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6.生命信息的中轉,RNA的轉錄

  DNA隻有遺傳作用,最終執行生命功能的分子是蛋白質,蛋白質使我們的模樣像我們的父母。這就是說,DNA的遺傳信息必須轉變為蛋白質的氨基酸順序才能起作用。

  6.1電報通信與遺傳密碼1943年,偉大的量子物理學家薛定諤在其名著《什麽是生命》一書中提到了“遺傳密碼”這個概念,他把遺傳物質到生命功能表現的過程看作一個通信過程,也就是說從DNA到蛋白質是一個通信過程,這個過程采用電報通信方式。

  我們在電報通信中要使用密碼,我國電報密碼一般是4

  個數字決定一個漢字,這就是四聯體密碼。我們很容易算出,從0到9的十個數字,每4個決定一個漢字,共可決定104個漢字。

  在生命的遺傳通信中,核苷酸相當於數字,共4個,氨基酸相當於漢字,共20個。遺傳通信的密碼是幾聯體呢?

  假設是單聯體,即一個核苷酸決定一個氨基酸,那麽4種核苷酸隻能決定4個氨基酸,顯然是不夠的;假設是二聯體,

  可決定42=16種氨基酸;假設是三聯體,可決定43=64種氨基酸,夠用了!還有剩餘,這沒關係,隻怕少不怕多。多了的話可以多個密碼決定一個漢字,如123和124決定同一個字。這樣幾個決定同一個字的密碼被稱作同義碼。

  這一想法首先由蓋莫夫提出來,沃森-克裏克發表他們的劃時代的文章後同蓋莫夫通過信,蓋莫夫提出了上述想法,時值1954年。蓋莫夫是一位物理學、著名的科普作家,

  他還是宇宙大爆炸理論的提出者。

  到1964年,20種氨基酸的密碼全部破譯出來了,其中有一個起始碼,三個終止碼(不決定氨基酸,相當於句號)。

  尼侖伯格・柯納拉和霍利因破譯遺傳密碼的功勞而榮獲1968年的諾貝爾生理醫學獎。

  6.2遺傳信使mRNA

  問題又來了。我們知道DNA存在於細胞核中,不能自由出入細胞核,而蛋白質是在細胞質中合成的,那麽DNA遺傳信息如何從細胞核傳到細胞質中呢?我們知道電報是通過電波或人傳送的,由此類推,細胞中也一定有一種物質把遺傳信息從細胞核傳到細胞質中。這種物質必須有兩個特點:第一,能出入細胞核,也就是說在細胞核和細胞質中都能找到;第二,它能按某種規則把遺傳密碼抄錄下來。第二個特點更重要。

  法國噬菌體遺傳學家雅各布和莫諾於1960年提出這一想法,認為這種物質應該是一種RNA,它們被稱為信使RNA(mRNA),是遺傳信使的意思。我們前麵已介紹了RNA,它也是一種核酸,它可以根據查伽夫原則與DNA單鏈互補配對合成。不過與A配對的不是T,而是U,因為RNA中隻有U而沒有T。

  1961年,布倫納、雅各布和梅塞森用實驗證明了這一想法,並找到了mRNA。

  6.3RNA的轉錄過程mRNA是遺傳信息的傳遞者,是遺傳信息的中轉站,遺傳信息從DNA到mRNA的過程被形象地稱為轉錄,有抄錄或轉抄的意思。

  RNA轉錄與DNA複製一樣,遵循查伽夫原則,不過這一原則的內容已稍有修改:A-U,C-G,T-A,G-C,左邊是DNA的核苷酸或堿基,右邊是RNA的核苷酸或堿基。

  RNA的轉錄由一種叫做RNA聚合酶的天使來執行,它由五個亞基(多肽鏈)構成,α2βσ′又稱全酶。α2β′是酶的核心部位,稱核心酶;σ是轉錄的起始因子,σ是希臘字,形狀很像我們交通警察指示前進方向的手勢。σ因子是轉錄的先遣者,它可以在DNA雙鏈上找到特殊的結合部位,這個部位是轉錄的起點;一旦σ結合到DNA上,核心酶便仿佛看到了指引前進的信號(手勢),便見機行事,迅速結合到DNA雙鏈上並解開DNA雙鏈的氫鍵。這樣結合著的全酶,RNA轉錄並不能開始,σ因子立即意識到責任在自己,

  它要是再留在上麵就會阻礙整個行動,使得前功盡棄,因而它知趣地退居二線。於是RNA的轉錄轟轟烈烈地開展起來。

  核心酶推動RNA合成前進的方向也隻能沿DNA模板鏈3′→5′進行,因為DNA雙鏈隻能有一條鏈轉錄,所以它沒有交通大隊長遇上的難題,也就是說隻有一條行人道,而且是單行道。有轉錄功能的DNA鏈稱為有意義鏈,沒有轉錄功能的另一條DNA鏈稱為無意義鏈。這種轉錄方式稱為不對稱轉錄。

  轉錄的RNA比DNA分子要短得多,也就是說,它隻能轉錄DNA的一部分就得停止下來。轉錄終止不是自動的,需要一個特殊的因子參與,這個因子就是ρ因子,ρ也是希臘字母,它的形狀很像交通警察阻止車輛通行的手勢。ρ因子在轉錄終止時結合到核心酶前麵,核心酶見到“路障”,立即從DNA上撤離下來,合成的RNA也跟著撤離下來。至此,一個RNA分子合成完畢。

  6.4RNA轉錄後加工RNA剛轉錄出來並沒有生物活性,這種RNA叫做前體RNA。前體RNA需要加工才能變為成熟的RNA,成熟的有生物活性的RNA分為三類:一類是我們已經熟悉的mRNA;一類是“譯碼器”RNA,翻譯蛋白質的譯碼器就合成蛋白質的場所核糖體,因此這類RNA又被稱作核糖體RNA,簡寫為rRNA;還有一類是譯碼時查找字典用的RNA,叫做轉移RNA,簡寫為tRNA。原核生物和真核生物的RNA加工方式不同,而它們的三類RNA的加工方式又各不相同。

  原核生物的rRNA一麵轉錄一麵加工,一個前體大分子被裂解為兩個小的rRNA分子,然後,它們兩端一些不必要的核苷酸被酶切除。這樣還不行,裸露的末端很容易受到損傷,就像我們赤膊易受傷害一樣,因此它必須帶上一頂帽子或穿上衣服,也就是某些堿上被加上一個叫甲基的化學基團。

  原核生物的tRNA常常是幾個分子連在一起轉錄,或者與mRNA分子連在一起轉錄,成為一個大前體RNA;然後在一種叫RNA內切酶的酶作用下切成單個的tRNA分子小前體,最後在叫做RNA外切酶的酶作用下逐個切除多餘的核苷酸。這樣還不行,還得在3′端統一加上CCAOH三個核苷酸,以表明它們是tRNA的身份。

  原核生物mRNA一般不需要加工就可以直接投入使用,成為蛋白質合成的模板。當然,也有許多個mRNA分子連在一起轉錄的,這就隻需將它們切離開來即可。

  真核生物rRNA前體可以切離成三個小的rRNA分子,每大切一次後要經過一次小切,切除不必要的附加核苷酸。

  真核生物tRNA也是成簇轉錄的,加工過程類似於原核生物,但兩個tRNA分子常常有不必要的居間序列,必須首先切除才行。

  真核生物mRNA的加工要比原核生物複雜得多,它的前體RNA分子極大,被稱為核內不均-RNA,寫成hnR-NA。hnRNA壽命很短,幾分鍾後至1個小時左右就會有一半被分解掉。hnRNA變成mRNA有四個步驟:第一步是在5′端加上一個帽子,這個帽子不但可以保護自己,而且有利於在翻譯蛋白質前被識別作為模板,就像我們在人群中戴一頂帽子可以讓我們要找的人找到自己。第二步是在另一端(3′端)加上一條尾巴,這樣可為進一步加工提供信號。

  第三步是在RNA內切酶作用下(識別尾巴)將hnRNA剪斷,去掉中間不必要的部分,然後把剩下的RNA接上(第六章還將詳細描述這一過程)。第四步就是某些核苷酸甲基化,猶如穿上衣服以防傷害。整個hnRNA隻能加工成一個mRNA分子,這一點不同於原核生物。

  至此,轉錄過程才算真正完成。在這一有著簡單主題的複雜過程中,我們再次感受到了生命的嚴密組織性和工作的高效性,這是我們曆史上任何一種社會形態所不及的。

  mRNA是幾種RNA中最重要的一種,從原核生物和真核生物對它的加工看來,可以看出進化的趨勢。低級的原核生物mRNA幾乎不需加工就能投入使用,而且一次轉錄許多個分子;而高級的真核生物每次隻能轉錄一個mRNA分子,要經過複雜加工才成。聯係它們的結構就可以理解這一點,原核生物結構簡單,不可能複雜加工,也正因為簡單,它麵臨環境的挑戰要比真核生物強得多,它隻有依靠快速和大數量才能做到保存自身,原核生物的代價是慘烈的。真核生物則可以利用自己複雜的結構精深地加工,以防環境的傷害,保證其效率和穩定。生命的進化猶如社會的發展,會越來越優秀、先進和適應變遷。

  
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