也來談談閆潤濤顏寧之爭 jty

來源: 72122 2022-11-11 11:58:32 [] [舊帖] [給我悄悄話] 本文已被閱讀: 次 (22419 bytes)
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回答: 顏寧歸國的真正內幕old-dream2022-11-11 10:32:35
  • 也來談談閆潤濤顏寧之爭 jty

     

    ty 發表評論於 2022-11-07 09:50:41
    閆潤濤的導師Peter Maloney不是施一公的導師。施一公的導師是Jeremy Berg,和Maloney不在同一個係,

    所以閆和施談不上是師兄弟。讀了閆潤濤和顏寧的論文。閆的論文研究的是一種antiport,而顏寧研究的

    Glut1是uniport。這兩種蛋白和symport一起組成一個叫做MFS的膜蛋白家族。這三類MFS雖然都具有

    V形三維結構和類似的conformational change (喇叭口向上或者向下的轉換,為方便我就叫它喇叭口模型)

    ,但轉運機理是不同的。閆的論文首次提出antiport的轉運機理可以用喇叭口模型來解釋,照理應該受到

    學術界的重視。可是我查了web of science,閆的論文引用率並不高。不僅顏寧沒有引用,我查到了所有

    和MFS蛋白結構有關的論文都沒有引用。這或許並不能說明閆的工作不重要,但起碼在該領域裏沒有受

    到重視。還有一種可能是閆提出的模型借用了66年在科學雜誌上發表的鈉鉀泵機理,因此並非是原創的

    新理論。這隻是我讀了幾篇綜述文章之後的理解,不一定對。顏寧做出了Glut1的... 查看完整評論

     

    也來談談閆潤濤顏寧之爭

    jty

     

    首先聲明一點。本人多年來一直是老閻的粉絲,非常敬佩他的見識和文采。本來不想對閆顏之爭發表意見,

    可是前幾天看到Dave Sun顏寧賴以成名的成果 背後有一個令人扼腕的故事一文以及許多網友對顏寧

    的文革式的聲討,實在是看不下去了,所以決定冒著被砸磚的危險寫這篇文章。

    我不是搞轉運蛋白的,可是因為教過細胞生理學的課程,對這類蛋白略有所知。為了搞清楚老閆對顏寧的

    指控,我仔細閱讀了兩個人的相關論文以及論文中引用的相關文獻。

    在當今這個互聯網時代,信息往往被扭曲。很多網友以為老閆提出了一個楊振寧級別的叫做喇叭口的理論,

    而顏寧隻不過是驗證了這個理論,卻隻字未提發明這個理論的老閆。查閱了文獻我才發現,其實喇叭口理論

    Alternating access model)早在80年代初就已經被轉運蛋白的學術領域廣泛接受了。老閆在細胞上發表

    的論文提出的模型隻是解釋喇叭口的轉換機製,所以老閆不是‘楊’。

    科普一下喇叭口模型。細胞被細胞膜包裹,糖分子或者其他的大分子自己進不去也出不來,必須由橫跨細胞

    膜的轉運蛋白來轉運。在喇叭口模型裏,轉運蛋白呈V形,V或者朝細胞內的一邊開口或者朝細胞外的一邊

    開口在這兩個構型之間轉換。糖分子或者其他的底物從喇叭口進,喇叭口隨即改變朝向,然後底物由喇叭

    口釋放到細胞膜的另一邊。

    最早提出喇叭口理論的是1966年發表在自然期刊上的一篇鈉鉀泵的論文。這篇論文被大多數闡述轉運機理

    的論文(包括顏寧的論文)引用。顏寧研究的是一種叫Glut1的葡萄糖轉運蛋白。最早提出喇叭口模型適用

    Glut1的論文是1975發表的,到80年代初,在Glut1以及其他轉運蛋白的學術領域,喇叭口模型已經被廣泛

    接受。當時對這個模型的研究來自於生化和動力學(kinetics)實驗。一直到九十年代初才開始有人通過基因

    突變的手段研究喇叭口的構型轉換機製,並有了一些突破。老閆的論文就是其中之一。

    老閆研究的是大腸杆菌細胞裏的一個叫UhpT的轉運蛋白,底物是G6P。請注意雖然這個蛋白和顏寧研究的蛋

    白屬於不同的類型而且轉運機製有很大的區別,兩者都是通過喇叭口的機製轉運底物的,而且有相同的拓撲

    結構。老閆發現一個位於TM7片段上的氨基酸在突變之後不僅影響在細胞外的底物和UhpT結合,而且會影響

    在細胞內的底物和UhpT結合,因此他提出了一個模型,指出TM7對喇叭口構型的轉換有關鍵的作用。這是非

    常有意義的發現,發表在細胞雜誌就是證明。可是這篇論文提出的模型缺乏有力的實驗證據。要知道生物學界

    和物理很不同,非常看重實驗數據。沒有被實驗證實的理論很難在學術界受到重視。所以老閆這篇文章雖然在

    細胞雜誌上發表,但引用率很低。引用率低的論文很容易被人遺忘。我查閱了不少和Glut1相關的文獻包括和

    TM7相關的文章,沒有一篇引用了老閆的論文。

    二十一年之後,顏寧在自然雜誌上發表論文,解析了Glut1的三維結構,並且提出了一個Glut1的構型轉換模

    型。老閆發現顏寧的模型裏也把TM7作為構型轉換的關鍵部位,可是自己的文章卻沒有被引用,於是義憤填

    膺,指控顏寧剽竊了他的科研成果。

    我比較了一下閆顏的兩個模型,兩者還是有區別的。顏的模型裏除了TM7,還有一個叫做ICH的片段也起關鍵

    性的作用。即便如此,顏寧沒有引用老閆的文章確實是一個失誤。顏寧在闡述她的模型之前寫道:“On the

    basis of our structural analysis and published biochemical data, we propose a working model for

    Glut1 (Fig. 5)." 在這裏顏寧沒有引用任何文章。即便她沒有看過老閆的文章,其他和模型相關的文章是應該

    引用的。不過我覺得顏寧頂多是引用文章上的失誤。老閆指控顏寧剽竊就太過分了。

    話說回來,現在的問題是顏寧到底是獨立發現TM7的作用還是讀了老閆的文章以後受到了啟發。我覺得顏寧

    模型裏TM7的作用很大程度應該是她獨立得出的,因為TM7的作用在三維結構的圖上一目了然。有很大可能

    顏寧沒有讀過老閆的文章,畢竟過去了21年,老閆的文章又很少被引用。有些網友可能說因為顏寧的老師是

    施一公,而施一公和老閆是師兄弟,所以顏寧應該知道老閆的文章。首先,施一公和老閆並沒有師從同一個

    導師,其次,即便兩個人認識(實驗室在同一個樓裏),但身處不同的領域,況且後來也沒有更多的交集,

    很難想象施仍然記得和自己的科研沒有關係的一篇論文。

    以上是我的淺見,歡迎批評指正。

     

    誠信 發表評論於 

    對待顏寧,閻迷們經常會失去理智,甚至髒話連篇, 惡意攻擊。

    盡管如此, 仍有不少學者不畏語言暴力, 挺身而出, 寫出很多專業性很強的科普文章, 澄清事實,
    以正視聽。 所顯現出來的正義感, 令人欣慰和讚賞。 說明我們這個族群也不缺乏正義感。
    Peace2018Sep 發表評論於 
    從純學術角度看,顏的論文與閆的論文毫無關係,哈哈哈!

    熱炒他們是大外宣的傑作,哈哈哈!
     

所有跟帖: 

熱衷於評論閻顏之爭的絕大多數是外行 -一問三知- 給 一問三知 發送悄悄話 (0 bytes) () 11/11/2022 postreply 12:56:00

這個就是 -72122- 給 72122 發送悄悄話 (99 bytes) () 11/11/2022 postreply 13:11:44

記憶中,老閻說這個獲獎時就說過,這個是他離開國內多年後獲的獎,他的名字沒有出現,國內的情況,大家都懂的,名字被替換了。 -old-dream- 給 old-dream 發送悄悄話 old-dream 的博客首頁 (0 bytes) () 11/11/2022 postreply 19:28:33

你憑啥說他名字被替換了?我得過國家攻關重大科技成果獎,排名第三,得獎是我出國一年後的事。老閻大概率隻參加公關,非骨幹。 -衡山老道- 給 衡山老道 發送悄悄話 衡山老道 的博客首頁 (165 bytes) () 11/11/2022 postreply 19:35:24

這是我記憶中他自己說的。考大學也有被替換的,但不是每個人都被替換。 -old-dream- 給 old-dream 發送悄悄話 old-dream 的博客首頁 (0 bytes) () 11/11/2022 postreply 20:28:07

也有可能是老閻(至少自認為)出力很多,但因為年輕所以沒有被算上主力,這種情況也不十分罕見。 -old-dream- 給 old-dream 發送悄悄話 old-dream 的博客首頁 (0 bytes) () 11/11/2022 postreply 20:31:31

閻1980年從南京農學院學完基礎課回到農科院 -老生常談12- 給 老生常談12 發送悄悄話 老生常談12 的博客首頁 (486 bytes) () 11/11/2022 postreply 20:43:09

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