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中壇網友八卦時,小顏團隊在貢獻

(2019-11-21 03:03:01) 下一個

中壇的網友喜歡八卦,聊天,無可厚非。畢竟人有社會需求,交友聊天解悶是人之常情。 今年聊天八卦的主題之一是顏寧。 不但對各種日常話題如婚姻,顏值,師承,任職等各個方麵無所不聊, 還插手到人家的專業, 諄諄教導,顯得無比關心,但還是不願承認,來幾個who cares?。  更對小顏提出了更上一層樓的要求, 要求她對網友有問必答。 特別是某博士問了個生化專業本科生級別,其他專業GRE閱讀理解級別的問題,在自己沒做功課的前提下問了過去,人家耐著性子回答了, 自己還不認可,不求是研讀,耐心思考, 反而先入為主,繼續追問, 被嗆了一句,於是在壇子裏掀起了軒然大波 。 更有好事者去騷擾人家院校,拷問跳槽的事。 人家小顏沒把自己當回事,默默做研究, 同時幫其他院校培養人才,是好事者自己總自甘狗仔隊,不看別人的研究,自己站在道德製高點上,專八卦人家的長短。 小顏科普與群眾見麵也成了詬病。 

中壇網友自己把時間花在這些八卦, 並對小顏恨鐵不成鋼的期間,小顏及其團隊默默地在做著自己的貢獻,在2019年的迄今11個月以內,至少發表了6篇論文(文獻1), 其中5篇CNS正刊,另一篇是Nature的子刊 (文獻2)。今天就從這篇不起眼的Nature子刊聊起。

一 葡萄糖轉運蛋白結構對癌症研究與治療的貢獻。

癌細胞由於需要快速生長而偏好不需要氧氣的糖酵解,而不是一般細胞的有氧循環(瓦氏效應),於是需要大量攝取葡萄糖,也就需要大量表達GLUT1和GLUT3--小顏研究的核心之一。 那麽抑製癌細胞的 GLUT1和GLUT3就可能成為殺死癌細胞的手段之一。

顏寧團隊從2012到2018做了蛋白結構的準備工作,2019發表了這篇根據蛋白結構,改造了細菌糖轉運蛋白XylE,將其固定在麵向細胞外,或者細胞內的構象,證實了XylE兩種構象的葡萄糖結合位點不對稱的親和性。由於XylE與GLUT的相似性,加上前人的研究,他們推測人體糖蛋白也有著一特征。 利用這一特征,他們會繼續研究如何分別篩選兩種構象下的抑製物, 也就是潛在的藥物。 通過結構篩選藥物, 這是在癌症研究領域非常有意義的事。  

二 小顏是否投機取巧

某位博士生(以下簡稱博士生)曾經對顏寧工作做過整體評價(文獻3),這個評價也經常被奉為聖典,來證明顏寧投機取巧。 怎麽投機取巧法? 該博士認為,因為隻要是搞晶體結構的文章就可發CNS, 顏寧團隊就是剝削中國廉價的博士勞動力,一個蛋白換一個蛋白地結晶,反正改改條件結晶出來就是CNS. 還說實驗條件就是不停試出來的。

1。人體葡萄糖蛋白結構,機理與應用一直是顏寧的研究方向之一。

博士生的檄文暗示小顏為了發CNS盲目地換蛋白.  實際上小顏從2012到2019至少發了7篇這個方向的論文。換蛋白也是從細菌換到人體,並解析了人體多種糖轉運蛋白,幾種構象的結構。 更重要的是, 這些轉換並不是盲目為發文章而換的。 他們對蛋白及構象的選擇很有針對性,策略性與方向感。並做了開創工作以後,把稍微簡單點的細枝末節留給其他實驗室,自己繼續做開創性的工作。 這其實就是科學大家應該做的事。 

2。小顏團隊啥實驗都做。 

博士生用自己道聽途說的“所知”譴責顏寧的學生隻要賣苦力,結晶, 不用讀論文。 我不知道這位博士生到底有沒有讀顏的論文,如果他讀了顏2014一文(文獻4),就該知道顏團隊能成功結晶人體糖蛋白不是傻試出來的,而是通過查文獻,Critical Thinking發現的新途徑。 

並且小顏的文章篇篇有生化實驗,這篇有關癌症的文章更是設計生物物理實驗來達成實驗目的。 有行外人說冷凍電鏡是超越晶體的未來,說莊小威是未來。先不說晶體與冷凍電鏡在目前來講各有所長 (文獻5), 實際上顏寧自己正在應用冷凍電鏡 (文獻1)。

實際上,做科研,特別是“大家”做科研,雖然用自己擅長的手段容易出成果,但是如果囿於實驗手段就限製了自己。 對“大家”來說,最重要的是研究的方向是什麽, 解決什麽問題。 針對要解決的問題,尋求合適的實驗方法, 該用晶體用晶體,該用冷凍電鏡用冷凍電鏡,而不是本末倒置地用手段定研究方向。 從博士生的對一點的的井底之蛙的評論,他的境界遠遠達不到做PI的程度。博士生還請自己提高境界吧。

至於小顏不重視培養下一代人才之類的話,生物界本來就是僧多粥少,一將功成萬骨枯。而小顏的團隊中的傑出代表Deng D.的成功 也否定了這一結論,請看他與顏寧合作的綜述文章(文獻6)。 

三 為科學家正名。 

從顏閻之爭到地球暖化,吃瓜群眾中總流傳著對科學家的不信任。這不但包括中壇以及其他文學城網友,還有很多美國大眾。 主要的推動力是美國煙草,糖業,石化產業長期用煙草商策略攻擊誹謗科學與科學家 (文獻7) 。 在此特別要為科學家正名。 

科學是個吃力不討好的職業。 堅持在這一行幹的,很少是為了錢的。雖然行行出狀元,行行也出小人, 科學這一職業也不例外,總有那麽幾個壞典型。 但是如果從事科學的人,想賺錢養家享受,轉行是相對容易的事。 留下來的都是對科學無比熱愛並嚴肅認真的人。 作為群體,他們是道德標準要求較高,人品也較高的人群。 我雖然離開了科研,但是對堅持到底人無比敬佩。 這也是我為什麽見到在沒有事實依據, 或者依據不足的條件下褒貶科學家必須捍衛事實與科學家的原因之一。

科學論文有嚴格的審查程序。 科學家都有高傲的骨感,審稿可以說是個互相挑刺的過程。一篇文章從實驗設計,完成,初稿,完稿幾經刪改,到最後發表是非常不容易的,聚集著眾多科學家的常年的心血。 請不要再在沒有根據的情況下,褒貶科學家。也不要沒有必要地去騷擾, 讓他們安心研究。 請多關注他們的研究成果,多給他們支持!     

四 文獻。

1。顏寧實驗室甄選文章:https://molbio.princeton.edu/people/nieng-yan

2。Jiang X, Wu J, Ke M, Zhang S, Yuan Y, Lin JYe, et al. Engineered XylE as a tool for mechanistic investigation and ligand discovery of the glucose transporters GLUTs. Cell Discov. 2019 ;5:14. 

3。https://argparse.github.io/2018/01/04/%E5%85%B3%E4%BA%8E%E6%96%BD%E4%B8%80%E5%85%AC-%E9%A2%9C%E5%AE%81%E7%9A%84%E7%A0%94%E7%A9%B6/

4。Deng D, Xu C, Sun P, Wu J, Yan C, Hu M, et alCrystal structure of the human glucose transporter GLUT1. Nature. 2014 ;510(7503):121-5. 

5. Shoemaker SC1, Ando N1.  2018 Jan 23;57(3):277-285. X-rays in the Cryo-Electron Microscopy Era: Structural Biology's Dynamic Future.

6。Deng D, Yan NCrystallization and Structural Determination of the Human Glucose Transporters GLUT1 and GLUT3. Methods Mol Biol. 2018 ;1713:15-29.

7。Oreskes, Merchants of Doubt

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評論
Stegy223 回複 悄悄話 好文!

特別值得一提的是 Cell Discov. 2019
"改造了細菌(木)糖轉運蛋白XylE,將其固定在麵向細胞外,或者細胞內的構象,證實了XylE兩種構象的葡萄糖結合位點不對稱的親和性”。有趣和精湛的工作! 讓人想起了老閻關於小顏在細菌木糖轉運蛋白XylE 和人葡萄糖轉運蛋白GluT上搞 “雞鴨大拚圖”的指控。

SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'valore' 的評論 :

用不完美否定實際哈。 那請你拿出比發論文更過硬,合適的指標。 沒有的話,就隻好依據科學界的現有標準了了。

或者你能具體用論據指出小顏論文哪點質量不夠高嗎?

valore 回複 悄悄話 CNS不是神。裏麵有問題的文章,沒大用的文章多了去了。還有專門文章分析chaperone effect in scientific publishing. 天下文章千千萬,哪有那麽多ground breaking work. 在和平年代又競爭激烈的環境下,很多稿件對於期刊都是屬於可上可不上的。這時圈子,關係便起到很大作用。明星們當然都是成功人士,人生贏家。不過,這與真正的好工作並不一定正相關。另外,雖然引用率也不是萬能,工作的引用率也算個參考指標吧。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'pconline' 的評論 :

抄襲這事早已從技術到引用常規各個方麵都論證過沒有這事了。 早該歇息了
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'valore' 的評論 : o

科學家貢獻的主要指標就是發文章。 大期刊不是你為了買8名利想發就發的。 沒有水平,沒有貢獻怎麽發?
pconline 回複 悄悄話 抄襲潤濤閻的成果怎麽算?顏寧不是傍上施一公她能有今天?學術圈裏像她那樣資質的一大把,靠取巧算計+臉皮厚出名有什麽好嘚瑟?天天show off,和網紅一個德行
valore 回複 悄悄話 現在的科學家都快成貶義詞了。有爭議的人分為兩類。第一類成名的,發大期刊的,反映的是名利的欲望,靠著運作手段一路往上爬。這種人應該叫明星。研究除了發文章,對科學前進並無實質性貢獻。更糟糕的是造假,不能重複類的,那就是有academic integrity問題了。第二類,研究還是有用的,貢獻有,但本人人文素養比較弱。拿無聊當有趣的已經不算大事。當然術業有專攻,人品完全是另一回事。能兩角俱全的,實屬鳳毛麟角。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 '北美_原鄉人' 的評論 :

說的是正道
北美_原鄉人 回複 悄悄話 文章說得對。我納悶的是城中有個把的教授專家學者怎麽天天有那麽多的時間去琢磨人家的東西,並偏好去扒人家的糞。過去在大學讀書和研究的10年中,從未聽說美國教授學者之間互相扒糞的事情。正確的科學研究和學術文化的風氣和規範應該是:你不服氣或者懷疑人家的成果,你就應該有本事做出更多的成果來超過人家。這個道理很簡單:扒別人的糞一點不會讓你的科研搞的更有成果,當然也不會讓你更有名氣。
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'Fanreninus' 的評論 :

我一直在壇子裏告訴他們, 搞清事實再評論
SwiperTheFox 回複 悄悄話 回複 'BeijingGirl1' 的評論 :

謝謝!
BeijingGirl1 回複 悄悄話 回複 'Fanreninus' 的評論 : 我到那貼發言了。 雖然我不知到吵架的具體細節。 但我相信你。 哈哈。 有時候需要開口。 不然就像武漢那輛公共汽車, 都不出聲, 全車人掉進江裏。

謝謝你的信息。
Fanreninus 回複 悄悄話 回複 'BeijingGirl1' 的評論 : 看了你說的那篇文章,不知所雲,連她兼職的學校的名字都寫錯了,應該是UNSW,再說人家那上麵是學校管版簡介,清清楚楚地寫著那是一個榮譽職位。自己沒有搞清狀況,還說人家是腳踏幾隻船。
BeijingGirl1 回複 悄悄話 好文章! 好像看到一文的標題說要愛羽毛的,說的是顏寧。 一個人要出來做事, 特別是有點“成就”之後,總是會被個別人指指點點。 因為人無全人, 也因為有個別心理陰暗的小人。 正常人有異議會平和探討,求同存異; 但病態者會一直無中生有, 死纏爛打。 尤其是網絡上, 躲在ID後麵, 更是如此。 對這種人講道理都沒用, 這就是為什麽需要法律的幹涉。

希望顏寧越戰越勇。 這就是對耍賴的人最好的回應。
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