中隊
飛行中隊是執行皇家空軍主要任務的飛機部隊。皇家空軍中隊與英國陸軍的軍團係統有些相似，因為可以追溯到中隊悠久的建隊曆史和傳統，無論現在駐紮在何處，使用哪種類型的飛機。他們都可以因功勳而被授予軍旗和戰役榮譽。大多數飛行中隊由空軍中校指揮，以一個操作噴射機的中隊為例，大約配置有12架飛機。[19]
現役中隊
第1聯隊所屬:[20]
科寧斯比皇家空軍基地
第3中隊 – (台風戰鬥機FGR4)
第11中隊 – (台風戰鬥機FGR4)
第12中隊 – (台風戰鬥機FGR4)
第29中隊 – (台風戰鬥機FGR4) “作戰換裝部隊 (OCU)”
不列顛戰役紀念飛行中隊
利明皇家空軍基地
第100中隊 – 鷹式教練機T1A
洛西茅夫皇家空軍基地
第1中隊 – (台風戰鬥機FGR4)
第2中隊/第II(陸軍協同)中隊 – (台風戰鬥機FGR4)
第6中隊 – (台風戰鬥機FGR4)
第9中隊/第IX(轟炸機)中隊 – (台風戰鬥機Tranche 1/FGR4) [21]
第120中隊 – (P-8海神式海上巡邏機MRA1)
第602(格拉斯哥市)中隊(皇家輔助空軍) – (P-8導引支援)
馬鹹皇家空軍基地
第207中隊 – (F-35閃電II戰鬥機) (OCU)
第617中隊 – (F-35閃電II戰鬥機)
威汀頓皇家空軍基地
第5中隊/第V((陸軍協同)中隊 – (雷神哨兵預警機R1)
第8中隊 – (哨兵AEW1)
第13中隊 – (MQ-9A收割者偵察機)
第14中隊 – (比奇超級空中國王R1)
第39中隊 – (MQ-9A收割者偵察機)
第51中隊 – (RC-135W 空中搜索者)
第51中隊 – (情報, 管製, 目標獲取和偵察(ISTAR)，作戰換裝部隊)
第2聯隊所屬:
布萊茲諾頓皇家空軍基地
第10中隊 – (航行者KC2/KC3)
第24中隊 – (C-130J超級大力神/空中客車A400M)
第47中隊 – (C-130J超級大力神)
第70中隊 – (空中客車A400M)
第99中隊 – (C-17A全球霸王)
第101中隊 – (空中客車A400M)
諾霍特皇家空軍基地
第32中隊 – BAe 146/阿古斯特維斯特蘭AW109直升機
飛行小隊
芒特普萊森特皇家空軍基地, 第1435飛行小隊的駐地，小隊為福克蘭群島提供防空服務。
飛行小隊是中隊的一支分隊。飛行中隊通常分為兩個飛行小隊，例如"A"和"B小隊"，每個小隊在空軍少校下指揮。非戰鬥性的行政勤務中隊在基地中亦分為飛行小隊，這些小隊由一名低級軍官指揮，大多是空軍上尉。因為它們規模小，所以亦有幾個飛行單位組成了飛行小隊而不是中隊編製去運作。例如，在福克蘭群島芒特普萊森特皇家空軍基地的第1435飛行小隊，僅僅用四架台風戰鬥機FGR4維持防空作業。[22]
基地
主條目：英國皇家空軍基地列表
由英國皇家空軍管轄、使用的軍事設施，稱作“皇家空軍基地”（Royal Air Force station），包含了軍用機場、飛行場、新訓基地、行政基地、司令部等。目前英國皇家空軍規模最大的基地是牛津郡的布萊茲諾頓皇家空軍基地。而美國駐歐洲空軍在英倫三島亦與皇家空軍共用十餘座基地，薩福克郡的雷肯希斯皇家空軍基地及米登霍爾皇家空軍基地兩處設施美軍人員最多。英國皇家空軍亦部署多個海外基地。
