1879年，中國第一所教會大學——聖約翰書院創建，1896年改稱聖約翰學校，1906年改稱聖約翰大學，有“東方哈佛”之稱。從哪裏走出了顧維鈞、宋子文、榮毅仁、鄒韜奮、林語堂、貝聿銘、張愛玲、周有光等等一大批頂級人才和國之棟梁。
基督教會和天主教會在中國相繼開辦了近20所各類大學和醫學院，開啟了中國邁向現代文明的重要篇章。
以下是部分教會大學和醫學院以及“院校調整”後代變化：
滬江大學（複旦大學、交通大學、華東師範大學、華東政法學院、上海財經學院等校）
聖約翰大學（華東師範大學、複旦大學同濟大學、上海交大、上海第二醫學院、上海財經大學、華東政法學院）
震旦大學（上海第二醫學院；複旦大學、上海第一醫學院、華東師範大學、交通大學、同濟大學、華東化工學院、華東政法學院、上海財政經濟學院、南京大學、南京師範學院）
金陵大學（南京大學）
金陵女子大學（南京師範大學）
東吳大學（蘇州大學）
之江大學（浙江師範學院、浙江大學、複旦大學）
燕京大學（北京大學）
天主教輔仁大學（北京師範大學，北京大學，中國人民大學，中國政法大學）
嶺南大學（中山大學）
津沽大學（天津大學、南開大學大學、天津師範學院）
華中大學（湖北中醫藥大學）
齊魯大學（山東大學、山東師範大學、南京大學）
華西協合大學（四川大學）
福建協和大學（福建師範大學）
湘雅醫學院（中南大學湘雅醫學院）
廣州眼科醫局（現為中山大學附屬第二醫院）
上海仁濟醫院（現為上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院）
上海同仁醫院（現為上海交通大學醫學院附屬同仁醫院）
蘇州公濟醫院（現為上海市第一人民醫院）
蘇州博習醫院（現蘇州大學附屬第一醫院）
濟南共和醫學校（現為齊魯大學醫學院又稱齊魯大學醫科、
北京道濟醫院（現為北京市第六醫院）
濟南華美醫院與醫校、（現山東大學附屬醫院）
廣州花地精神病醫院（中國第一所西式療法精神病 醫院，現為廣州市腦科醫院）
上海震旦大學醫學院（現為上海第二醫學院）
成都華西協和大學醫學院（四川大學華西醫學中心）
協和醫學堂（北京協和醫院，解放軍301醫院前身）
傳教士組織的中國紅十字會救助中心（上海華山醫院）
上海聖瑪利亞醫院（現為上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院）
普仁醫院（現為北京市普仁醫院、無錫市普仁醫院）
瀘州福音醫院（現川南醫院，瀘州醫學院附屬醫院）
湘雅醫學校（中南大學湘雅醫學院）
山西川至醫學校（現為山西醫科大學）
宏恩醫院（現為複旦大學附屬華東醫院）
漢口協和醫學堂（現為武漢協和醫院，華中科技大學同濟醫學院附屬漢口協和醫院）
