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5.基因調控的立體化

  粗略地講,如果我們把決定一條蛋白質的DNA片段叫做一個基因,那麽在從DNA到蛋白質這一過程中的任何調控行為都可以看作是基因表達的調控。它至少可以分為這幾個層次,轉錄前、轉錄、轉錄後、翻譯、翻譯後,構成了基因調控的立體化圖象。轉錄水平的調控我們已經了解到,讓我們來看看其他水平的調控。

  5.1回文結構、重複順序與基因擴增在世界上各種語言文化,都會有有趣的回複詩、對話或對聯。如英語中,據《聖經》記載,亞當見到夏娃時的第一句話就是:“Madam,I′Adam(夫人,我是亞當)”。這就是個回文句子:“madamImadam”,倒讀順讀都是一樣的。我國文化中的回文詩和對聯更多,如一個寺廟的上聯是“人過大佛寺寺佛大過人”,這就是回文結構。

  在DNA結構中普遍存在著起調控作用的回文結構,如TATAT。DNA轉錄終止區具有回文結構,可以發出轉錄終止的信號。DNA複製起點也有回文結構,以利於複製時被識別。

  除了回文結構,在細胞中大約含有30%的重複順序。我們在抄寫文章時經常會見到個別詞或句子抄重的現象,在基因組中也有這樣的現象,DNA重複一個“句子”(被重複的核苷酸順序單位較多)時,這個句子重複大約幾次到幾十次之間,這就是中度重複順序;但如果是重複一個詞(通常是一個核苷酸或兩個核苷酸)則可以重複千次以上,這就是高度重複順序。在我們的腦海中,雖然基因組的結構偶爾發生變化,如交換、轉座子等,但其DNA的總量還是恒定的。現在看來,這種觀念也要發生改變了,實際上,基因組也會發生變化,如刪除一些DNA(基因刪除)等,不過這都是小變化。在真菌(我們食用的蘑菇)中,發生一種準性生殖過程:細胞在進行雜交之後,兩套染色體會逐漸一條條丟失,最後隻剩下一套染色體。基因變化饒有興趣的現象是基因擴增,在一些脊推動物和昆蟲的卵母細胞(卵細胞前體細胞),轉錄rRNA的基因(DNA)會大量擴增,數目由1500個劇增到2×106個;而當胚胎發育開始後,這些DNA又因失去需要而漸漸消失。

  5.2基因斷裂,內含子和外顯子轉錄後調節有趣的現象所謂“斷裂基因”。1977年,在美國冷泉港學術會議上,有兩位科學家羅伯茨和夏普報告了他們發現的“斷裂基因”。

  我們知道,RNA是以DNA有意義鏈按堿基互補配對原則轉錄的,如果讓RNA和這段有意義鏈混和,它們就會形成互補配對的雙鏈,這叫DNA-RNA雜交分子。羅伯茨和夏普各自發現的現象是,雜交分子中,DNA似乎比RNA長得多,所以每隔一段距離有一段DNA小環,這段環狀DNA無法與RNA配對形成雙鏈,它是單鏈的。如果決定RNA的單鏈DNA是一個基因的話,那麽這個基因好像在轉錄時中間斷裂了幾截沒有轉錄。因此被叫做斷裂基因。

  怎樣解釋這種現象呢?我們很容易想到兩種方案。第一個方案是,RNA轉錄時跳過了呈環狀的那些DNA片段。這是當時大家都想到的一種方案。

  第二個方案,DNA全部轉錄為RNA,然後切除與環狀部分DNA對應的部分。

  夏普證明是第二個方案,這出乎於人們的預料。從前體RNA到成熟RNA的過程叫做RNA剪接。斷裂基因就是外顯子被內含子所隔斷。

  我們在第三章中已經提到,切赫和奧爾特曼就是在研究斷裂基因的RNA剪接時發現酶性RNA而獲得了1989年諾貝爾化學獎的。

  而羅伯茨和夏普在1993年才獲得諾貝爾生理醫學獎。有一個傳聞,羅伯茨在領取諾貝爾獎時,一名記者拿了一根長繩作DNA,拿一根短繩作RNA,叫羅伯茨演示RNA-DNA雜交分子,羅伯茨很快就作出了演示。應該指出的是,羅伯茨在冷泉港宣讀的論文第一作者是來自中國的博士周芷女士,遺憾的是,她的名字沒有列上獲獎者名單(根據諾貝爾的遺囑,獲獎人數不超過三人),這是耐人尋味的!

  5.3信息體反義RNA和翻譯阻遏一般而言,mRNA的壽命很短,少則幾分鍾,長則幾個小時。可是,在高等植物的種子和動物的卵細胞中,mR-NA的壽命極長。如遼寧普蘭店出土的蓮實在1700年以後仍能萌發,這種mRNA叫做長壽命mRNA,亦稱預存mR-NA。

  長壽命mRNA原來是與蛋白質結合在一起的,形成了非常穩定的結構,叫信息體。長壽命mRNA通常結合有一段反義RNA,可以保持它的穩定。

  我們知道,mRNA是單鏈,而不是雙鏈,之所以是單鏈,是因為DNA雙鏈隻有一條鏈轉錄(不對稱轉錄)。但是如果另一條鏈也能轉錄一段不長的RNA,那麽這段RNA

  就會與mRNA形成互補鏈,這段RNA就叫做反義RNA(與mRNA的“意義”相反)

  1983年,米竹羅、西門斯和克萊克勒同時發現反義RNA能夠阻遏翻譯。反義RNA結合到mRNA的起始部位,這樣mRNA就不能與核糖體結合,也就不能開始翻譯。

  核糖體是由rRNA與蛋白質結合形成的,rRNA和蛋白質的結合是有一定比例的,如果蛋白質比rRNA有過剩,

  這些過剩的蛋白質就會與mRNA結合從而阻止翻譯,這就叫做翻譯阻遏。

  
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