雅美之途
教育，人文，社會
武漢病毒所的石正麗團隊最近發表《Nature》《自然》論文，將她們的原創性發現刊登在全球最有信譽的科學雜誌上，《自然》曾經發表過DNA雙螺旋結構、單克隆抗體和逆轉錄酶等劃時代的科學發現。當她們將自己結果首先發表在網上時，我曾經寫博文祝賀。這次的《自然》文章似乎是她們的那篇網上論文的擴充版本，《自然》似乎也允許這樣做了，不算重複發表以往的實驗資料，以前是不行的。首次拿到武漢冠狀病毒全基因序列的複旦張永振團隊也在同期的《自然》上發表了文章，這次中國科學家的驚人表現與ZF的遲緩反應形成了鮮明的對照。
作為科學家，我對很多東西都充滿質疑，但是我最不相信的就是陰謀論。在確鑿證據出來之前，我肯定不相信武漢病毒所的團隊有可能意外將病毒放出了實驗室。大家應該明白，放出與她們前期論文所描述的相同病毒很容易被識別，世界同行都會重複你的實驗。更不可能故意放出病毒來，那將是犯罪和反人類的行為，沒有任何動機。
大家想想，我去自己的實驗動物房都需要嚴格地防範，戴帽子、穿鞋和口罩還配上隔離衣。我們華大沒有P4實驗室，美國隻有聯邦管理的地方才有這類嚴格防範烈性病原微生物的實驗室, P4是世界標準。武漢病毒所的P4實驗室為中國的唯一，為法國人設計但是中國人興建的，花費上億，相信中國人會遵守相應的國際規則。
陰謀論的重點是石正麗在2015年發表的文章：她們建立的毒力超強的嵌合病毒，這次泄露到了武漢的城區，這完全是胡言亂語。嵌合型病毒在科學實驗室到處都是，玩病毒的基因組的實驗太多了，可以用於檢測突變了的病毒的致命性或者尋找免疫中和抗原以支持疫苗的設計和製備。聽到一點什麽嵌合的描述就起陰謀論之心，那是外行人的誤解或誅心的謊言，科學家有責任向公眾說明。具體到她們的那篇2015年的嵌合病毒論文，論文的主體作者來自美國北卡大學，石正麗隻是合作方，所以如果說病毒泄露，先去美國北卡州的研究三角看是否有人大麵積感染。他們當時就是想模擬蝙蝠病毒可能的變異，為未來變異株的爆發積累經驗，未嚐不可。那病毒的製備也是為了研究病毒與受體的相互作用，看人工突變後的病毒特性，這些都是在嚴格控製的環境裏做的實驗。因為該嵌合病毒確實能夠感染人類細胞，並且免疫治療和疫苗對它都沒效果。雖然嵌合病毒在體內的致死性開始也相當高，但是比野生型SARS要低些。美國方麵確實質疑過科學家做出此病毒的初衷，這也可以理解，畢竟害怕病毒外漏，出現意外，所以美國主體研究組的課題被NIH在2014年叫停過，但是審查後又恢複了資助。
從2015年的嵌合病毒的文章看，全部的體內體外實驗都是在美國北卡做的，超過15位作者除了石正麗倒數第二和武漢作者在中間外全部是美國人，石正麗隻提了序列和質粒，她實驗室的人做了個假設性實驗。這是與北卡的合作課題，一般來說石正麗不會全力自己再去做，因為是別人的課題。在這種情況下，還炮製石正麗製造了超級病毒，真是什麽誅心的人都有。
這次石正麗研究組發現的武漢冠狀病毒是新病毒，為人類打破野生動物生態環境後所得到的報應，這新病毒肯定不是以前的嵌合病毒。她是拿生命擔保的，我們當然應該相信她。中國應該加大力度打擊野生動物市場才對，怎麽可能對自己的傑出科學家製造陰謀論？
有人編造的石正麗的實驗室把病毒放到了海鮮市場，這已經超出了我所知道的常識。我去過在武昌的病毒所，而華南海鮮市場則是在漢口江岸，離漢口火車站比較近，對於武昌那是無丈八尺遠的地方。很難想像編造的病毒外漏會把這兩個地方聯係在一起，現在有人給出了具體的距離，他們相距32公裏。被長江和漢水分隔的武漢有多麽大，中國的芝加哥，外地人很難體會到的。陰謀論在中美都有，與美國不同的是，洋人在見證事實後就會回頭，中國人會持續下去並且經久不衰。
現在陰謀論越演越烈，我今天遇到了令我難以置信的事情，因為連學文的人士都頭頭是道地跟我爭論改造過的病毒的毒性。這就是典型陰謀論的象征，已經相當盛行了，像偵探小說般靠推論而不是證據爭論科學問題。科學家永遠麵對事實，觀點也永遠隨證據而變化。我在以前的博文中曾經解釋中國科學家為什麽這次做得這麽快和漂亮，因為BAL（肺泡洗脫液）含高濃度病毒，樣本為急性發作而無繼發細菌感染，所以她們很快得到了病毒和序列。這個病毒所感染的主體組織與器官是與外界相通的，不像肝炎病毒或西尼羅河病毒必須取去世病人的肝髒或腦組織，那要困難得多。石教授是武漢大學畢業的，法國博士，受過相當好的訓練。石正麗是做基礎科研的，與喬治高的那篇流行病學的軟科學文章沒法比，喬治高還有疾控中心主任的職責，石正麗沒有。必須強調：我與石正麗和喬治高亳無關係，但是做科學的都知道《自然》和《新英格蘭醫學雜誌》是完全不同的雜誌，前者發表的科學硬很多。
現在這武漢冠狀病毒全世界都可以複製，基因序列全公開，是否為人造超級病毒會迅速被同行識別的，至今無任何國際同行專家公開質疑。再者，如果是實驗室放出的病毒，石正麗是有被殺頭的危險的，我們當然應該相信她，對武漢病毒所的陰謀論可以休矣。
為了避免陰謀論，我們必須學會獨立思考，也就是美國文理教育所強調的Critical Thinking, 參見我在一篇文章裏的描述：“英文裏麵的Critical Thinking指的是：獲得和麵對Facts, 考問Facts, 然後以Facts為基礎縝密推理（reasoning) 從而最終得出結論的過程。因為它是美國文理教育（Liberal Arts) 的核心，所以我覺得應該把Critical Thinking 翻譯成“理性思維”比較恰當”。
在文章中間讓我談點武漢病毒研究所，全名叫中國科學院武漢病毒研究所。我們在國內時是個很不起眼的研究所，這個研究所和武漢大學病毒係，都是耶魯人創辦的。當時武大的著名院士高尚蔭是耶魯博士，所以你可以想象他在武大有個生物係的情況下，還可以單獨成立一個什麽病毒係，完全沒有必要分得這麽細。
當時高尚蔭的武漢病毒研究所在全國並不成氣候，很少有野心的學生願意考那裏的研究生，與侯雲德和曾毅等名星匯集的北京預防醫科院病毒研究所完全不在一個層次上。這裏是有些原因的，很重要的原因是高尚蔭把病毒當成單一的微生物來玩，過份強調病毒作為工具在開創分子生物學中的作用，而不將病毒作為細胞內寄生物來看待，武大有細胞生物學專業。他們更不研究病毒與機體的互動，印證這點的是武大病毒係當時連有能力開出免疫學課程的教授都沒有，隻有請從德國回國的我導師史良如教授去給他們講免疫學，所以前武漢病毒所所長胡誌紅研究員都是從史教授那裏學到的免疫學。當年的武大隻研究病毒，不在意機體對病毒的免疫反應。聖路易斯華大的厲害是在超強免疫學的基礎上孕育出大量一流病毒免疫學家，隨便數數就有Skip Virgin, Mike Diamond和Robyn Klein。
武大病毒當年還有一個缺陷是集中研究與醫學無關的病毒，他們很多人是研究昆蟲病毒的，因為這是大佬高尚蔭的興趣。武大校友也這樣認為：“中國以前都是微生物學免疫學混在一起，到80年代末才分開。武大病毒係招分很高，有很多學霸雲集。因為沒有醫學專業，的確教師當中研究醫學病毒的人極少”。“到現在，武大生科院教師們，研究醫學相關的課題，還是不多。這的確是個大問題”。怪誰呢？怪不食人間煙火的耶魯教育。回憶這段曆史，如今的武漢病毒所確實是換了人間，現在他們是這次中國抗擊武漢冠狀病毒的重要科研機構，讓我們祝福他們。
讓我談點國際上是如何麵對質疑的，這或許對石正麗有點用。我做過高中辯論隊的裁判，在國際科學會議上喜歡提問，在書麵上也評審科學論文。我有一個習慣，那就是對那些很激烈地為自己辯護的人比較警惕。我記得當年英國摩爾根教授在意大利會議上質疑哈佛教授的基因踢除老鼠存在問題，因為他們踢除的蛋白並不在紅細胞膜上表達，但是缺陷了該分子的紅細胞卻會呈現溶血現象。這是一個自然而很有力度的問題，哈佛組的文章當時剛發表在頂尖雜誌Immunity上。麵對摩爾根教授在大會上的提問，具有南美熱血性格的哈佛教授情緒激動，他迅速將幻燈回到展現溶血的試管影像說：“看這裏，看清楚點，這顏色你還能否認嗎？”，溶血後血紅蛋白釋放到試管呈現紅色，他當時是失控般地爆發。我們回來後談及此事，阿肯森教授就說，情緒化的反擊往往對你不利。還真被我們預料中了，多少年後哈佛的研究組承認自己在製備基因踢除鼠時載體設計出了錯，所以他們的結論不能成立。那位英國教授也不善良，他是窮追不舍，一直把質疑弄到了哈佛醫學院的高層。
所以我對石正麗的建議是，沒有必要激動到拿自己的“生命擔保”。生命對任何人都隻有一次，應該在此強壓力的日子過去後，帶著家人去度個假，享受屬於自己的人生。石教授應該擁有統領千軍的氣派，讓實驗數據說話，那印度人的論文不值得一駁，他們自己都不知趣而撤稿或將做重大修改。
武漢病毒所石正麗研究員的聲明。
那篇2015年的Nature Medicine論文和各作者貢獻的聲明。
武漢大學前病毒學教授高尚蔭。那些不滿武漢病毒所的人注意了，你們別放過了耶魯。因為錯誤的源頭在耶魯，是耶魯沒有把高尚蔭教育好。
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Californian2020-02-06 06:00:53回複悄悄話科學本身就要求懷疑一切。 管理不善和科研超出自己能及的範圍是有可能的。
這就是你一個科學家讓人閉嘴的證據？！真是醉了。
現在想騙大家比過去要難很多了。這篇文章隻能顯示你的無知。和掩蓋你的同事的無恥而已。
不過，你顯然忽略了一種可能性。即武毒所有人私下出售野生動物屍體，包括蝙蝠，給周圍居民或餐飲老板。有些肉類可能帶有病毒，將居民或老板感染了。因為這些居民或餐飲老板嗜好野生動物肉類，除了到武毒所購買外，另一個常去購買的地方就是那個海鮮市場。於是，他們又把病毒帶入到海鮮市場。很多早期患者都是集中在海鮮市場。
這個過程有沒有可能，是需要查證的。
另外石的說話方式很難和理性的科學家相匹配，難道科學家說理就是自己的生命擔保和讓別人閉臭嘴嗎？ 我希望世界上能有更多的高手能出來證明病毒泄露是完全不可能的事，否則任何猜測都有可能。
Most people here do not understand correlation is not causality. Amazing.
這個新病毒的S-蛋白和SARS的S-蛋白高度相似。據說有~90%左右。
可是仔細辨認，兩者的S蛋白有120 多處不同（或者單個氨基酸或者連續幾個氨基酸不同）。當然從合成的角度來看，這是人工可能做到的。但是，120 多處的改變，由誰能預測到最終S蛋白的性質？可以說。沒人能預測。 因為假說一處改變，會造成兩種結果，則１２０處的改變，會有２的１２０ 次方的可能，有人能預測最後的 ２的１２０次方的最後結果嗎？ 不可能。
當然，除非有人不需要預測結果，瞎胡亂作出一個，是什麽就算什麽。這人或者是瘋子，或者是傻子。
below paper already indicates wuhan virus having high amino acid idenities withh most of BAT proteins, except small parts including S protein. Who knows which FUCKER made this chimeric virus, nature or experts. Some people really don't have universal bottom being a human being.
https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736%2820%2930251-8/fulltext#seccestitle80
Synthetic recombinant bat SARS-like coronavirus is infectious in
cultured cells and in mice
JOURNAL Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (50), 19944-19949 (2008)
PUBMED 19036930
某研究，是中美雙方合作的，但因為某種原因，美方明麵上停止，但仍然在私下合作，具體實驗地點在中國。然後，實驗的載體，比如說豬，要被處理銷毀，但因為非洲豬瘟豬肉漲價，被人賣到市場。再然後，事情就發生了。。。。。。
隻有這樣，才能完全解釋得通，為什麽武漢有奇高的死亡率，以及中國和美國的奇特反應，感覺雙方互捏把柄，互相cover.
泄露假設的一種假設是：猴子被販賣到海鮮市場。 這個應該不難查證。 不知有誰去查？
病毒所有沒有泄漏也不能肯定，雖然理論上要求很嚴。想想北京的SARS也泄漏過，那個又是什麽防範級別？
Burden of proof 落在指控人身上。按現時的政治製度和科學水平，可能要等上幾十年才能真相大白。期間還是提出不同假設，而不是什麽陰謀論。
病毒所應該建在山洞裏，而不是建在市區。周圍都是住?宅商店。我的問題是，要真是泄漏，為什麽不是中心型擴散，附近的人先中招，再往遠處伸展？
LOCUS NC_045512 29903 bp ss-RNA linear VRL 28-JAN-2020
DEFINITION Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete
genome.
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再問一次，他們給武漢人通過了什麽“臨床幫助”？誰規定病毒研究所的工作就是測病毒核酸序列、鑒定病毒種類的？人命關天，確定是否人傳人不是比發論文、申請專利更重要？一線普通醫生能看出問題，他們天天研究此病毒的頂尖科學家會不知道？
這個武漢病毒研究所的工作和目的到底是什麽？
他們論文越出色、水平越高，我的懷疑越大。
By the way, how many P4 labs were built or duplicated in Wuhan after first lab was completed? Do you know?
這個病毒實驗室根本不應該在武漢建，應該建在新疆和西藏交界處。在武漢萬一來個地震，房子裂縫，密封設備砸壞，病毒跑出來，後果難以預料，雞缸杯可能還有保險來提供經濟彌補，病毒在武漢彌漫可真沒救了。
但這也許是事故，2015年的NATURE文章有沒有雜交出跨物種的雜交珠呢？SHI組會不會留了病毒樣本冷凍呢？他們會不會在開展新的感染實驗中造成了泄露呢？比如染毒的動物跑了，被賣給野味市場了。這都有合理的疑問。
伊朗也是犯錯才打下了自己人的客機。
1，是不是質疑病毒源頭就是陰謀論？一言不合，有掛標簽嫌疑。
2，武漢是不是隻有一個病毒研究所或機構？這些機構不是可能性最大嗎？
3，濫吃野味不好，所謂海鮮市場會是不是誤導？野味病源不是沒有找到嗎？有未接觸該市場的早發病例（十二月 Lancet
文章）不己說明該市場並非唯一源頭嗎？
即使之前她們有這樣的樣品，是否會無意泄漏，與設備有關，也與工作人員是否認真負責，是否嚴格遵守規章製度有關。武漢病毒所之前有沒有這樣的病毒，研究人員的工作態度如何，我們外界不知道，不知有誰清楚。
到底真相如何，拭目以待。在真相出來之前，懷疑隻是懷疑。堅決反對把懷疑當成事實，堅決反對把可能性當現實。
@ali88,石正麗她們的工作是找出病原體,鑒定病毒種類，為臨床提供幫助。是不是人傳人，從病毒核酸序列上是看不出來的
他們能寫出如此高質量的論文，對新冠狀病毒了解如此深刻，他們就在武漢，卻對病毒感染武漢人沒有任何預警和幫助，這不是很可恥、很不可思議嗎？得出這樣的結論，需要什麽高深的知識？
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+100
中國這麽多醫學專家，刑偵高手不會傻的吧，等疫情過後，再下結論不遲吧。
作為對比，一線的八名醫務工作者，12月就發現人傳染人，並且在網上提醒親友和大眾。同時期，專門研究此病毒的武漢病毒所的石正麗團隊為武漢做了什麽？說出哪怕一件？
他們最近在自然發表文章，他們1月21日申請了治療新病毒的專利。他們忙著為人類做貢獻，就是沒時間告訴武漢人一聲這病毒會人傳人。好高尚啊！
武漢病毒所石的團隊自SARS後的17年裏一直在描繪SARS病毒家族的家譜，她們一直有相關文章，而且這幾年的文章裏多次警告要警惕SARS或SARS樣病毒回來。
中國內地有多個團隊也在研究蝙蝠與SARS的關係，香港、新加坡和歐美都有獨立或聯合的研究項目。
可怕的是，從發布的基因序列及相關文章來看：中國的蝙蝠病毒與非典SARS病毒最接近。蝙蝠病毒已經給中國帶來了兩次大的災難，還要加一次2017年廣東豬冠狀病毒感染-SADS，共三次了。
可以預言：中國的蝙蝠還會給中國帶來第三SARS災難。