左宗棠指出:“甘肅一省,變亂十餘年,被禍慘烈,甲於天下。所以然者,回變與發逆、撚逆不同,而甘回與陝回起釁緣由又異,當時辦法未能苦心分明,遂致紛紜日甚,不可收拾也。陝回之禍,由於漢、回構怨已久,起釁之故,實由漢民,而匪回乘機構變,並敢戕害團防大臣,據地阻兵,法難曲貸。……甘回雖不如陝回之悍,然人數較多。自乾隆年間新教潛入內地,久懷不軌,詭謀秘計,在入室操戈,居心圖謀不軌,與國為仇,橫亙北數省,無所畏忌,是法所必誅,時不可緩者也。”
左宗棠認為陝回之亂源於漢回之間的矛盾,甘回之亂是宗教緣由要與大清為仇。(陝西漢回人數是七三,甘肅漢回人數是三七。)