文章中的“插入”一詞引起爭議,文章作者認為:

來源: 賭城看客 2020-02-01 13:32:29 [] [博客] [舊帖] [給我悄悄話] 本文已被閱讀: 次 (3458 bytes)

“我們目前正在目睹由2019年新型冠狀病毒(2019-nCoV)引起的主要流行病。2019-nCoV的發展仍然難以捉摸。我們在刺突糖蛋白(S)中發現了4個插入段,這是2019-nCoV所獨有的,在其他冠狀病毒中不存在。重要的是,所有4個插入片段中的氨基酸殘基均與HIV-1 gp120或HIV-1 Gag中的氨基酸殘基具有相同性或相似性。有趣的是,盡管插入片段在一級氨基酸序列上是不連續的,但2019-nCoV的3D建模表明它們會聚在一起構成受體結合位點。在2019-nCoV中發現4個獨特的插入片段,這些插入片段都與HIV-1關鍵結構蛋白中的氨基酸殘基具有同一性/相似性,在自然界不太可能是偶然的。這項工作提供了關於2019-nCoV的未知見解,並闡明了該病毒的進化和致病性,對診斷該病毒具有重要意義。”

他們給了個插圖和表,表中第一行是新病毒、第二行是艾滋病毒的基因片段,還挺像:



這是一段純理論工作,我很希望看到後續研究。但是文中用了插入(insertions)一詞引起了不滿,仿佛是人工插入似的。

文章發表不久,就有人評論說:

“所識別的四個氨基酸插入段都很短,並且在許多其他生物的基因組中發現,而不僅僅是HIV。換句話說,這項工作的主要發現完全是高度期待的巧合。”

“所有生物都包含一個DNA密碼,該密碼具有關於發育、功能和生長的遺傳指令-這就是所謂的“基因組”。您可以將每個基因組想象成一本說明書。這些作者所做的是應看一下2019年新型冠狀病毒的基因組說明書,並發現了在相關冠狀病毒SARS的基因組說明書中找不到的這4組字母。然後,他們將這些字母與HIV基因組書進行了比較,並發現了一些看起來有些相似但又不完全相同的地方。但是,由於這些字母太短,因此經常在許多基因組書中偶然發現它們。”

“在這裏注意:我們稱這些字母為“插入”,因為它們在一個基因組中,而不是在近親中 -“插入”並不意味著對人類的幹擾或工程改造 - 它是一個進化術語,指的是自然進化突變。”

多倫多大學的 Jason Weir 留言:“我對表中所示的四個2019年-nCoV插入片段進行了比對,並與HIV-1以外的許多其他序列比對。例如,插入片段RSYLTPGDSSSG的BLAST-P結果與GenBank登錄號GenBank:QHR63300.1的蝙蝠冠狀病毒的Spike糖蛋白具有100%的同一性。因此,它與已知的蝙蝠冠狀病毒的距離比與HIV-1的距離更近。同樣,其他三個插入片段中的每個與其他非HIV來源也具有100%的氨基酸同一性。因此,該論文極具誤導性,因為它沒有討論與非HIV-1相關來源的其他序列比對,其中某些具有比HIV-1更高的身份。該論文的含義是,2019年的nCoV冠狀病毒中插入了HIV-1病毒成分,應對此持懷疑態度。”

在 theprepared.com/blog/ 還有一篇專業人士評論這篇印度論文的博客,更詳細的說明新病毒不是“人造”的。

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