台灣“中科院”在90年代後期成立了“擎天計劃室”,並設計出“擎天”MK-1載具,驗證了衝壓發動機的遠程、高速巡航性能,先後完成了4次飛行試驗。1999年台灣“中科院”30周年院慶時,首次展示了配備“擎天”衝壓發動機的概念導彈,引發台灣地區軍迷狂熱激動。
1999年初,雄三飛彈進行了多次試射,驗證超音速自由飛行、軌跡俯衝、模擬攻艦、掠海飛行等性能,但都未達理想預期。這一年大陸海軍從俄羅斯引進了現代級驅逐艦,並獲得了先進的3M-80“日炙”超音速衝壓導彈,嚴重刺激了台灣軍方。於是“中科院”驟然加快了研發步伐,雄三導彈也終於在當年底首次試飛成功,速度超過了2馬赫,射程超過150公裏。
2004年,雄三飛彈全狀態實彈試射取得成功,隨後進行了一係列遙測彈試射和作戰測評。2008年台灣海軍開始實施“追風計劃”,雄三飛彈正式投入量產,至2012年共耗資120億新台幣生產了120枚導彈,每枚平均成本一億,折合人民幣2500萬元,價格居台製導彈之首。