拉美西斯二世之子麥爾涅普塔赫統治時(公元前1236-前1223),埃及已開始麵臨內外交困的局麵。利比亞部落由西方侵入,“海上民族”從愛琴海和小亞一帶席卷而來,外患不斷。國內階級鬥爭形勢也隨之緊張,奴隸逃亡,甚至公開舉行起義,同奴隸主階級進行主仆爭。約公元前1200年,第十九王朝在人民起義的打擊下告終。第二十王朝拉美西斯三世統治時期(公元前1198-前1166),底比斯建造墳墓的工匠因饑餓而罷工,他們進入圖特摩斯三世和拉美西斯三世的神廟,把官吏和祭司包圍起來,迫使統治者們不得不向罷工者發放糧食。在此過程中,阿蒙神廟僧侶集團的勢力大大加強。他們控製了埃及全部土地的1/10,有42萬餘隻大小牲畜,8.6萬餘奴隸以及其他財富。最高僧侶的職務變成世襲,不再屬於法老,完全獨立於王權之外。神廟設有與神廟有關的經濟與行政機構,並擁有武器。拉美西斯十一世(公元前1113-前1085在位)時,底比斯的卡那克神廟最高祭司長霍裏赫爾奪得政權,建立第二十一王朝。在北方,利比亞雇傭軍首領控製了王權。這樣,曆時4個世紀之久的新王國終於崩潰了。