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根據美國軍事上訴法院提供給媒體的一分訴狀，顯示陳水扁日前並非如其委托人所說，要“控告”美國總統奧巴馬，而是“請求”美國承認他是“美國軍政府代理人”，並飭令“現任台灣民政首長”撤銷他的無期徒刑。
據台灣《聯合報》報道，美國軍事上訴法院，上周已用“缺乏管轄權”為由，拒絕審理陳水扁案。但根據法院10日提供給台灣媒體的陳水扁訴狀內容，陳水扁是以“請願人(petitioner)的身分，向美國軍事上訴法庭提請願書，請求美國政府用“強製令”(writofmandamus)，提供他“特別救濟”(extraordinary relief)。
也就是說，陳水扁並非向美國軍事上訴法院“控告”任何人，而是“請願”，請求美國法院提供協助。這分請願書中，看不到美國總統奧巴馬，也看不到國防部長蓋茲的名號。
陳水扁這位“請願人”，在請願書中將自己定位為對台灣仍具管轄權的“美國軍政府”在台“代理人”，雖曾擔任“前中華民國總統”，但他秘密得知了“美國軍政府”仍存在台灣，“也本於職責接受美國軍政府官員的命令，以維持在舊金山和約下的現狀，並捍衛台灣，抗拒敵人。”
因此，陳水扁在請願書中說，他是“軍政府”委托在台灣治理的“實質民政首長”(de factociviladministrator)，在台期間皆奉美國在台協會的指示行事，“即使這些指示不符總統的決策”，他被台灣法院控訴的行為，則是發生在他擔任民政首長期間。
陳水扁在請願書中也宣布，他向法院及全世界公布，“美國軍政府”的確在台灣存在，他依美國軍法尋求救濟，美國軍方也應出麵，保護他這位曾擔任過“美國軍政府”“在台民政首長”的權利，並幹預台灣法院對他的無期徒刑判決。
陳水扁這位請願人，因此以一位被判無期徒刑的“前台灣實質民政首長”身分，向美國軍事上訴法院“請願”，要求法院下令：
一、飭令“美國對台軍政府”，承認陳水扁是其代理人。
二、承認陳水扁會遭判刑坐監，都是在他擔任“美國軍政府”實質行政長官期間的行為。
三、飭令“美國軍政府”，指示“現任台灣實質民政首長”，中止對陳水扁及與他有關的政治起訴，撤銷他的無期徒刑，並恢複他的人權及公民權利。
四、如有必要，法院應指派一位特別專員，並采取其它法院認為必要的救濟，以解決此案。 ”
