1365年,經奧地利哈布斯堡公爵魯道夫四世特許,以巴黎大學的模式在維也納創辦了該大學,用以和德國國王查理四世於1347年建立的布拉大學相抗衡。1383年,魯道夫之弟及其繼承人阿爾貝特三世對這所瀕於癱瘓的大學進行了改組,給予大筆捐款,增加許多課程,擴大招生地區,從而使這所德語國家中曆史最久的大學煥發了活力,成為該地區的第一流學校,尤以醫學、法律和神學享有盛名。1848年該大學成為革命的中心。1850年進行了全麵改革,擴大了教師和學生的自由權利,采用了靈活的教學方法,開設了大量選修課程。1878年,文學院開始有限製地招收女生,1889年後又放寬了限製。1890年,醫學院采用男女合校製,19年後法學院也改為男女合校。現在該校設置藥學、天主教神學和新教神學、社會科學和經濟學、哲學、自然科學、法律和政治學、人文科學和醫學等多科院係,是維也納的一所國家拔款、男女合校的高等學府。