一、1997-1998年，英國等實驗分析發現轉基因食品導致某些動物健康異常和種植區域出現異常。英國政府資助的研究顯示，食用了轉基因土豆的老鼠出現了肝髒癌症早期症狀、睾丸發育不全、免疫係統和神經係統部分萎縮等異常現象。
二、1997德國農民克勞納開始種植先正達Bt－176玉米試驗田，頭三年，玉米長勢喜人、毫無蟲害，當2001年，他將這種玉米用來喂養母牛時，牛開始劇烈腹瀉並停止產奶，最後，他總共損失了70頭牛。
三、1998年秋，蘇格蘭Rowett研究所的普茲泰教授（Pusztai）就在電視上公開宣稱，他的實驗證明，實驗鼠腎髒、胸腺和脾髒生長異常或萎縮或生長不當，腦部萎縮，多個重要器官也遭到破壞，免疫係統變弱。
四、1998年，歐盟國家通過法律，把轉基因農產品作業嚴格限製在實驗室環境或封閉區域之內。
五、1999年，美國康耐爾大學的研究者John Losey在英國《自然》雜誌上發表報告，用塗有轉Bt基因玉米花粉的葉片喂養斑蝶，導致44%的幼蟲死亡。
六、2000年到2001年，轉基因種植區域發現生態環境出現異常獲得更多證實，譬如，轉基因玉米品種本身尚未發現異常，但其周圍野生生態環境出現異常，而轉基因甜菜等品種的野外試驗顯示其本身和環境都發現異常。為此，美國、加拿大、英國和歐盟國家的政府農業部門緊急成立農業生態環境保護工作組，對轉基因種植區開始全天候的嚴密監控措施。
七、2004年先正達研發的轉基因Bt-176玉米爆發醜聞，德國黑森州北部農民從1997年開始試種Bt-176玉米，並用作奶牛的補充飼料，2000年當農民開始提高該玉米在飼料中的比例後，所有的牛都死了。2004年瑞士聯邦技術研究院踢球植物學研究所海爾比克教授發現，Bt-176中的用來毒殺歐洲玉米螟的Bt毒素，無法分解，最終毒死了奶牛。
八、2004年7月28日，美國國家科學院完成了特別專題研究並發布研究報告，指明：轉基因食品可導致難以預見的主基因（Host DNA）破壞，而用現有的審核和監測係統，美國各政府機構不能發現這些破壞。美國國家科學院列舉了審核轉基因食品產品的時候所沒發現的異常：
1、食用了轉基因玉米等轉基因食物的老鼠，出現血細胞和肝髒細胞異常、肝髒比沒食用的更重；
2、食用了轉基因玉米的豬，在美國中西部農場出現假孕或不育；
3、食用了轉基因玉米飼料的母牛，在德國實驗農場非正常死亡；
4、使用轉基因飼料的雞的死亡率比使用自然飼料的死亡率高出兩倍；
5、英國市場出現轉基因大豆食品後，居民的過敏症上升了50%，巴西出現同樣狀況；
6、被長期認為“安全”的轉基因玉米，其效果並非如推廣者說的那麽理想，例如，菲律賓食用者出現了皮膚、小腸和呼吸係統的異常反應；九、2005年5月22日，英國《獨立報》又披露了知名生物技術公司“孟山都”的一份報告，以轉基因食品喂養的老鼠出現器官變異和血液成份改變的現象。
十、2005年11月16日，澳大利亞聯邦科學與工業研究組織（CSIRO）發表的一篇研究報告顯示，一項持續4個星期的實驗表明，被喂食了轉基因豌豆的小白鼠的肺部產生了炎症，小白鼠發生過敏反應，並對其他過敏原更加敏感，並據此叫停了曆時10年、耗資300萬美元的轉基因項目。
十一、2006年，俄羅斯科學院高級神經活動和神經生理研究所科學家伊琳娜?艾爾馬科娃博士研究發現，食用轉基因大豆食物的老鼠，其幼鼠一半以上在出生後頭三個星期死亡，是沒有食用轉基因大豆老鼠死亡率的6倍。
十二、2007年，在奧地利政府的資助下，澤特克教授及其研究小組對孟都山公司研發的“轉基因玉米NK603（抗除草劑）和轉基因玉米MON810（Bt抗蟲）的雜交品種”進行了實驗。在經過長達20周的觀察之後，發現轉基因產品影響了小鼠的生殖能力。
十三、2007年10月和11月，美國《紐約時報》等媒體報道，經過長期周密跟蹤觀察，發現有兩種轉基因玉米種植導致傷害蝴蝶生存，對生態環境安全的威脅程度已經超出可接受水平。為此，歐盟已經做出了初步決定、禁止該轉基因玉米的種子銷售使用。
十四、2007年，法國科學家證實，孟山都公司出產的一種轉基因玉米對人體肝髒和腎髒具有毒性。
十五、2008年意大利的科學家做了一個長期實驗。他們用抗草甘膦轉基因大豆喂養雌性小鼠長達24個月，結果發現食用GM大豆的雌性小鼠肝髒出現異常。
十六、2008年，美國科學家也證實了長時間喂食轉基因玉米，小白鼠的免疫係統會受到損害，該研究成果發表在同年《農業與食品化學》雜誌上。
十七、2009年12月22日，法國生物技術委員會最終宣布，轉基因玉米"弊大於利"，這等於轉基因作物種植在法國的永久廢除。
十八、2009年12月一期《生物科學國際期刊》上發表的研究結果表明，三種孟山都公司的轉基因玉米能讓老鼠的肝髒、腎髒和其它器官受損。三種轉基因玉米品種，一種設計能抗廣譜除草劑（即所謂的Roundup-ready），另外兩種含有細菌衍生蛋白質，具有殺蟲劑特性。這項研究利用了孟山都自己的原始數據。
[中國於2000年8月8日簽署了《國際生物多樣性公約》下的《卡塔赫納生物安全議定書》，國務院於2005年4月27日批準了該議定書，中國正式成為締約方。議定書的目標是保證轉基因生物及其產品的安全性，盡量減少其潛在的對生物多樣性和人體健康可能造成的損害，在缺乏足夠科學依據的情況下，可對他國試圖入境的轉基因生物及產品采取嚴格的限製與禁入措施。該公約的第23條規定，對轉基因生物要進行嚴格的風險評估、風險管理和增加決策的透明度和公眾參與，應在決策過程中征求公眾意見，向公眾通報結果。但是，關於我們13億人民主糧的水稻進行轉基因商業化生產，農業部根本就沒有向公眾征求意見。]
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