是假陰。
PCR技術,就是在一段核酸(DNA 或RNA)上用頭序列和尾序列兩個模板,在聚合酶和反複變溫的作用下,就能不斷合成這段核酸。原核酸的量越大,合成同樣量該段核酸所需的次數(cycles)越小,這個次數就是Ct值。Ct30比Ct40, 病毒載量多了1024倍, 比如有個病人,在國外需要有1024個病毒才算陽性,到了中國,有1個病毒就算陽性。
不熟悉檢驗科學的人,認為陽性就是絕對的有,陰性就是絕對的無,但在檢驗界,是不存在絕對的東西的,這受到檢驗技術的限製。最重要的兩個指標,就是敏感性和特異性,還有檢查的可行性。說得太深了不好理解,就舉個簡單的例子吧,如何鑒別男性和女性?
你會說,這還用檢驗,但讓你弄一個指標,讓計算機程序能分清男和女,還真的不容易!如果拿頭發長短做指標,是的,頭發長的多是女性,但特異性很差,男的也很容易養長頭發,隻要他願意。脫了褲子檢查,測定染色體檢查,特異性是好了,可行性就差了。於是有人提出用腰臀比例來測定,其特異性,敏感性,可行性都不突出,但比較平衡。
對新冠檢查,也需要一個在特異性,敏感性,可行性上比較平衡的適合於大規模檢驗的方法,於是口,鼻咽取樣定量PCR法就成了首選。以前一度有肛門取樣的做法,敏感性和特異性都很好,可惜可行性不好。
定量和定性又是檢驗學的兩個重要指標。比如決定黑白,讓人來決定定性,一目了然,但如果你讓機器來決定,一定得設置一個量機器才能懂,就如照相機裏的灰度測定值。所以現在即使是定性指標,也必須有量的設置。新冠測定也不例外,必須設置一個閾值,機器才能判定陰性陽性。
很多人以為All/None的事,其實都是一個連續體。比如癌症,其實每個人身上都有癌細胞,隻有達到一個閾值後,才是癌症病人。比如性取向,每個人都有多少不同的同性戀成分,加州要設立43個性別是有科學基礎的,隻能通過量化某個指標,才能決定誰是直男誰是勒死賓。曾有個啤酒廠宣傳其成品完全無甲醛,結果引出了一個行業潛規則,99%以上的啤酒裏都含有甲醛,隻要沒超過某個指標,就是合格的。
新冠的PCR測定,不可能得出零值,是不是那些非零值的,都是有新冠呢,不是的!那些非零值是背景,這就需要來validation, 方法是在標本裏加入病毒,來看這時的PCR值是多少。加少了病毒,PCR還是分辨不出,隻有加到了達到能實現明確分辨有無的程度的時候,這叫最小可測出量(LOD,limit of detection),達到了可測量多少的時候,叫LOQ.機器實現的LOD,LOQ還要來臨床驗證,證明這個量的病毒是否有臨床的意義,能夠引起感染。Ct30是經過這一係列嚴格的論證,既能被機器測出,也具有臨床意義的值。
那中國為什麽要把這個值提高1024倍呢?我也不知道,中國各地的領導都強調要做到萬無一失,我提到過的出錯率在萬分之一以下肯定是不夠的。領導也聽了專家的話,知道Ct30是個平衡的產物,並不等於不能再低。那我就把標準提高10(他不知道等於2的10次方),那豈不是更好,那才是萬無一失呢!
Ct40陽性的人中,當然包括Ct30陽性的人。但在那些Ct30陰性,Ct40陽性的人,很多人的檢測數據隻是背景信號,根本沒有感染,是假陽性病人,如果被隔離,被汙名,被驅逐出境,那他們真是比竇娥都冤!
https://www.wenxuecity.com/news/2022/01/27/11239023.html
“Many PCR assays use 40 as cut off for Ct value to consider the test positive, allowing detection of even very few starting RNA molecules”
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1876034121002318
至於具體檢測用多大Ct,我想要根據人群中感染情況。在美國當然毫無意義,而在中國,要做到清零,可能就不得不用40.
我不明白中國的實驗室為什麽做40cycles 的PCR. 這是外行人的做法。並不是說它會引起假陽性,而是,用一句粗話來說,脫了褲子放屁。
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老朱大概也是說這個意思吧,問高福?老朱這篇文章挺有道理,像是內行人。
談到郵件可能傳遞病毒導致感染的問題,可以去看看日本一份港發表還未經同行評論的研究報告,在這份報告裏,日本科學家證明Omicron在皮膚和塑料表麵存活時間是原始株的3-4倍。雖然沒有做在紙上存活試驗,但應該也有理由推論在紙上存活時間也是3-4倍。
所以現在這些”專家“的言論是要帶問號的
這個值也許對於不同公司產品也有不同。
如果是背景信號,那麽隨便測,都會“找到”病人。
並且一個人永遠不會測量為陰性,因為再測幾次,就隨機到陽性了。
同樣,把PCR設置到20, 國外也會很快清零。哈哈, 整個一筆糊塗賬。
講話要有根據,不要陰陽怪氣。你說的有些人是誰?
老天真 發表評論於 2022-01-27 22:17:30
有些人巴不得中國陽性病例更多才好呢,這樣他們就可以說“中國的清零防疫失敗了”。如果中國把陽性診斷標準,提高到國際平均水平,陽性感染者的數字一下就降低十倍以上,這會讓很多國家麵子上難堪。美國那個懷疑中國發病統計數字的理工科教授,可能衝到老朱家裏去吵架。