呂秀蓮當時在吉普車上低頭用手帕壓住流血的腳（大圈），左側吉普車窗有子彈射入的痕跡（小圈）。
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“監委”三一九調查報告出爐，第一槍打的是呂秀蓮。
綜合台灣《聯合報》報道，台灣監察機構調查三一九槍擊案的調查報告11日出爐，發現四大疑點，其中第一槍是射向呂秀蓮，及陳水扁的槍傷在肚臍下方，但陳水扁當時穿的西裝褲、內褲都沒有血跡和彈孔，於理不合。“監委”並以“逾越權限”以及“無明確物證即遽下定論”等理由，認定台南地檢署有明確違失。但因此案已經移交特偵組重新偵辦，糾正南檢的提案並未通過。
第一槍射向呂秀蓮
2004年3月19日“大選”投票日前夕，當時的陳水扁、呂秀蓮在台南拜票時遭開槍射傷。案經警調項目小組、台南地檢署偵辦，及鑒識專家李昌鈺來台協助，宣稱凶嫌是已經死亡的台南市民陳義雄。
由於“破案”時陳義雄已死，南檢遂對陳義雄提“不起訴處分”。不過各方對此結果並不完全信服，陳義雄的家人也喊冤。“監察院”去年11月接受陳義雄家人陳情，由“監委”吳豐山負責調查。
吳豐山的調查曆時一年，約詢上百人。調查報告列出四大疑點，認為“檢方應厘清而未厘清”：第一，檢方認定陳義雄死亡的時間、原因，但從陳義雄屍體係有蚵繩及屍斑狀態等事證來看，都與檢方指陳的死亡時間及原因不符。
第二，檢方說陳義雄對陳水扁不滿才開槍欲置之於死地，但根據鑒識結果，第一槍是射向呂秀蓮，第二槍則是射向吉普車，“動機與行為不符”。
第三，檢方認為子彈是同一支槍管發射，但並無鑒識結論支持此一說法。
第四，陳水扁的槍傷在肚臍下方，但陳水扁當時穿的西裝褲、內褲都沒有血跡和彈孔，於理不合。
調查報告最後指出，以“不起訴書”結案雖然於法並非不可，但此案有很多疑點沒有澄清，且缺乏明確物證，南檢就遽下結論，以“已死亡，無法為自己辯護的陳義雄為唯一凶嫌”，不能消弭紛爭，反而增加社會疑慮。
推翻檢方說法
吳豐山的調查報告認定第一槍是朝著當時呂秀蓮而來，從而推翻南檢“陳義雄欲置陳水扁於死地而開槍”的說法。
調查報告指出，南檢對陳義雄的“不起訴處分書”，以陳義雄生前談話的內容，以及在政論節目上的言行、在桌曆寫的批評時局字眼，認定陳義雄“意圖殺害陳水扁”，由於“未顯露對呂不滿言行”，所以“擊中呂純係誤傷”。
不過吳豐山指出，依據現場重建的結果，第一發彈道是朝座車右前方擋風玻璃；法醫石台平說這是“瞄準車窗，製造事端”，但是鑒識專家李昌鈺則直言“第一槍彈道方向是朝呂方向射擊”、“吉普車的彈孔是瞄準呂而非陳”。
調查報告說，雖然刑事局解釋，李昌鈺的說法是“第一發子彈朝呂方向”而非“瞄準呂”，但仍無法解釋何以陳義雄“欲置陳死地，卻朝呂方向開槍”的“動機與行為不合”情況，所以檢察官認定陳義雄的行凶動機，確實有不合理之處。
陳義雄的兒女昨天表示，他們感謝“監察院”對檢方草率辦案提出糾正，但檢警認定陳義雄是凶手的傷害已經造成，“現在我們希望的是特偵組趕快查清真相，還父親清白。”
家屬表示，案發時，檢警查獲的子彈口徑是9.1公厘，但槍管口徑是9公厘，如何擊發？且沒人目擊陳義雄開槍，以他們和父親多年相處，堅信“父親不可能開槍殺人”。
家屬認為，“監察院”的調查報告，認為檢警不能證明陳義雄犯罪；站在家屬立場，眼前他們最希望的是還陳家清白，希望有朝一日官方人員站出來說：“三一九槍擊案不是陳義雄做的！”
呂秀蓮常自問：為何要射我？
五年多前的319“兩顆子彈”對於呂秀蓮而言是場夢魘。呂秀蓮心中經常浮現一個疑問：“為什麽要射我？”
呂秀蓮永遠都忘不掉那個下午。她記得，當時子彈打破玻璃後，身體立即感受到“好重，很痛”，陳水扁大約晚三、四分鍾後才發覺子彈從腹部擦過。她很篤定地說：“第一顆子彈是針對我，這是事實。”
直到昨天吳豐山提出調查報告，指稱“第一發子彈是朝呂秀蓮射擊”，這個遲到五年多的報告，似乎才讓呂秀蓮等到些許“平反”。
對呂秀蓮而言，她不僅是兩顆子彈受害者、同時也是政權得利者，如果無法找出事實，這種質疑將是她此生最大的侮辱。
背著指責上台、懷著疑惑下台。為了解開迷團，五年多來，呂秀蓮扮演“呂柯南”查案，從彈道比對、槍擊動機、陳義雄屍體、檢調辦案瑕疵等，呂秀蓮從各種線索中耙梳可能的答案，她還花了四個多月寫成《透視三一九》一書，希望成為檢調重啟調查的線索。
呂秀蓮表示，她最不能接受的是，陳義雄是唯一槍手；她最遺憾的是，沒有一口氣把真相查出來。她曾抱怨，陳水扁在三一九中彈、人格傷害很大，但扁沒有像她這樣很明確要查到底，“如果堅持調查，我們就不用受那麽多委屈”。
吳豐山：還是不知319真假
吳豐山政治立場被貼上為“親綠”、“親黨外”標簽。他說，他兩次任公視董事長，分別由國、民兩黨任命；兩次提名“監委”，分別由陳水扁、馬英九提名，足證自己立場超然；這次調查三一九槍擊案，是用“放空自己”方式完成。
吳豐山說，調查三一九案是很大的考驗，“即使到現在，我還是不知道三一九槍擊案是真的還是假的”。
他說，在調查方向上，他並不是要找出三一九槍擊案是真、是假的結論，而是綜合包括不起訴書、刑事局項目小組以及真調會的數據，檢視台南地檢署處理三一九槍擊案有無違失。
吳豐山說，雖然結論可能還是無法讓各方滿意，但他已經盡力做到“公正客觀”、“盡量深入”和“沒有預設立場”，希望能對三一九槍擊案繼續偵辦有所貢獻。
