蔡元培後來也與蔣介石分道揚鑣了，也營救過很多革命友人。這些功績和他參與清黨策劃都是真實的曆史行為，不應否認。

說明蔡元培雖然待人溫厚，可也是政治人物，有自己的原則和黨派立場。不能因為他一生做了很多有功於革命和新文化的事就否認他曆史上的汙點。參與政治很難不弄髒了手，這就是政治鬥爭的代價。