武則天臨朝稱製,並進行了一係列改朝換代的活動,引起了政治上失意的一些舊臣的反抗。武則天並沒有手軟,她采取了打擊並鏟除李氏家族勢力的方法,掃除了自己皇權路上的所有障礙。
文明元年(684年)九月,被武則天貶黜的柳州司馬徐敬業等人,公開打出反抗武則天的大旗,於揚州起兵。徐敬業是大唐開國元勳,已故功臣英國公李世勣的孫子。武氏家族得勢以後,徐敬業等人在官場中受到排擠,心中憤懣不平。此時,正趕上他的好友給事中唐之奇、長安主簿駱賓王、詹事司直杜求仁也被貶官免職。這些儒家文士都有“以天下為己任”的抱負,他們痛恨武則天權力的惡性膨脹,認為如果再任其發展下去,不但國將不國,連他們自己的身家性命也會被碾成齏粉。他們已經被逼得走投無路了,於是鋌而走險,揭竿而起。徐敬業襲用被廢中宗李顯的年號“嗣聖”,並找來一個長得很像中宗李顯的人,假稱中宗就在起義軍中。這樣一號召,十幾天內成千上萬的民眾投奔起義軍,號稱有雄兵十萬。起兵開始,著名詩人駱賓王起草了《討武氏檄》,為起義大造輿論,文章聲調鏗鏘,文思如長江大河,洶湧澎湃,有一種咄咄逼人、銳不可當的氣勢,傳布各州縣,深入人心。對武則天的名聲造成了損害。麵臨這樣重大的軍事危機,武則天內心非常恐慌,她緊急調動30萬大軍,任命李孝逸為揚州道大總管,率軍從洛陽出發,沿運河汴水南下平叛。徐敬業義軍的領袖幾乎都是文人書生,他們並沒有打仗的經驗,更缺乏總攬全局、目光深遠的謀略,這就注定了他們的失敗。武則天追削徐敬業祖先的官爵,把他祖父李世勣的屍骨從墳中挖出,進行戮屍。徐敬業聽說後誓與武氏決一死戰。但在武則天強大的軍事攻勢下,徐敬業、駱賓王接連敗退,由於手下的部將叛變,投降了官軍,這一場起義失敗了,徐敬業也被部將殺害。一個月以後,10萬義軍煙消雲散,徐敬業等人的頭都掛在洛陽城樓上示眾,武則天迅速平定事態,度過了這場災難性的危機,顯示了自己的政治才幹。
就在揚州平叛戰爭最緊張的時候,武則天向宰相中書令裴炎征求對策,裴炎不但沒有積極組織平叛,反而說:“皇帝年長,不親政事,這給那幫小子提供了借口,若皇太後返政於皇帝,則叛亂不討自平。”這明擺著是乘外亂之際要挾武則天還政給睿宗李旦,引起了武則天的憤怒,她看出裴炎作為宰相,有獨斷專行之勢,要她返政睿宗,不過是為了自己的政治野心。武則天的鐵血個性怎麽會容忍裴炎的存在,於是,她以裴炎與徐敬業暗中勾結、有謀反之心為由將其處死。裴炎死後,武則天開始對朝臣及宰相的人選進行調整。朝廷上有一些同僚積極讚同裴炎意見,見裴炎下獄,就出麵為他疏通。鳳閣舍人劉景先、鳳閣侍郎胡元範等人都證明裴炎決無謀反之心,這使得武則天堅信裴炎在朝廷上結黨,更要除之而後快。劉景先、韋弘敏、郭待舉先後被罷,武則天增補蹇味道、李景諶為宰相。李當月被降為司賓少卿,又補沈君諒、韋方質、武承嗣、韋思謙等為相。不久,武、崔、蹇又被免去宰相職務。武則天將胡元範流放瓊州(今屬海南)。時任單於道安撫大使的左武衛大將軍程務挺也因裴炎一案株連,被武則天問斬。光宅元年(684年)和垂拱元年(685年)兩年間,宰相的任免發生了很大的變化。這都是武則天鑒於過去在與李賢的爭奪中外廷失控的教訓,著力權衡、調整宰相,重新建立自己的親信輔臣的結果。
史載高祖李淵有22個兒子,太宗有14個兒子,高宗有10個兒子,這還不算眾多的公主。以這些李氏宗親為中心,組成了眾多的家庭,當然又有與之相連的堂、姑、表等親族。武則天要廢掉大唐,就必須把這些以李唐正統自居的宗室貴族的世襲權力剝奪,鎮壓他們的反抗,將他們一網打盡。這注定是一場殘酷的、你死我活的鬥爭。
武則天對待這些皇族宗室的手段是非常有策略的。當時高宗健在,她初做皇後,隻打擊庶姓中的政敵,如長孫無忌、王皇後的親族等,而對於李唐皇族采取了懷柔政策。高宗駕崩武則天臨朝攝政時,為了防止宗室的反抗,除了澤王李上金、許王李素節被幽禁在外地,其餘人等都被授予宮廷中最高的官銜。同時,武則天又授給他們兼職的官銜,讓他們出京到外地為官。這些人有職無權,外派到地方去做官,可以防止李氏宗室中人在京城結成死黨。當時,太宗皇帝的兄弟韓王李元嘉、霍王李元軌,常樂公主以及宗室諸王被朝廷的一係列告密捕殺之風攪得惶恐不安。他們知道,武則天遲早要下手將他們鏟除。洛陽曾一度有消息稱武則天欲將李氏家族一網打盡。武則天將舉行拜洛大典,並命諸王前去參加,一場屠殺已在所難免。唐室王公之間彼此密書往來,謠言四起,除了在“如欲活命,勿來京都”一項上達成了一致意見之外,似乎也沒有什麽更好的應對辦法。起兵征討的信號是由韓王李元嘉之子首先發出的,隨後,他又偽造了睿宗的璽書:“朕被幽禁,爾等宜各發兵救我”。這封用暗語寫成的密信與偽詔一起很快就送到了越王李貞的手中。李貞之子琅琊王李衝性情急躁、魯莽,他立即致函各王迅速進兵京都,自己則帶領剛剛招募來的五千兵勇率先攻打濟州。當此消息傳到神都洛陽,武則天並沒有張皇失措,她命張光輔為督軍節度,率領十萬大軍西出洛陽,平息諸王之亂。七天之後,琅琊王李衝在濟州兵敗身死。他的戰死使越王李貞、常樂公主等人決定孤注一擲,倉促起兵。不到十天,越王李貞兵盡糧絕,在豫州城外自殺身亡。至此,僅十餘天的諸王之亂如曇花一現,即被武則天平息。
李唐宗室的叛亂,在如此短暫的時間內就被平息使武則天高興不已,她看到李唐王朝的確是氣數已盡了。盡管李唐宗室族人打出了匡複李唐的旗號,但臣民們竟無人響應,這使武則天清楚地看到了人心所向。在武則天拜洛大典舉行的同時,一場殺戮也在秘密進行中:霍王李元軌、紀王李慎在流放途中被殺;東莞公李融及江都王李緒被斬於曹市;濟州刺史薜顫、其弟薛緒被殺後,屍體暴曬示眾;常樂公主在獄中飲鴆自盡。在平息反叛的過程中,武則天追根刨底,凡參與謀劃的李氏王公個個伏誅,無一幸免。經過一番爭鬥,李氏諸王被誅殺殆盡,武則天的皇帝寶座已坐得更牢固,再無障礙。
武則天成功地平定了徐敬業的兵變與李唐宗室叛亂。這兩場動亂都沒能掀起多大的風浪,很快就被平息了,足見武則天在當時的政治格局中已占據了絕對的優勢,這樣,武則天更加快了前進的步伐。她一方麵不惜大興冤獄,任用酷吏,把當政的絆腳石一個個搬掉;一方麵又放手招官,以官賞為誘餌,吸引更多的人為己所用,為自己的武周政權呐喊助威。武則天恩威並施,氣勢奪人,一派順我者昌,逆我者亡的作風。一時間,朝廷內外唯唯諾諾,俯首帖耳。