隱蔽戰線鬥爭一直受到黨中央的重視。1935年10月,紅軍到達陝北後,周興從軍隊保衛部門轉到政府保衛部門,於1936年2月擔任西北政治保衛局局長。西北保衛局是中共的最高情報保衛機構,行使原國家政治保衛局的職責,其權限集國家政治保衛局和西北政治保衛局兩家權力於一身,相當於集現在的公安部、北京市公安局、中央警衛局、國家安全部的權力於一身。周興手握重權,負責西北蘇區和紅軍中的肅反、保衛工作。1937年9月,西北政治保衛局更名為陝甘寧邊區政府保安處,周興任處長,同時還擔任了延安衛戍司令部副司令員。周興的保安處有個裝備精良的保安團,幹部都是身經百戰的老紅軍,戰士百分之八十是黨員。三個保衛營分別負責警衛黨中央、軍委總部和地方政府。延安的保安團,就是今日武裝警察部隊的前身。周興擔任保安處長一職長達12年,主要是負責陝甘寧邊區的鋤奸、肅特、保衛工作。在延安隱蔽戰線鬥爭史上,邊區保安處發揮了重要作用,成為一把令敵人聞風喪膽的利劍。據統計,從1941年到1944年,陝甘寧邊區周圍密布著國民黨特務機關53個,特務據點51個,潛入邊區的特務700多人。就在這種複雜的情況下,周興毅然擔負起打擊敵人,維護治安、保衛人民、保衛黨中央、保衛毛澤東等中央領導人的重任。他依靠黨的領導,運用群眾路線與專門工作相結合的方法,成功地破獲了許多特務間諜案件,粉碎了敵人一次又一次的破壞陰謀。例如,揭穿“進步青年”的陰謀,迫使殺手潛逃台灣,“化敵為我服務”、搗毀軍統“反訓班”、“以夷製夷”巧施連環反間計、喬裝“中央社記者團”驅逐國民黨頑固派政權等傳奇案件;破獲潛入我中央機關食堂,企圖毒害毛澤東等中央領導人的特務分子,破獲潛伏在陝北的國民黨特務網,捕獲在勞山襲擊周恩來的土匪頭子馬老五;派出地下工作人員利用各種社會關係,打入蔣幫的要害部門,及時獲取重要情報等等。為保衛延安、保衛黨中央、保衛毛澤東等中央領導人做出了不可磨滅的貢獻。
周興在對敵鬥爭中,十分重視宣傳和組織群眾,走群眾路線。他親自布置專人編寫印發了幾種群眾鋤奸保衛的小冊子,出版了鋤奸畫報,在群眾中普遍建立了鋤奸保衛組織。據1939年11月鋤奸組織統計,當時有群眾哨站1004個,鋤奸黨員4859人,鋤奸團員129523人。從1937年1月到1946年1月,查獲漢奸特務100多名,便衣偵探95名,土匪50餘名,確保了黨中央在延安13年的安全,創造了人民公安事業的曆史奇跡。周興抓延安社會治安和社會秩序,維護社會穩定,改造犯人的成就,曾受到邊區政府的表彰和前往參觀的國際友人的高度讚揚。延安的老百姓稱讚保安處的警察是“人民警察”。毛澤東曾說,延安的警察不是世界第一,也是中國第一。
1947年胡宗南進攻延安前夕,周興部署保安部門撤離延安,跟隨黨中央機關在陝北一帶活動,竭力保衛中央機關和中央領導人的安全。他以高度的責任感去布置和完成每一次重大的保衛任務。例如,毛澤東在米脂縣活動的時候,要過一座獨木橋,橋下是湍急的河水,此時天色已晚,毛澤東準備過橋,周興帶著幹部、戰士擔任先頭警衛,由他帶人先作試探,幾個戰士一到橋上,橋就坍塌了。在這緊急時刻,周興立即組織戰士潛入水中連夜搶修,保證了毛澤東等中央領導人安全過河,到達目的地。
撤離延安時,周興帶領一個騎兵警衛排,一直在毛澤東身後護衛。毛澤東在山溝裏和敵人“轉磨”,胡宗南的部隊對毛澤東和中央“昆侖縱隊”包抄合圍時,周興帶領遊擊隊在外圍活動,與劉輝山的警衛部隊緊密配合,全方位保衛毛澤東和中央首腦機關,多次化險為夷。
為了增長保衛才幹,周興酷愛學習。他刻苦學習的精神曾受到毛澤東的表揚。在抗大做報告時,毛澤東曾說:“愛學習的模範,我看眼前就有兩個,一個老幹部、一個小幹部,老幹部就是邊區的保安處處長周興,每天一大早洗個冷水澡就到寶塔山上去看書;小幹部就是你們抗大的政治部主任胡耀邦,每天晚上12點房間還點著燈,做麽子事?學習呢!這種精神好麽!我看值得提倡。”