|
DNA 解碼的鑰匙：P公式（DNA骰子理論）
20多年來，分子人類學從線粒體DNA原始序列分析中，論證出現代人共同的老老祖母線粒體夏娃；從Y染色體的ZFY基因的729個DNA編碼，確定了現代人共同的老老祖父Y染色體亞當。同時，還依據突變遺傳標記，描繪了人類父係和母係的遷徙曆史。
在人類的DNA序列中，更多的是常染色體中包含的DNA序列。而且，男女的常染色體沒有區別。那麽，在人類的22條常染色體上有沒有標記呢？經過我們的研究，發現在常染色體上有這樣的標記。不但有，而且很多。你在本網的“附：基因銀行的DNA編碼資料”中，可以看到9組這樣的DNA編碼序列標記。其中有6組標記都是自人類產生以來，DNA編碼完全沒有改變過的“固有標記”；其它3組編碼雖然有著極少的差異，但總體序列是一致的，仍然可以看作“固有標記”。它們充分證實了現代人都是科學亞當和科學夏娃的後裔。
為了從DNA標記序列，去衡量人類同源（這裏的“源”是指最早的那位“現代人的祖先”，他是23對染色體的人，而非進化論所說的“類人猿”）可能性的大小，我們引入了概率理論，並創建了P公式（DNA骰子理論）。它能夠成為一把用於DNA序列解碼的鑰匙。
一．常染色體上標記的重要意義
有人說：Y染色體亞當和線粒體夏娃，“他們隻是幸運的男人和女人”，“當時肯定同時生活著許多女人和許多男人，隻不過她們的線粒體基因和他們的Y染色體基因沒有遺傳到現在而已。但是她們或他們遺傳下了其他的基因。”
這是分子人類學麵臨的一個重要問題：當時是否進化出了許多人，隻有他們留下了後代呢？
“他們留下了其它基因”的說法，是指如果一對夫婦隻有女兒，沒有兒子，那麽，父親的Y染色體的繼承就消失了。如果沒有女兒，母親線粒體的繼承就消失了。但是他們兩人的常染色體都被兒子或女兒繼承了，因此，常染色體上必然有來自父母的DNA證據。
對於這樣的疑問，我們可以歸結為兩個問題：
1. “那些”和Y染色體亞當、線粒體夏娃同時生活的人，是否有同樣的Y染色體亞當標記和線粒體DNA的夏娃標記？
如果他們“有同樣的Y染色體亞當標記和線粒體DNA夏娃標記”，回答就很簡單了：可以肯定當時有很多這樣的人，那是他們的兄弟、姐妹或者他們的堂兄弟、姐妹。我們可以將他們稱作“共祖人”。就像現在全世界的人，都有線粒體DNA夏娃標記，男人還都有Y染色體亞當標記，但是卻都是來自二十多萬年前“共同祖先”（“科學亞當”、“科學夏娃”）的後裔。
2. 如果和前麵的答案相反：認為那些和Y染色體亞當、線粒體夏娃同時生活的人，他們有各自的Y染色體標記和線粒體DNA標記。為了討論方便，我們將他們稱作“不是與Y染色體亞當、線粒體夏娃有共同祖先的人”，簡稱“非共祖人”。隻是由於他們可能在後代的遺傳中，因為沒有男性後代，或沒有女性後代，他們的Y染色體標記和線粒體DNA標記沒有遺傳下來。
從人類生殖的“減數分裂”過程可以看到（見下麵的內容），隻要有“非共祖人”參與了人類的繁衍，在常染色體上必然留下他們的DNA序列標記（這就是“她們或他們遺傳下了其他的基因”）。與此同時，會產生一部分現代人（摻雜了“非共祖人”的DNA序列的人群）的常染色體缺少“大多數人共有的標記”。
因此，在這裏，唯一可以化解這個爭論的是：必須找到在常染色體上的標記、並能證明全世界的人都有這個標記，沒有任何特例。如果這一點得到證明，那麽，就確定了現代人類的血統是純淨的，沒有一點雜質。這就是常染色體上標記的重要意義。
二．人類DNA中的“第一個標記”
1. “第一個標記”是鑒定人類血緣關係的標記
常染色體上有這樣的一個標記嗎？答案是肯定的！類似於“Y染色體亞當標記”（729個DNA字符），它有789個字符，就位於2號染色體的2q13至2q14.1（2號染色體的長臂13區到14.1區）的位置上。我們可以稱它為“人類DNA的第一個標記”（簡稱“第一標記”）。
如果在全世界人的常染色體上，所有人都有同樣的“第一個標記”，沒有發現“沒有這個標記”的男人和女人，那麽，無論這些“非共祖人”是否存在過，他們和現代的全世界人都毫無血緣關係。因為在我們的血液中，沒有任何他們的成分。例如：爪哇人、北京猿人、尼安德特人等等，他們雖然存在過，但是，他們不是現代人的祖先，他們隻是一些和我們毫無關係的類人猿 。
2.人類2號染色體是古猿兩條染色體融合而成的嗎？
當人類的DNA被認識以後，不少人總希望從DNA上去證實進化論的正確。凡是有一點支持進化論的見解，即便不是真實的，也會被重視，被發表。但如果是相反的研究結果，必然會被封殺，因為生物學界是進化論統治的世界。
人類2號染色體“是人和黑猩猩共有的猿類祖先的12號（或稱2A）和13號（或稱2B）染色體的融合”，似乎已經成為膾炙人口的事實，不少研究報告和書本上都加以引用。質疑這個結論的研究結果，幾乎看不到。著名的分子醫學專家考林斯先生有一本書：“上帝的語言”，特別推崇這個不真實的結論，其書影響很大，我們必須予以重視。從下麵的剖析可以看到，這完全是一個沒有根據的想象。
3.一段倍受重視的“789個堿基字符的序列”：
這個“融合想象”的“融合區”是一段789個堿基字符的序列。“上帝的語言”一書引用了2005年的2號染色體的報告，說人類2號染色體“必定發生了融合”（where this proposed chromosomal fusion must have happened.），並且說：“這正是我們從猿進化到人時，在此處留下的DNA印記（DNA imprint）”(The fusion that occurred as we evolved from the apes has left its DNA imprint)（英文版 P138）。
2號染色體的研究報告說:“在染色體方麵，過去曾經描述過，在2q13–2q14.1位置上，有圍繞著祖先染色體融合的區域。” On chromosome 2, the local region surrounding the ancestral chromosomal Fusion site on 2q13–2q14.1 had previously been described [注釋2]。
而這個“過去曾經描述過”的報告，是2002年發表的“祖先染色體融合部位2q13–2q14.1的結構和演化”（“Genomic Structure and Evolution of the Ancestral hromosome Fusion Site in 2q13–2q14.1 and Paralogous Regions on Other Human Chromosomes”）研究報告[注釋3]，在這個2002年的報告中又牽涉到另外兩個報告[注釋4、5]。
這4個報告相互引用，看來很複雜，其實十分簡單：就是2號染色體的2q13–2q14.1位置上的789個堿基字符的序列中，裏麵包含有幾個“TTAGGG”字符串的重複。他們說：“這可能表明是兩個染色體頭對頭的融合區”。因為“TTAGGG”字符串，是染色體兩端的“端粒”特有的、重複很多次的字符串。（見圖6-1）。
4.“789個堿基字符的序列”可以作為一個標記
這裏，我們先不討論這段DNA編碼是否就證明是兩個染色體的融合，隻是看一看這789個編碼是否能看為標記？這裏應該感謝美國國家生物技術信息中心（The National Center for Biotechnology Information --NCBI），它免費提供了人類基因組的完整信息。本節有關的DNA編碼序列，都是作者在該中心的網站上直接取得的。
圖6-1 常染色體上的標記（人類DNA的“第一個標記”）
作為DNA標記，必須有它的明確性、固定性和保持遺傳的特性。在前麵的“祖先染色體融合部位2q13–2q14.1的結構和演化”報告中[注釋3]，對這三個方麵，都加以了肯定。
（1）首先，該報告指出了編碼所在的區域：RP11-395L14 (AL078621)，包含的789個堿基對字符；
（2）同時，指出這個染色體的融合是人類特有的，並且是被固定了的；
（3）它產生在人類和黑猩猩分離之後，現代人向全世界傳播之前。
報告說：
“因為融合染色體是人類特有的，而且是固定的，融合必定發生在人類和黑猩猩已經分離之後，但是在現代人類傳播到世界各地之前。”
（“Because the fused chromosome is unique to humans and is fixed, the fusion must have occurred after the human–chimpanzee split, but before modern humans spread around the world” 。（原文））。
這裏麵包含的意思是：由於兩個染色體的融合，由24對染色體的猿，產生出了23對染色體的人，使他們與黑猩猩的祖先分離，一直延續到全部的現代人。而這789個DNA碼，就是這一過程的證據，它一直保存到現在。
顯然，這789個DNA字符的編碼可以作為一個標記（“上帝的語言”書中，說“DNA imprint”）。我們可以將常染色體上的這個標記，稱作“常染色體標記”或人類DNA上的“第一標記”。因為它是認識人類源頭的最重要標記，所以命名它為“第一標記”。
5. “第一標記”既可以通過父係繼承，也可以通過母係繼承
這個“第一標記”位於人類的2號常染色體上。常染色體和Y染色體、線粒體不同之處，在於人的一對（兩條）2號常染色體，一條來自父親，一條來自母親。因此，2號常染色體的這個“第一標記”，既是父係的標記，也是母係的標記。既可以通過父係繼承，也可以通過母係繼承。如果隻有一方有這個標記，另一方沒有這個標記，將在不斷的生育繁衍過程中，逐漸形成一些在2號染色體上，沒有“第一標記”、或者僅僅一條染色體上有“第一標記”的群體。
要說明這個問題，就牽涉到了人類的生育繁衍過程，讓我們複習一些高中生物學上的有關內容。
三．減數分裂和“第一標記”的承傳
1．減數分裂和胚胎的形成
講到常染色體和常染色體的遺傳，就一定要涉及減數分裂和胚胎的形成。這裏，僅僅介紹父係精子產生的減數分裂過程，並由此說明“第一標記”的承傳。這些隻是現在高中學生生物課程的內容。
當男人性成熟後，睾丸裏的一部分精原細胞就開始進行減數分裂，經過減數分裂以後，精原細胞就形成了成熟的生殖細胞——精子，其具體過程如下。
精原細胞中有22對常染色體，一對性染色體。每一對（兩條）常染色體，一條來自父親，一條來自母親。
圖6-2 ：2號常染色體上“第一標記”的承傳
來自父方和來自母方相同編號的兩條染色體，叫做同源染色體。在減數分裂中的第一時期，兩條染色體分別自我複製。複製後，由於每條染色體都含有兩條姐妹染色單體，因此共含有四條染色單體，叫做四分體（4個DNA分子）。
然後，進入四分體聯會的過程。四分體中的非姐妹染色單體之間（來自父親和母親的常染色體之間）發生了DNA的片斷交換，從而導致了父母基因的互換，產生了基因重組。每條染色體上的基因所包含的DNA編碼數量，僅僅占該條染色體DNA編碼總量的3%以下，因此基因重組並不會引起染色體結構大的改變。
然後發生第一次減數分裂，實現同源染色體的分離，形成兩個次級精母細胞。進而發生第二次減數分裂，每個次級精母細胞的兩條相聯姊妹染色體著絲點分裂，形成4個單體，最終發育成4個精子。卵子的減數分裂情況與精子類似。
在圖6-2 左側中，男人和女人的2號常染色體的長臂2q13-2q14.1上，都有“第一標記” 。經過減數分裂後，產生的4個精子上，同樣保持了這個標記。由他們受孕產生的胚胎細胞中，來自父係的2號染色體，就存在著這個標記。如果卵子也是同樣的情況，那麽，胚胎細胞中，來自母係的2號染色體，也同樣存在著這個標記。這個胚胎細胞發育出來的男人或女人，就是現在全世界普普通通的成員。
在圖6-2 右側中，女人的2號常染色體上，有“第一標記””。而男人2號常染色體上，沒有這個標記。經過減數分裂後，產生的4個精子上，有兩個保持了這個標記，另外兩個沒有“第一標記”。
由沒有“第一標記”的精子受孕產生的胚胎細胞，即使卵子的2號染色體是有標記的，胚胎細胞所含的兩條2號染色體，其2號染色體父係的那一條，就一定沒有這樣的標記。這個胚胎細胞發育成人後，他（或她）不再是一個普通的人。他（或她）的男性後裔和女性後裔，有50%的人和他（或她）一樣，有一條2號染色體沒有“第一標記”。 經過一代代的承傳，就會有一群沒有“第一標記”的群體。
圖6-2右側的圖，如果將男性換成有“第一標記”，女性換成沒有“第一標記”，其結論仍然是一樣的。
如果男性和女性的2號染色體上都沒有這個標記，他們相婚配，那他們子女的2號染色體上，就都沒有“第一標記”。
2. 線粒體DNA和“第一標記”的承傳關係
有人說：有些存在過的女性，因為她們中間的後裔沒有女性繼承人，所以，她們的線粒體沒有遺傳到現在，這個說法有它的合理性。但是，當有了“第一標記”之後，我們可以說，這些“存在過的女性”，一定不包含“非共祖人”的女性（即沒有“第一標記”的女性）。
假如和線粒體夏娃同時生活在一起的女人中，有一個是“非共祖”的女人，她的身上沒有“第一標記”。由於常染色體DNA的遺傳，雖然她的線粒體DNA沒有遺傳下來，她的常染色體卻遺傳下來了。
總之，隻要過去存在沒有“第一標記”的女子，如果她們（或她們的後裔）又和線粒體夏娃的後裔有過交配，必然現在會存在沒有第一標記的人群。在世界上檢測的所有DNA樣本中，從來沒有發現什麽人身上的2號染色體不存在這個標記，因此，也就可以斷定，從來就不存在這些“非共祖”的女人。
對於Y染色體亞當，也可以用同樣的道理推之。
由此看到，在人類延繁的曆史長河中，隻要極少數的“非共祖人”，或者“尼安德特人”等猿人的血統加入，無論他們是男是女，
都會發展出2號染色體上沒有“第一標記”的人群。然而，至今從來沒有發現過這樣的人群。對於現代人血統是否純正，答案已經十分清楚。
四．唯一的一對父母
麵對人類的DNA編碼，無論什麽人持什麽看法，編碼顯示的事實是無法改變的。從“第一標記”所看到的事實，就是全世界的現代人來自一對父母，而且是“唯一的一對父母”。這“唯一的一對父母”在他們產生之時，都有了這個標記。
如果拋棄“2號染色體是否由兩個染色體融合而來”的看法，承認2號常染色體上這789個編碼是一個標記，它標誌全世界的現代人來自唯一的一對父母，在這一點上，本書的觀點和“上帝的語言”一書的觀點是一致的。該書的作者考林斯先生不也說：“正是在此處的DNA上留下了印記”（left its DNA imprint）（“上帝的語言”中文版，第94頁，英文版 P138）嗎？他還說：“因此，通過DNA分析表明，我們人類確實都是出於一個家族。” （“上帝的語言”中文版，第86頁），這顯然也是與“唯一的一對父母”極為相似的表達。的確，僅僅有這個“第一標記”，就已經充分說明了全世界的人們，來自“唯一的一對父母”。何況，還有亞當標記和線粒體夏娃標記為佐證。
如果不承認這是個標記，由“染色體融合”使24對染色體變成23對染色體的結論就不存在，“人和黑猩猩共祖”的假定也沒有基礎，從進化論或驟變論上，就更加無法解釋人的來源了。
承認這個標記，就承認了“唯一的一對父母”，但是，並不意味著必須承認“染色體融合”的假定。23對染色體的人類產生，也許有著我們無法看到的方式。
五．1092個人的DNA報告，男人和女人
全世界人的2號常染色體上“第一標記”的789個DNA字符，是否都是相同的呢？這就涉及到人類的常染色體有多大的差別，最近有兩篇研究報告給出了依據。
2001年2月16日，“科學”期刊報道了科學家們完成了人類基因組測序工作，不過所用DNA樣本僅來自5個人[注釋6]。他們是兩男三女，一個非裔美國人、一個中國人、一個西班牙裔的墨西哥人、以及兩個高加索人（白種人）。其中，包含了主持基因組測序工作的首席科學家克雷格·文特爾（Dr. John Craig Venter）本人DNA的樣本。
2012年10月31日，“自然”期刊報道科學家們完成了更多人類DNA的測序，所用DNA樣本取自1092人，這個報告的名稱是“來自1092個人類基因組的遺傳變異綜合圖譜” [注釋7]。這是英、美、中等多國科研機構聯合發起的一個研究計劃，最終目標是獲得世界各地不同人群中2500人的基因組數據。本階段逾千名的基因提供者來自歐洲、美洲、亞洲、非洲的１４個國家和地區，男性和女性的比例大致是各占一半。
2013年元月，又有一個報告“東南亞100個馬來人的基因組深度測序”，在美國人類遺傳學學會網站上發表 [注釋8]。
這兩個報告的結論都是：每個人常染色體的DNA突變（多態性SNP）平均數是3.6M（3.6百萬）個堿基碼，這大約占22條常染色體DNA總數的千分之1.2（每833個位點上，有一個點的差異）。由於人們的DNA突變，很多都是繼承祖先的突變，因此，不同的人包含了很多相同的突變。除去相同的DNA突變，人們之間常染色體DNA突變的差異要遠小於千分之一。
按照這兩個研究結果，我們可以評估“第一標記”的789個DNA字符，在不同人身上的差異不應該多於一個字符。自現代人的出現到現在，大約有20幾萬年了。上萬代的繁衍，每代人身上幾十代的細胞分裂拷貝，在全世界70億人身上的這789個DNA字符，居然能夠一字不差，這真令人驚歎！
因此，可以肯定地說，人類的“第一標記”，是全世界人來自“唯一一對父母”的鐵證。在這個結論的麵前，“群體進化和選擇”的進化論理論，已經沒有資格作為討論的對手，因為不可能僅僅進化出“一對父母”。至於是否由染色體融合“驟變”來產生這一對父母，在下麵的兩節中，還要仔細討論。
這兩個報告另一個值得關注的是，他們采集的DNA樣本是男、女大約各半，沒有發現男人和女人常染色體的DNA有什麽區別。女人和男人有相同的常染色體，僅僅少了一個Y染色體，多了一個X染色體，就和男人有那麽大差別，奧秘在哪裏呢？另外，為什麽在首個女人的2號染色體上，會有和男人相同的“第一標記”？這不能不讓我們有更多的思考和追尋。
從DNA解碼出發，開啟對我們自身的認識，僅僅是個開始。一百年多以前的達爾文，自以為掌握了人類的秘密，作出了關於人的來源和進化的種種結論，如果他能活到現在，一定也會發出巨大的感歎。
|
(0 bytes)
()
09/24/2015 postreply
11:37:50
選擇“Disable on www.wenxuecity.com”
選擇“don't run on pages on this domain”
