應該問最長的那段航空公司的做法。

同一公司，肯定運到終點， 最方便。但轉機時間也是有限製的，不能超過規定的時限。
不同公司－但是聯手公司（有聯運合同，買的聯票），行李也應該運到終點。但進出安檢換航班，可能要換新公司的登機牌。
不同公司－自己安排的分段行程，行李肯定要取出來再托運。領取新公司的登機牌。