馬南遺址位於西安市高陵縣榆楚鄉馬南村涇渭二河交匯處的台地上,屬新石器時代仰韶文化廟底溝類型遺址。
馬南遺址殘存麵積東西、南北各400米左右,文化堆積層厚2—5米。遺址南部已被北移的渭河衝毀。遺址內分布有密集的灰坑。發現采集有陶器和石器。陶器主要有泥質紅、灰陶和夾砂紅陶等。紋飾有繩紋、弦紋、錐刺紋、附加堆紋及黑彩圓點紋、弧線三角紋等。主要器形包括盆、罐、重唇尖底瓶等。石器主要有石斧、石刀等。
1982年5月29日,馬南遺址被高陵縣人民政府公布為縣級文物保護單位。
目前,遺址大部分被村落疊壓,破壞較大。