方濟各出身於意大利的富商之家,青年時以奢華出名。1198年參加阿西西對佩魯賈的戰爭,在作戰中被俘,一年後因病獲釋返回阿西西,放棄財產和家庭。1207年決心終身傳教,在意大利中部城市吸引了一批追隨者,方濟各為他們製定簡單的生活管理製度。1209年方濟各前往羅馬,獲教皇英諾森三世批準正式成立修會。該會支持教皇反對阿爾比派,會上被教皇派往法蘭西南部赤足傳道,並受教皇委托,和多明我會一起在各地主持異端裁判所。方濟各會提倡過安貧、節欲的苦行生活,會士間互稱小兄弟,故亦稱“小兄弟會”。初期會內規定不置恒產,會士托缽乞食,是天主教托缽修會之一。後來積累了大量產業,為此會內為如何履行神貧誓願問題發生爭論。1274年以後內部分歧日趨激烈,狂熱派主張絕對清貧,稱靈修派;寬和派主張隨著時代的進展而改變會規,以適應進修和傳教的需要,稱住院派;穩健派主張保有一定的集體財產,稱集體派。住院派得到教皇的支持。14世紀又產生了遵規派,號召修士脫離住院派過簡樸的生活。1525年又形成了嘉布遣小兄弟會。法國大革命時期,方濟各會一蹶不振,19世紀重又複興。1897年教皇立奧十三世批準各派與遵規派合並,製定新會章,正式命名為小兄弟會。1909年教皇庇護十世對該會進行整頓、改組,但至今仍有三個獨立分支:小兄弟會、住院小兄弟會和嘉布遣小兄弟會。