s 閱讀頁

2.天使的睡姿,一級結構

  到現在,細胞中的天使在我們腦海中的形象仍是神秘的,為了看清其廬山真麵目,我們必須大膽地掀開她的蓋頭來,對她的衣食住行作一個徹底的了解。我們可以把酶的結構分為一級結構、二級結構和空間結構,我們分別形象地稱其為天使的睡姿(伸展狀態)、坐姿(活動前的過渡狀態)、行姿或舞姿(活動狀態)。

  猶如原子是物理性質的最小單位,分子是化學性質的最小單位,細胞是生命性質的最小單位一樣,氨基酸是蛋白質的基本結構單位,也可以在最基本的意義上保持蛋白質的某些性質。目前,自然界已發現近200種氨基酸,但組成蛋白質的氨基酸隻有20種。

  Ri

  氨基酸的結構通式是HOOC-CH-NH2(i=1,2,3,。,20)。每個氨基酸都有一個羧基(-COOH)和一個氨基(-NH2),羧基是有機酸的象征,氨基酸便由此得名:帶有氨基的酸。與羧基相連的碳原子叫α碳原子,20種氨基酸都是α氨基酸。Ri有20種變化,每一種變化就是一種氨基酸。如果我們把每一個氨基酸看作一個球,那麽每一種R變化就是給球塗上一種顏色或標上一個數字,天使的睡姿就是這樣一長串五顏六色的球。

  這些球通過一種共價鍵的化學鍵連接起來,如:R1R5

  HOOCCHNHOCCHNH2,這個鍵形成於1號氨基酸和5號氨基酸之間,它們之間發生了一種叫“縮水反應”的化學反應,顧名思議,就是-NH2的H與羧基的OH結合為水而失去。由這個式,我們立即可以想象出後麵的延長,都是通過方框裏的這種形式發展下去的。方框裏的部分具有連接作用,叫“肽鍵”,肽鍵並不是化學鍵,而是一個具連接作用的基團――“鍵”有連接的意思,我們可以把它看作一個方便的比喻。由肽鍵連接起來的一條鏈被形象地稱作肽鏈,肽鏈就是天使的睡姿,是蛋白質的一級結構。組成肽鏈的氨基酸單位的排列順序不同,就是不同的肽鏈,如1-2-3-20與1-3-2-20是不同的。運用簡單的數學知識我們可以推知,一條由10個單位組成的肽鏈會構成P1020種不同的肽鏈;要知道,單位是可以重複的,那麽就有1020種,而一條肽鏈遠不隻10個氨基酸。天使的睡姿簡單優美,而其數學結果卻可以大得驚人。這正是生命從簡單性出發而體現出的複雜的美。

  一個蛋白質分子往往不隻一條肽鏈,肽鏈之間不是通過肽鍵連接的(否則隻能算一條),通過氫鍵或二硫鍵等更弱的吸引並列起來。

  徹底弄清天使睡姿要求想辦法確定肽鏈的每一個氨基酸單位,也就是測定一級結構的氨基酸順序。蛋白質分析的科學家曾絞盡腦汁來解決這個問題。1953年,英國的森格終於找到了這種方法並測出一種最簡單的蛋白質――牛胰島素的一級結構。現在這些方法已經蓬勃地發展起來,已有多種測序方法,還可以與計算機連起來運用,自動分析,時間快的可以在一天之內測定一個蛋白質分子的氨基酸順序。

  這些測定順序方法的原理今天看來就像我們在小學裏玩的智力遊戲,十分簡單。它的基本步驟如下:

  第一步:測定蛋白質分子中肽鏈的數目。從肽鏈通式推知,每一條肽鏈都有兩個不同的末端,氨基端(N端)和羧基端(C端),加入一種試劑與其中一個末端(如N端)反應並呈現顏色,我們就可以判定末端的個數。一個末端就是一條多肽鏈。打一個比方,我們可以把一個蛋白質分子看成一捆長短不一的竹杆,每一根竹杆就是一條多肽鏈,而一個竹節就是一個氨基酸單位。

  第二步,拆分多肽鏈。我們必須把竹杆拆分成一根根的,以便分別確定每一根的竹節。

  第三步,測定肽鏈兩端的氨基酸。用特殊的方法可以確定竹杆兩端的兩個竹節,猶如塗上不同的顏色。如C-18-

  ……-2-N。

  第四步,多肽鏈斷裂成肽段。用兩種或多種方法把竹杆鋸成不同的短杆,並把它們分開來測定。例如:C-18-。-3-5-4-2-1-。-2-N,用方法Ⅰ可以分成A:C-

  18-。-3-N和B:C-5-。-2-N;用方法Ⅱ可以分成C:C-18-。-3-5-4-N和D:C-2-1-。-2-N。

  第五步,測定每個肽段順序。可以用特別的方法將短杆的節從一端逐個鋸下來標上顏色並測定之,如:

  A:C-18-1-20-5-1-3-N

  B:C-5-4-2-1-19-13-14-2-N

  C:C-18-1-20-5-1-3-5-4-N

  D:C-2-1-19-13-14-2-N

  第六步:確定肽段在肽鏈中的次序。在上一步中,我們尚無法確定A段3-N與B段C-5是連在一起的,因為我們並不知道鋸斷的位置。於是我們可以把兩種方法鋸斷的片段的重複對齊,看看缺口如何,如:

  A:C-18-1-20-5-1-3-N

  C:C-18-1-20-5-1-3-5-4-N

  和B:C-5-4-2-1-19-13-14-2-N

  D:C-2-1-19-13-14-2-N

  從上式我們可以看出:A+B=C+D,而其他拚湊方法則不行:A+C≠B+DA+D≠B+C,這就是說明A和B相連,C和D相連,它們分別由不同鋸法得到。

  這是一項非常誘人的智力遊戲,卻是蛋白質測定的基本方法,讀者不妨動手畫出幾個片段讓你的同學或同事去拚湊,也可以讓你的同學畫幾個片段來讓你享受一下理智活動的樂趣。偉大的科學發現或發明常常原理上十分簡單,關鍵是你首先得想到,然後要做到。桑格就因為這種我們小學時就玩的智力遊戲而榮獲了1958年諾貝爾化學獎。

  
更多

編輯推薦

1博弈春秋人物正解
2春秋戰國時期社會轉型研究
3俄羅斯曆史與文化
4正說明朝十八臣
5中國式的發明家湯仲明
6西安事變實錄
7漢武大帝
8詠歎中國曆代帝王
9大唐空華記
10紅牆檔案(二)
看過本書的人還看過
  • 紅牆檔案(三)

    作者:韓泰倫主編  

    紀實傳記 【已完結】

    本書以中南海為記敘軸心,以1949年10月至1999年10月為記敘時段,以建國以來的重大曆史事件為背景,記述了毛澤東、鄧小平、江澤民三代核心領導人以及他們的戰友的政治生涯、衣食住行和感情生活。

  • 紅牆檔案(四)

    作者:韓泰倫主編  

    紀實傳記 【已完結】

    本書以中南海為記敘軸心,以1949年10月至1999年10月為記敘時段,以建國以來的重大曆史事件為背景,記述了毛澤東、鄧小平、江澤民三代核心領導人以及他們的戰友的政治生涯、衣食住行和感情生活。

  • 紅牆檔案(一)

    作者:韓泰倫主編  

    紀實傳記 【已完結】

    本書以中南海為記敘軸心,以1949年10月至1999年10月為記敘時段,以建國以來的重大曆史事件為背景,記述了毛澤東、鄧小平、江澤民三代核心領導人以及他們的戰友的政治生涯、衣食住行和感情生活。

  • 菊花與刀:日本文化諸模式

    作者:美 魯斯·本尼迪克特  

    紀實傳記 【已完結】

    作者運用文化人類學研究方法對日本民族精神、文化基礎、社會製度和日本人性格特征等進行分析,並剖析以上因素對日本政治、軍事、文化和生活等方麵曆史發展和現實表現的重要作用。用日本最具象征意義的兩種事物...