部分藍營人士對馬英九處理達賴事件，沒有先照會大陸，私下頗有微詞。
包括高雄縣市在內的台灣南部七縣市宣布邀請達賴喇嘛來台訪問安撫災民。台灣總統府隨即連夜開會審議。
馬英九星期四（8月27日）在南投縣災區視察時向記者證實，政府已經同意達賴喇嘛來台。
達賴喇嘛預計將於8月31日到9月3日訪問台灣南部。馬英九說，達賴喇嘛將“為往生者超渡，為生存的災民祈福”。
總統府發言人王鬱琦隨後在新聞發布會上表示，台灣歡迎世界各國宗教領袖來台從事宗教活動。
王鬱琦說：“對這次達賴喇嘛來台，我們抱持立場是，他來台灣參加法會，為風災中的罹難者進行超渡，為災民祈福，這樣活動我們表示歡迎。”
宗教名義
在台北的達賴喇嘛西藏宗教基金會董事長達瓦才仁早些時候向BBC中文網介紹說，邀請方希望達賴喇嘛能夠為台灣災區的死難者舉辦祈福法會。
達瓦才仁說，台灣發生風災後，達賴喇嘛已經致函馬英九，對死難者表示哀悼，對災民表示慰問。西藏流亡政府也在達蘭薩拉為台灣災民舉辦了大型祈福法會。
不過，北京當局指責達賴喇嘛從事分裂西藏活動，並把任何國家或地區接待達賴喇嘛來訪視為損害中國利益的“錯誤”行為。因此台北的決定可能會觸怒中國大陸。
但是王鬱琦說，兩岸關係從去年馬英九就任總統開始“有很多進展”，台北當局這次基於人道跟宗教考量歡迎達賴喇嘛來訪，對兩岸關係“應該不會有什麽傷害”。
中國國務院台灣事務辦公室發言人周四（27日）就台灣民進黨部分勢力邀請達賴喇嘛訪台事表態。
中新網援引這位發言人的話說，達賴不是單純的宗教人士，他打著宗教的旗號，一直在進行分裂國家的活動。無論達賴以什麽形式和身份赴台，我們都堅決反對。
"險惡用心"
發言人指出，正當大陸各界紛紛伸出援手，傾力支持台灣早日戰勝風災，重建家園之時，民進黨的一些人竟趁機策劃達賴到台活動，顯然不是為了救災，而是試圖破壞兩岸關係得來不易的良好局麵，這一險惡用心必將遭到兩岸同胞的共同反對。
不過，發言人沒有對馬英九總統批準發給達賴喇嘛赴台簽證作任何評論。
周四早些時候，馬英九總統在南投勘災時親自證實，政府已經同意發給達賴簽證，為往生者超渡，為生存者祈福。
台灣總統府發言人王鬱琦也召開記者會強調，這個決策是政府內部所做出的決定。
他說，兩岸關係從去年520開始，跟過去相比已經有很多進展，政府這次基於人道跟宗教考慮歡迎達賴喇嘛來台灣，對兩岸關係應該不會有什麽傷害。
宗教之旅
王鬱琦表示，總統府26日得知南部縣市首長邀請達賴喇嘛來台灣進行宗教活動後，就開會討論，並對相關信息進行了解。
經過評估後，府方在26日晚間11時，決定對達賴來台灣從事宗教活動表示歡迎。
台灣立法院長王金平呼籲中共當局，應該站在人道的立場來看這件事。他說，災民需要宗教力量的撫慰，而中共當局也應該多體諒。
國民黨立委吳育升認為，此時的確適合達賴來台，但民進黨千萬不要假祈福之名，行促銷台獨、藏獨之實。
不過民進黨立委田秋堇卻表示，達賴如果來台，對馬總統反而有加分的作用。
田秋堇說，達賴的所有行程都完全公開，外界可以看看是否有政治性的活動。
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