2005年4月8日，敦煌市七裏鎮政府派出一支由七個人組成的考察隊，經阿爾金山的南壩鄉向北，進入庫木庫都克沙漠，希望由此開發出一條旅遊路線發展旅遊業。
4月11日，一行人就地休息時，發現了40米開外的紅柳墩旁有一具幹屍。幹屍麵部朝下趴著，背部、腳、胳膊露在沙漠外的部分被曬得幹幹的，後腦勺上還有頭發。接觸沙漠的地方全部腐爛。
由於當時他們的食物和水已經不多，於是打算先把屍體埋進沙子，並做了標記和GPS定位，決定先走出沙漠再說。然而後來由於種種原因，直到一年後，也就是2006年4月14日，這具幹屍才被從沙漠中挖出，移交到了敦煌博物館保存。
而在朱明川的文章裏，老法醫“老鄧”經過DNA鑒定，確定幹屍就是彭加木本人，並從屍蠟判斷彭加木並非餓死或者渴死，而且幹屍頭部有3處鈍器傷、四肢11處銳器傷，胸、腹、背部有27處銳器傷……，因此老法醫斷定彭加木是他殺！
同時，文中還提出了三點很重要的疑慮：
第一，彭加木留下的紙條有過日期更改的痕跡，6被改成了7，這一點大家一眼就可以看到。這到底是彭加木6月17號寫紙條的時候記錯時間呢？還是後來被他人出於某些原因做了篡改呢？
第二，6月17日，在馬仁文的考察天氣記錄中，從下午三時起，庫木庫都克刮起了大風，漫天黃沙。然而在考察隊員們的陳述中，下午四時，不見彭加木回來，大家開始冒著風沙尋找彭加木，並在附近找到了彭加木的留下的非常清晰的腳印。
沙漠裏的大風刮起來飛沙走石，如何還能看到彭加木的腳印呢？況且在搜尋中，除了腳印、蘆葦中的坐印、糖紙之外沒有再找到任何與彭加木相關的痕跡，而這些痕跡全都是考察隊九人發現的。而彭加木失蹤前後幾天發生了什麽事情，說了什麽，除了那張紙條外，所有的信息全都是依靠考察隊其他人的口述。
第三，作為科學考察隊隊長，彭加木曾經明確宣布過紀律：“探險時外出必須兩人以上。”另外，他還強調過，在陌生的、容易迷失方向的地方考察，應該沿路插上路標。但是彭加木卻同時違背了這兩條自己定下的規矩，他不僅獨自外出找水，而且往東找水走的是陌生的路，他卻沒有插路標。
隨後老法醫經過對彭加木隊友的審問，一個驚天真相浮出水麵。
彭加木生前患有癌症，脾氣固執，視考察為最重要的事情，將生死置之度外。6月16日，考察隊幾乎彈盡糧絕，隊員們想向軍方發電報求援，然而隊長彭加木認為，用直升機運水太貴了，會給國家造成巨額花費，不如自力更生，就近找水。隊員們覺得彭加木患了絕症，活不多久了，可是沒必要拉著大家一起跟他尋死，於是考察隊發生了激烈的爭執，在極端焦躁的情緒和死亡恐懼下，隊員們集體殺害了彭加木。同時，彭加木留下紙條的時間和被害時間都是在6月16日，而隊員們為了拖延時間和圓謊，把16改成了17。
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