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4.DNA,生命中最美的分子

  4.1核酸的發現DNA的發現比其遺傳作用的發現要早得多。1868年,瑞士生物化學家米歇爾從膿細胞中提取了一種物質,發現它是一種酸性物質,與蛋白質不一樣,含有磷元素;進一步發現它在細胞核中,因此被稱為“核酸”。核酸的發現並沒有受到重視,因為蛋白質的神奇魅力太讓人著迷了。今天的情形就不一樣了,核酸的作用比蛋白質更加令人驚訝和迷戀。

  發現核酸以後,生物化學家想知道的是它的化學組成。德國的科賽爾第一個係統地做這項了不起的工作,他小心地把核酸水解,分離到一些含氮的堿性基團,DNA共有四種堿基,現在分別用字母A、T、C、G代替,我這裏不想提到它們難記的名稱,盡可以把它們分別想象為紅、綠、黑、白四種顏色的球。別小看這一工作,科賽爾因此獲得了1910年諾貝爾生理醫學獎;當時核酸的生物重要性並未揭示,在人們心目中它與澱粉、糖脂類沒有什麽太大差別,諾貝爾獎委員會居然將這項重大的獎授予這一工作,這是令人迷惑不解的。

  科賽爾獲獎的第二年,他的學生萊文另有新的發現,DNA中還有含五個碳原子的糖;後來又在酵母核酸中發現類似的糖,不過後者比前者多一個氧,所以前者叫脫氧核糖,後者叫核糖,意即核酸中發現的糖。膿細胞中的核酸叫脫氧核糖核酸(英文縮寫DNA),酵母核酸叫核糖核酸(RNA)。

  1934年,萊文證明組成核酸的基本單位是核苷酸,猶如蛋白質基本單位是氨基酸,不過核苷酸沒氨基酸種類多,它總共隻有8種,DNA有4種,RNA有4種。水解實驗證明核苷酸又是由五碳糖+磷酸+堿基組成。DNA的4種核苷酸中,五碳糖和磷酸是相同的,隻有堿基不同,可以表示為A、T、C、G,所以我們也可把核苷酸看成是顏色不同的。

  4.2美妙的雙螺旋自從DNA被發現是遺傳物質之後,科學家對DNA的興趣突然高漲,在英國和美國展開了一場研究DNA結構的競爭。

  1951年前後,關於DNA研究有兩項重要的進展。第一項是由威爾金斯和弗蘭克林作出的DNA晶體的X-衍射照片,因此人們斷定DNA結構類似於蛋白質,也是螺旋狀的。不過人們普遍認為DNA是三條螺旋盤旋而成,遠貌有點像女孩子織的辮子。泡林就是這樣發表他的DNA結構模型的。

  讓我們假定泡林模型的三條DNA鏈一樣長,即含有一樣多的核苷酸數,各為n個,則DNA分子總核苷酸N=3n,能整除3.

  另一項更為重要的結果是化學家查伽夫作出的,他測量了DNA的核苷酸數,發現總有“紅色的”與“綠色的”接近相等,“黑色的”和“白色的”接近相等,即有A=T,C=G。後來這被叫做查伽夫原則。這個結果有什麽意義呢?讓我們設A=T=n1,C=G=n2,則總核苷酸數N=A+T

  +C+G=2(n1+n2),總核苷酸數能整除2.這一結果與泡林模型是不符的。泡林設想的是三條螺旋才會有整除3的推論,結果整除2是否意味是2條螺旋鏈呢?

  沃森和克裏克正是這麽想的,DNA是二條螺旋的雙螺旋結構。他們把這種想法發表在1953年4月25日的英國《自然》雜誌上,這是分子生物學史上一篇光輝的文獻(才隻有一千多字),這一發現是分子遺傳學蓬勃發展的基礎,是分子生物學的裏程碑。

  因為這一偉大的發現,沃森、克裏克和威爾金斯分享了1962年諾貝爾生理醫學獎。

  DNA雙螺旋結構模型的美妙之處是由兩條右手螺旋盤旋而成,螺旋之間由堿基之間形成氫鍵而互補配對,遵循查伽夫原則:A=T,C=G(A、T間兩個氫鍵,C、G間三個氫鍵)兩條鏈核苷酸順序不一樣,互稱互補鏈。如果我們有登過高塔的經驗,那麽DNA兩條鍵鏈猶如登塔螺旋梯的兩側,而堿基之間的氫鍵猶如每一級台階。隻要我翻開任何一本大學生物學教材,都會看到DNA雙螺旋結構示意圖。

  4.3雙螺旋發現的故事沃森,1928年出生於美國芝加哥,中學畢業後進入芝加哥大學動物學係,曾立誌於鳥類學研究,後來突然改變主意攻讀遺傳學。大學畢業後師從著名噬菌體遺傳學家盧裏亞(此人在其學生獲獎後五年(1967)獲獎),獲得博士學位。

  此後,獲取一筆可觀的博士後研究經費,得以遊學歐洲。

  1951年,他在意大利生物大分子結構會議上聽到了威爾金斯關於DNAX-衍射分析報告,決定去英國了解進一步的情況,此舉得到導師的熱情支持並受到推薦。秋天,他到了劍橋大學卡文迪許實驗室,在肯德魯指導下研究病毒DNA結構。在這裏,他遇上了無所事事、正在攻讀博士學位的克裏克,開始了分子生物學激動人心的篇章。

  克裏克,1916年出生於英國北安普敦,1938年畢業於倫敦大學,主攻物理學和數學。做博士論文的第二年,第二次世界大戰爆發了,他進入海軍科研單位研究磁性魚雷。戰後的1947年進入劍橋大學自修生物學,1949年進入卡文迪許實驗室,在佩魯茲門下做“多肽和X射線研究”的博士論文,似乎並無多大建樹。

  對DNA結構發現有重大貢獻的還有兩位科學家,一位是威爾金斯,另一位是女物理學家弗蘭克林。威爾金斯在上大學時也是學物理學的,二戰期間曾參與過原子彈研究(曼哈頓計劃),因擔心承擔原子彈道義上的責任而改宗生物學。戰後到皇家學院工作,1950年開始研究DNA。威爾金斯對X射線衍射技術並不怎麽在行,於是招聘了弗蘭克林。

  弗蘭克林1920年生於英國,大學時在劍橋攻讀物理學,畢業後研究煤炭分子的細微結構,這使她熟諳X射線衍射分析技術。她對DNA結構的確定立下了不可磨滅的功勳,遺憾的是,未及看到諾貝爾獎頒發就因癌症於1958年病逝。

  這四位科學家都是個性鮮明的。沃森性格文靜內向,做事嚴謹踏實,為人謹慎;克裏克則比較急躁坦率,以大聲說話、縱情歡笑而知名;沃森在一本暢銷書《雙螺旋》裏這樣打趣克裏克:“聽到他的笑聲,就知道他在卡文迪許實驗室的哪個地方。”他的笑聲經常打擾另一位大科學家布喇格,以至布喇格總希望克裏克能早些完成博士論文離開實驗室,可是克裏克在博士論文上並無長進。布喇格隻好躲到安靜的地方去,但這並不解決問題,他的辦公室外的走廊曾兩次被克裏克實驗室漫出來的水淹沒。

  威爾金斯冷漠怪僻,極難相處,但沃森能與之友好相處。弗蘭克林為人敦厚、生活儉樸,從不像別的女性一樣喜歡裝扮自己,以至沃森形容她像一個不太幸運的母親的女兒。但她易於固執己見,沃森不友好地寫了她一筆,說有一次她要出手打他。威爾金斯對她抱怨女休息室簡陋失修的事耿耿於懷,卻又想不出理由來解雇她,大概所有國度的人在男女平等意識上總是大打折扣的。

  沃森和克裏克成功的主要原因是建立金屬模型,而其他人似乎不感興趣。1951年底,他們建立了一個三鏈模型,

  但當克裏克邀請弗蘭克林和威爾金斯參觀時,模型被發現是錯誤的,他們把DNA含水量算少了,因而密度增大,導致三鏈結論。三鏈模型失敗後,沃森去從事煙草花葉病毒遺傳學研究,而克裏克則去敷衍他的博士論文。

  1952年6月,他們會見了查伽夫,了解到A=T,C=G的事,這使他們想到DNA應該是雙鏈螺旋;沃森也曾想到A和T,C和G之間存在對應關係,但遭到查伽夫高傲的反對,查伽夫認為這隻是偶然現象。冬天,他們又走訪了威爾金斯和弗蘭克林,了解到弗蘭克林拍攝了另一張更為簡潔的DNA衍射照片,這張照片與雙鏈模型符合得很好。1953年2月,當克裏克忙於他的博士論文時,沃森在工具間裏做了第二個模型,這個也像我們登塔的螺旋梯,但堿基是A和A、C和C、G和G、T和T配對,這樣兩條鏈核苷酸順序就完全一樣了。2月19日,正當沃森為此興高采烈時,同室的美國化學家多諾休潑了冷水,他從結構化學的角度指出,堿基同配是行不通的。於是他們修改了模型,提出了現在通行的堿基異配(A=T,C≡G)模型,兩條核苷酸鏈順序不一樣,互稱互補鏈。

  當你第一次接觸DNA雙螺旋結構時,你是否會為它的簡潔、互補對稱和曲線造型而體現的美而激動呢?你是否會對生命由然而生崇敬之情呢?

  DNA的對稱不是軸對稱,而是互補對稱,就像我們中國的對聯,紅對綠、黑對白,沃森第二個模型是經典對稱的軸對稱,生命中行不通。

  
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