蔡元培在1916年說：“滿洲政府，自慈禧太後下，因仇視新法之故，而仇視外人，遂有‘義和團‘之役，可謂頑固矣。”（《華工學校講義》）
李大釗在他著名的宣言性論文《東西文明根本之異點》（1918年7月1日）中說：“時至近日，吾人所當努力者，惟在如何吸取西洋文明之長，以濟吾東洋文明之窮。斷不許以義和團的思想，欲以吾陳死寂滅之氣象腐化世界。”
陳獨秀在發表在《新青年》上的《克林德碑》一文，更是全麵分析了義和團運動在五個根本方麵反時代潮流的特征，陳獨秀最後總結說：“照上列的事實看起來，現在中國製造義和拳的原因，較庚子以前，並未絲毫減少，將來的結果，可想而知。我國民要想除去現在及將來國恥的紀念碑，必須要叫義和拳不再發生；要想義和拳不再發生，非將製造義和拳的種種原因完全消滅不可。現在世上是有兩條道路：一條是向共和的科學的無神的光明道路；一條是向專製的迷信的神權的黑暗的道路。我國民若是希望義和拳不再發生，討厭克林德碑這樣可恥的紀念物不再豎立，到底是向哪條道路而行才好呢？”「義和拳就是全社會種種迷信種種邪說的結晶。」[127]}}
華人歷史學家唐德剛指出，義和團的行為除了殺害無辜的外國人外，也直接造成許多無辜的中國人受害，而且針對對象也包括光緒帝（所謂一龍）、李鴻章、奕匡（所謂二虎）、京官大臣（所謂十三羊，或謂三百羊，宣稱京官除十八人外全應殺[57]），除屠殺外，也姦淫據掠[57][128]，無法無天，其不人道處比八國聯軍更甚，實屬野蠻殘暴。如據當時記載：“城中日焚劫，火光連日夜……夙所不快者，即指為教民，全家皆盡，死者十數萬人。其殺人則刀矛並下，肌體分裂，嬰兒生未匝月者，亦殺之殘酷無複人理”，“京師盛時，居人殆四百萬。自拳匪暴軍之亂，劫盜乘之，鹵掠一空，無得免者。坊市蕭條，狐狸晝出，向之摩肩擊轂者，如行墟墓間矣。”[129]「義和團之殺教民毛子也，備諸酷虐，剉舂，燒磨，活埋，炮烹，支解，腰殺，殆難盡述。京西天主堂墳地，悉遭發掘，若利瑪竇，龐迪我，湯若望，南懷仁諸名公遺骨，無一免者。勝代及本朝禦碑，皆為椎碎。保定屬有張登者，多教民，團匪得其婦女，則挖坑倒置，填土露其下體，以為笑樂。」[57]天津之戰開始後，一些拳民看見遠處有個婦女在跑，就大喊道：“直眼往何處逃？”她聽到後跪在地上說：“我非直眼，乃某處某人之妻也。”拳民說：“爾額有紋，安能諱耶？”隨即把她拖至壇門外殺掉[12]。
歷史作家金滿樓表示，義和團的口號是扶清滅洋，“洋”代表了與西方有關係的一切人和事物，因此都在消滅的範圍內，這其中既包括信教的洋人和不信教的洋人、“洋教”、與洋教有關係的中國教民，也包括從西洋傳來的西藥，洋布，等等。楊典誥在《庚子大事記》中說：“自教堂教產燒畢後，所有城內外凡沾洋字各鋪所儲洋貨，盡行毀壞，或令貧民掠取一空。並令住戶人等，不得收藏洋貨，燃點洋燈。於是家家將煤油或箱或桶潑之於街。又傳言殺盡教民後，將讀洋書之學生一律除去，於是學生倉皇失措，所有藏洋書之家，悉將洋書付之一炬”。仲芳氏也在《庚子記事》中說：“又哄傳各家不準存留外國洋貨，無論巨細，一概砸拋，如有違抗存留，一經搜出，將房燒毀，將人殺斃，與二毛子一樣治罪。”由於洋貨在很多方麵確實為老百姓提供了方便，因此商人為免毀壞，就給洋貨或者帶“洋”的貨品改名換姓，譬如“洋藥”改稱“土藥”，“洋布”改稱“土布”或者“西布”，“洋貨鋪”改稱“廣貨鋪”[130]。六月十六日上午十一時許，一隊團民巡行到大柵欄老德記藥房前，發現這裏出售洋貨，即縱火焚之。仲芳氏《庚子記事》載：“義和團焚燒前門外大柵欄老德記大藥房，不意團民法術無靈，火勢猛烈，四麵飛騰，延燒甚凶。計由大柵欄慶和園戲樓延及齊家胡同、觀音寺、楊梅竹斜街、煤市街、煤市橋、紙巷子、廊房頭條、廊房二條、廊房三條、門框胡同、鎬家胡同、三府菜園、排子胡同、珠寶市、糧市店、西河沿、前門大街、前門橋頭、前門正門箭樓、東荷包巷、西荷包巷、西月牆、西城根。火由城牆飛入城內，延燒東交民巷西口牌樓，並附近鋪戶數家。自清晨起，直至次日天曉始止，延燒一日一夜。”“義和團在老德記大藥房將火點起，令四鄰焚香叩首，不可驚亂。及至延及旁處，團民不許撲救，仍令各家焚香，可保無虞，切勿自生慌擾。既至火勢大發，不可挽救，而放火之團民，已趁亂逃遁矣。是以各鋪戶搬移不及，束手待焚，僅將賬目搶護而已。”李希聖在《庚子國變記》裏說，這次大火“焚正陽門外四千餘家，京師富商所集也，數百年精華盡矣。延及城闕，火光燭天，三日不滅。”
史學家馬洪林等表示，義和團相信天災頻仍（1899年1900年的旱災）是基督宗教造成的，久旱無雨意味著天上神靈遭到了教堂和教民的褻瀆，認為隻有推倒教堂，掃平洋人和教民，才能感動上天降雨[131]。義和團降神附體，念咒畫符，如“避槍炮火咒”、“請神咒”、“請師咒”、“護身咒”。拳民戰鬥時都要口念咒語，祈求各路神仙“神靈附體”、“顯靈護身”。他們請的神大多來自於章回小說與民間故事：有周朝太公望、戰國鬼穀子、漢壽亭侯關羽、無生老母、三清、玉皇大帝、如來佛祖、彌勒菩薩、觀世音菩薩、二郎神、哪吒、唐三藏、孫悟空、天蓬元帥豬八戒、濟公、張天師等，甚至一些幾乎無人祭祀，隻在說書中出現的鴻鈞老祖、通天教主、驪山老母、唐朝樊梨花、宋朝穆桂英、金刀聖母、柳樹精、黃三太等等[132]。義和團相信他們打的是神鬼之仗，是神靈與妖鬼的戰爭。團民堅信自己代表神，那麽洋人、教士及教民作為神的對立麵，也就理所當然地被看做是鬼。所憑借的是法術，而不是人力[131]。但義和團相信女人裸體、女人的穢物（便溺、經血、月經布等）的陰門陣會破解他們的避炮的法術[133]。“各洋樓架大砲甚多，每砲皆有一赤身婦人跨其上，所以避砲之法不能行”[134]。崇信拳匪者傳雲：「義和拳與洋人合仗，洋人不能敵，忽洋人軍隊中有一婦人赤體立，義和拳法術被破，不敢前進」[135]。團每戰必敗，或問故？團曰：「每戰輒見洋人隊中，有赤身婦人立於陣前，致法術為其所破」[136]。“西十庫開仗，忽有赤身婦女走出，團民受傷者眾，樓周圍掛婦人皮，並各穢物，以致團民難以得勝，東交民巷亦用此法”[56]。團民欲燒毀西十庫教堂，卻意外波及了附近的數處民居，教堂絲毫未損，對於這種結果，團民們普遍的解釋是：“此處與別處教堂不同，堂內牆壁，俱用人皮黏貼，人血塗抹，又有無數婦人赤身露體，手執穢物站於牆頭，又以孕婦剖腹釘於牆上，故團民請神上體，行至樓前，被邪穢所沖，神既下法，不能前進，是以難以焚燒[137]。女體是汙穢的觀念使得婦女成為團民眼中畏懼的對象；為防汙穢，義和團禁止婦女出門，不知此令而出門被殺的婦女甚多[12]。團民認為唯有「紅燈照」才能反製女性這種厭勝能力，所謂：「須待紅燈照來時方可，紅燈照盡是少女幼婦，故不畏髒穢之物耳」[56]；又說：「一切軍器皆不畏懼，槍砲遇之即不能燃，義和團法術雖大，然尚畏懼穢物，紅燈照則一無所忌，與義和團聯合一氣」[56]。
參與八國聯軍進攻北京的美國陸軍第二指揮詹姆斯?威爾遜少將在回憶錄中說:「(義和團運動)本質上是愚昧迷信與覺醒進步之間的衝突，它威脅了每一個在(清)帝國境內的外國人的生命與財產，外交人員與傳教士也不例外。」[138]
康有為《拳匪頭王培佑超升京尹論》:
梁啟超《中國積弱溯源論·積弱之源於風俗者》：
孫中山：大東書局《三民主義淺說》《民權初步·第五講》
秋瑾《精衛石》：
餘英時認為：
袁偉時認為：
李文海稱義和團運動中除了多傷人命之外，中國人經濟財產也遭受巨大損失。例如，義和團在北京前門外大柵欄點火焚燒老德記洋貨鋪和屈臣氏洋藥店，結果烈火乘風勢迅速蔓延，一把火燒掉了附近的商鋪1800餘家，民居7000餘間[142]。
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