被趕出家園的猶太人流散到了世界的各個角落。許多人在波斯人統治的薩珊王國(Sassanid Empire)落腳，因為這裏的統治者傳承了波斯人的傳統，對猶太人采取包容的政策。另一個猶太人的主要流散地是羅馬。羅馬的猶太人大部分是作為戰俘被押到這裏的。這些猶太人的後代逐漸流散到羅馬全境乃至整個歐洲。羅馬統治者對流散到各地的猶太人並沒有歧視，允許他們保留自己的的文化傳統和宗教信仰。 可是在基督教統治歐洲之後，猶太人就開始遭到無情的迫害。公元四世紀羅馬皇帝君士坦丁大帝（Constantine)對猶太人發布了許多禁令，比如不準作為有效證人，不準建猶太會堂，不準與羅馬人居住，等等。這些禁規和歧視條款後來被歐洲各國傳承和發展。後來狄奧多西一世(Theodosius I)將基督教定為國教，其他一切宗教，包括猶太教，被視為異教加以禁止。
君士坦丁和狄奧多西的做法違背了耶穌的初衷。耶穌認為所有相信上帝的人都是兄弟姐妹，號召人們將愛心播撒給所有人。耶穌死後，他的門徒稱自己為基督徒，奉耶穌為上帝派到人間替人類受難的第一個彌賽亞。教徒們將耶穌所倡導的博愛和公正帶到了世界的各個角落。可悲的是，當基督教被羅馬的統治者尊為國教，教徒們逐漸轉向狂熱而偏離了初衷，基督教會的性質發生了徹底的變化。隨著西羅馬帝國的崩潰，羅馬的基督教會（後稱天主教會以便和東正教以及基督新教區分）獲得至高無上的權利，一步步走向墮落。歐洲就此進入了中世紀，而作為異教徒的猶太人則成了這個黑暗時代的犧牲品。
對中世紀錯綜複雜的曆史，“猶太人惹了誰”的作者並沒有作清晰的說明。在網上查閱了這段曆史，總結出以下要點。（1）四世紀末，也就是狄奧多西一世駕崩以後，羅馬帝國分裂成東、西兩個羅馬帝國。公元476年，西羅馬帝國被北方的蠻族所滅，至使羅馬教廷取代了羅馬皇帝的統治地位，標誌著中世紀的開端。（2）西羅馬帝國滅亡以後，東羅馬帝國成了羅馬帝國的正統。在史學上被稱作拜占庭(Byzantine) 帝國。拜占庭延續了君士坦丁大帝對猶太人的一係列禁令，與此同時，羅馬教廷在西羅馬地區也加強了對猶太人的打壓和迫害。（3）拜占庭帝國和東麵薩珊王國的波斯人為爭奪地盤打了一百多年的仗，戰爭持續到公元七世紀，兩國均元氣大傷。此時以伊斯蘭教為國教的阿拉伯帝國迅速崛起。阿拉伯帝國滅掉了薩珊王國並打敗了拜占庭，占領了耶路撒冷以及整個中東地區。(4）阿拉伯帝國的統治者對猶太教采取寬鬆的政策，打破了羅馬人的禁令，準許猶太人遷入耶路撒冷居住。猶太人得以在阿拉伯人（即穆斯林）管轄的廣大區域安居樂業。（5）1096年羅馬教皇發動了第一次十字軍東征。十字軍東征共九次，旨在從穆斯林手中奪回對耶路撒冷以及中東的控製權（耶路撒冷也是基督教的聖地）。狂熱的十字軍在一次次的“聖戰”中瘋狂地洗劫和屠殺了沿途和耶路撒冷城中的穆斯林和猶太人。（6）在中世紀的後期（14世紀），饑荒和鼠疫肆虐歐洲。信奉基督教的民眾相信世界末日來臨了，並認為作為異教徒的猶太人是嗜血的魔鬼，是瘟疫的傳播者。成千上萬的猶太人因此被活活燒死。
從中世紀直至近代猶太人在歐洲遭受的敵視有多方麵的原因。首先是宗教上的對立。其中有三個方麵：（1）基督教的《新約》和基督耶穌一直為猶太教所否認，這是基督教占統治地位的歐洲社會所不能容忍的。（2）猶太人被說成是出賣耶穌的猶大的後裔（這純屬無稽之談）導致了一種強烈的宗教複仇情緒。（3）猶太人自認為是上帝的“特選子民”。這種價值觀與基督教和世俗社會都是不相容的，十字軍東征時代就提出了“幹掉一個猶太人，以拯救你的靈魂”的口號。反映了猶太和基督對立的價值觀已經演變成了暴力性質。宗教之外還有經濟上的因素。由於在大流散之後失去了土地，猶太人之中的許多人靠經商為生。猶太商人迅速積累了財富。因此猶太人被中世紀以農耕為主的普通民眾看作是貪婪的小人。由於在政治上沒有地位，猶太人被統治者當作搖錢樹任意盤剝。第三是文化上的隔離。自從君士坦丁大帝下令禁止羅馬人和猶太人一起居住，猶太人多數居住在和外界隔離的社區。這種隔離使猶太人變得保守、抱團，而主流社會因此對猶太人就更加排斥，如此惡性循環，於是猶太人更加與社會隔絕，外部世界對於猶太人的態度也就越來越敵對，由此發展到中世紀對猶太人的大規模屠殺。反猶主義一直延續至今，尤其在二戰期間，德國納粹屠殺了600萬猶太人。
