該軍前身是西北軍第3路軍韓複渠一部。1937年8月抗日戰爭全麵爆發後，國民黨軍隊在進行整編中，將西北軍第3路軍部擴編為第3集團軍，原所屬4個師及獨立旅擴編為第12、第55、第56三軍。其中，曹福林任第55軍軍長，下轄：
第29師，曹福林兼任師長；
第74 師，李漢章任師長。
該軍組成後，奉命駐防魯北惠民、齊東一帶。
1937年9月下旬，日軍侵占平津後，分路南犯。時任第3集團軍總司令韓複渠擅自撤退，從德州、濟南、泰安，一味向南撤退，以致日軍長驅直入魯南至徐州地區。此後，第3集團軍總司令韓複渠由於率部擅自撤逃，被蔣介石下令槍斃，曹福林升任第3集團軍總司令兼任軍長。1937年底，該軍隸屬第1戰區，參加了津浦路北段沿線的作戰。1938年3月下旬，該軍參加了台兒莊戰役，赴藤縣以北，參加了阻止日軍增援台兒莊的作戰。同年8月，該軍編入第5戰區第2線兵團，參加了武漢會戰。武漢失守後，該軍撤至湖北、河南的平漢線以西地區修養。1939年4月至1944年秋，該軍隸屬第5戰區第33集團軍，先後參加了隨棗會戰，1939年冬季攻勢作戰、棗宜會戰，豫南會戰、第2次長沙會戰、鄂西會戰、常德會戰和豫中會戰等。1944年秋，第12軍第22師、第81師改隸該軍。此時，該軍下轄：
第22師，師長譚乃大；
第29師，師長榮光興；
第74師，師長李益智；
第81師，師長葛開祥。
1945年，該軍駐湖北均縣時參加了豫西鄂北的會戰。
1945年8月，抗日戰爭勝利後，國民黨軍隊進行整編時，該軍第22師被裁減，第81師改隸第68軍，另將第69軍第181師改隸第55軍。此時該軍隸屬第4綏靖區，駐防在河南商丘地區。曹福林任軍長，米文和任副軍長。下轄：
第29師，榮光興任師長；
第74師，李益智任師長；
第181師，張雨亭任師長。
1946年下半年，國民黨軍隊進行整編，該軍改編為整編第55師，原軍長曹福林改任師長。原第29、第74、第181 師依次改稱為整編第29、整編第74、整編第181旅。此次整編後，改整編師在冀魯豫地區先後參加了隴海路中段戰役、定陶戰役、巨野戰役、鄄城戰役、巨金魚戰役、豫皖邊戰役等作戰。在上述戰役中，該師整編第29旅、第181旅被人民解放軍殲滅後又重建。1947年3月起，國民黨軍隊開始重點進攻山東和陝北戰場時，該整編師隸屬第4綏靖區，擔任魯西南地區戰役中，該整編師的師部及所轄第29、第74旅被解放軍全殲，師長曹福林逃脫，副師長理明亞被俘。
1948年9月，國民黨軍隊進行整編時，該師恢複第55軍番號。曹福林任軍長，米文和、許文耀、陳宇書任副軍長，白耀先任參謀長。原轄整編第29旅恢複第29師番號，黃俊芳任師長；原整編第74旅恢複第74師番號，李益智任師長；原整編第181旅恢複第 181師番號，米文和兼任師長。該軍編製恢複後，由鄭州後撤淮南地區，途中與發起淮海戰役的人民解放軍遭遇，第181師被殲，副軍長兼師長米文和被俘。戰後重建第181師。同年12月，該軍由蚌埠南撤到淞滬地區，擔任銅陵至九江長達400裏的江防。1949年4月下旬，解放軍發起渡江戰役後，該軍由青陽、石棣南撤，經浙贛路向福建撤退。5月中旬，該軍進入福建漳龍地區。同年8月至11月，該軍參加了福州戰役和廈門戰役。在廈門戰役中，該軍主力被殲，第74師師長李益智被俘，軍長率殘部乘船逃往台灣後，該軍番號被撤消。
