"飛毛腿"這個名字也被用來指同一種導彈經伊拉克修改的版本。修改後射程增加，當許多導彈向以色列(40)和沙特阿拉伯(46)發射時，這一點尤為突出。美國製造的愛國者導彈係統據說成功的攔截了導彈，但是許多評論家聲稱愛國者導彈的作用被嚴重誇張了，實際上有85%的失敗率。這些導彈是伊拉克最有危險的進攻性武器之一，尤其是對於以色列而言。攜帶生化彈頭的可能性也被廣泛關注。
最終，飛毛腿導彈直接造成了一名以色列人，以及28名美國士兵（導彈擊中了位於沙特阿拉伯首都利雅得的一座賓夕法尼亞州國民警衛隊兵營）的死亡。針對飛毛腿導彈的搜索耗用了自願聯盟空軍大約三分之一的力量。借助於“運輸-起豎-發射”（TEL）三用車，這些導彈可以被非常機動地運輸，並且難以被捕捉；美國和英國的特種部隊成員經常承擔在敵軍的防線後方搜索並破壞這些導彈的任務。對於上述集團而言，消除來自飛毛腿導彈的威脅是有著特殊重要性的。正如以色列曾經揚言，如果侵襲繼續，便將加入對伊拉克的戰爭，但這會分裂反以阿拉伯國家組成的攻打伊拉克的聯盟，也會大大加重美國和英國的戰爭代價。
伊拉克發展了四種改型：飛毛腿導彈（Scud）、遠程飛毛腿導彈（longer-range Scud或Scud LR）、侯賽因（Al Hussein）和阿巴斯（Al Abbas）。除了那些幾乎未經改造的武器之外，這些導彈並不成功，因為它們往往在飛行過程中崩解，並且隻能搭載小彈頭。
