蚩尤為九黎部落的酋長,分為九派,亦稱“九黎”,即後來的“三苗”。最早生活在黃河流域,與黃帝爭鋒失敗被殺。顓頊、帝嚳時代,“九黎”趁共工與顓頊、帝嚳爭奪帝位時迅速發展起來。顓頊曾多次打敗三苗;到了堯、舜時代,三苗再次興起,又被打敗。
到禹繼承華夏部落聯盟首領後,三苗再度挑起事端。為了進一步擴大原始居民的生存空間,統一長江中下遊地區,成為迫在眉睫的國家戰略了。因此,禹決定對三苗進行一次大規模的戰爭。禹出兵之前,在祖廟舉行了一次隆重的祭祀上天和祖先的宗教儀式。
禹手執玄圭說:“三苗為亂,上天要懲罰他們。因為他們不聽教化,多次叛亂,誅殺無辜。現在,他們那裏妖魔四起,天生怪異,夜裏出了太陽,又下了三天血雨,炎熱的夏天竟然也結冰。種在地裏的五穀也發生了變異,祖廟中出現了青龍,狗也在市中嚎哭,人民驚恐,怨聲載道。我受上天、祖先之命前去討伐他們,希望大家同心協力,英勇奮戰,殲滅那些有罪之人。”這就是曆史上有名的流傳於今的《尚書·禹貢》篇。
三苗見禹率軍前來征討,慌忙率眾抵抗。但禹所率軍隊訓練有素,皆為控弦之士,強悍無比。開戰不久,其首領就被東夷部落的弓箭手射死。首領陣亡,苗軍大亂,潰不成軍,紛紛四散逃命。三苗故土難守,多數敗逃到西南地區,逐步被當地土著氏族部落融合。相傳今天聚居在湖南、廣西、廣東及雲南、四川、貴州等地的苗族,就是三苗的後裔。
至此,禹的勢力範圍擴大到江淮兩湖流域。
後來帝禹巡察到達會稽(今浙江紹興),並在那裏逝世,葬於此,終年100歲。