F-35有一個明顯的缺點,就是載彈量偏少,內載彈艙的容量隻能攜帶4枚AIM-120先進中程空對空飛彈,這比起F-22的內載彈艙動輒可掛載8枚以上空對空飛彈來說,數量要少得多,在小規模衝突時尚堪使用,但若進行規模較大的空戰就很容易落入彈數不足的窘境。洛克希德馬丁公司(Lockheed Martin)設計了一種新式武器架,稱為Sidekick,可使F-35A和F-35C多帶上兩枚飛彈,從原先的4枚加到6枚,這等於增加了50%的攜彈量,不過,Sidekick僅是改善彈艙空間配置,不是擴大彈艙,因此僅限於AIM-120這種彈徑較細的空對空飛彈能多帶2枚,粗壯的炸彈仍然無法裝。F-35B無法使用,因為內部空間被導風扇所占,武器艙比較小。
洛馬表示,F-35的第4批修改block 4可能就能應用Sidekick[28]。
在沒有使用Sidekick的情況下,F-35若要增加掛彈數,就隻有掛載於彈倉以外的部位,但如此一來將會大幅降低匿蹤性。