進化講的主要是物種的發展。是大尺度宏觀理論，大框架，是生命群體的總體框架。你說的這些是個體微觀現象。

這兩者當然不能矛盾，如果矛盾必然有一方需要修正。但完全用宏觀理論解釋個體微觀現象顯然是不合適的，至少是不完全的。

比如你說的這些，與進化論本身沒有任何矛盾。需要做的隻是了解人體胚胎到底是怎麽發育的。這是個目前非常活躍的研究領域，近期進展也非常快。可以說日新月異。可望在不久的將來會有很好的理論解釋這些非常複雜的過程。