8世紀末,柬埔寨遭到爪哇人的入侵,國王被殺。9世紀初重新獲得獨立。前王子,耶跋摩二世在位時(802-850),定都於今吳哥東北的考倫山上,開始了吳哥王朝的統治。9世紀後半期-11世紀是吳哥王朝的早期,吳哥城開始建成並成為國都。在這裏修建有寺院和水力工程。11世紀初,出身於馬來亞王族的蘇耶跋摩一世奪取王位(1002-1050),並擴展勢力到湄公河下遊和老撾的琅勃拉耶,強令被征服地區的王公效忠,按期進獻珍寶。他繼續修建王公的宮廷。12世紀-13世紀是吳哥王朝的極盛時期,蘇耶跋摩二世時代(1113-1150)國力強大,有戰象20萬頭,版圖“東到海,西接蒲甘,南抵加羅希”(今馬來半島東岸),並與中國有密切往來。其問與李朝越南爭奪占婆,1145年曾一度占領占婆首都佛誓城。這一時期修建了吳哥寺。閣耶跋摩七世時(1181-1201)成為東南亞最強大的國家,其疆域包括今泰國和馬來半島的大部分,北方與中國南詔接壤,東達占婆和湄公河三角洲。另建新都吳哥通(“通”,城之意),崇信大乘佛教,廣建佛寺。由於大規模的營建和對外征服,汲盡了人民血汗,人民起義和被征服地區的反抗連綿不斷。13世紀中葉興起的泰族諸王國多次打敗吳哥王朝,並於1431年首次攻陷首都吳哥城。為避免泰人的威脅,1434年索裏約波王時遷都百囊奔(今譯金邊),柬埔寨逐漸走向衰落。今天的柬埔寨仍然保留有很多古代遺跡。