英國劍橋提供了新冠不是源於武漢的證據嗎？

粗讀了一下這篇倍受關注的來自英國劍橋的論文，這是我見到的可以供討論的新冠可能不是源於武漢的科學證據，發表在今天的《美國科學院院刊PNAS》上。根據基因樹分析，作者認為新冠存在A, B, C三大類，A和C類存在於美國和歐洲，B類存在於中國武漢。雖然A類存在於有武漢生活史的美國人中，但是A類大約有40%存在於武漢或中國人中。

必須說明這隻是根據極個別基因突變造成氨基酸改變的數學模型推演出來的，並且是首次應用到病毒學中，當然PNAS是一流雜誌。他們分析的基礎是從2019年12月24日至2020年3月4日的基因組測序，從而將它們分成A, B和C三大類型，其中A類是最原始的，但是A類雖在武漢人中存在但不是主要的類型，A類卻存在於在武漢生活過的美國人中。

武漢的主要基因型是B, 在東亞多見，作者認為B來源於A，而C又演變於B。C主要存在於歐洲（法國、意大利、瑞典和英格蘭), 也存在於日本和新加坡等亞洲國家。我不明白他們在文章中為什麽那麽強調A的美國源性，而那圖裏A的美國人很少，A是相當的混合組成。

武漢B類基因呈現低突變態式，它隻有突變了才能向外擴散，並且需要從免疫學或環境上突變才能適應廣大的東亞人口。作者說這些話時完全是在猜測，等於沒說，或者胡言亂語一番，因為沒有任何實驗證據支持，我不知道劍橋人為什麽這樣引申自己的推斷。

這篇論文當然是一家之言，三個作者都是Forster家的親戚。兩點存疑：首先，他們為什麽用蝙蝠的基因組作為根序列，而不用複旦張永振帖在NCBI的新冠基因序列作為根序列？另外他們也承認這是首次將此考古技術應用到病毒學上。

[cng]

顯然樓主不懂怎樣解讀進化樹。

這篇文章，蝙蝠跳進人類的節點就是中國樣品，黃色。這證據直指病毒源頭是武漢，至少是中國。

[luck86]

如果病毒來源在美國，為什麽美國大爆發晚於中國，甚至歐洲。不要說美國把肺炎當成流感，那麽現在的大爆發也應該就是流感了。不要拿極少數個例說事。邏輯總是要講的。

[24橋]

博主，我想請教2個問題：1）新冠基因庫已經上傳3000多基因序列，為什麽這篇文章隻選了160種，是依據什麽原則選的？2）除了sars和cov-19,曆史上還有源於蝙蝠的病毒傳染給人類的例子嗎？科學家們發現了多少種蝙蝠冠狀病毒？除了研究咱中國的蝙蝠，有研究外國蝙蝠的嗎？怎麽那麽巧，sars和cov-19都源於中國的蝙蝠？難道隻有咱中國的蝙蝠最毒？

[英國那些事]

回複 '清漪園' 的評論 : 劍橋的分析本身就沒有建立在完整數據上，有何可信度？看看財新的這篇報道（國內已被刪）https://matters.news/@LittleKui/%E6%96%B0%E5%86%A0%E7%97%85%E6%AF%92%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%BA%AF%E6%BA%90-%E8%AD%A6%E6%8A%A5%E6%98%AF%E4%BD%95%E6%97%B6%E6%8B%89%E5%93%8D%E7%9A%84-bafyreidznzhmd6ytnnacbz27xy6pqq2b3o45shbiw3frzhinubi7eugyue

[常態]

按照美國歐洲目前爆發的情況看，有誰會認為他們居然能延後半年才爆發？
倒是天朝，用了殺"敵“一萬自損10萬的孫子兵法，反正，多難興邦，代價你出。

[fyuanster]

回複 '我不是憤青01' 的評論 : 懷疑有用嗎？還不是你這樣的人，天天散步陰謀論嗎。承認武漢是源頭有那麽難嗎！

[fyuanster]

回複 'XYZ94538' 的評論 : 扯淡，香港早就報道，中國官方的報道是11月17號武漢出現了已知的第一例病例。流感和新冠和傳染性和死亡率都不是一個數量級的，你以為美國醫生都和你一樣傻分不清嗎？到現在你還相信陰謀論， 非傻即壞。

[XYZ94538]

美國許多人回憶去年11月份，12月份得的“流感”，其症狀與冠狀病毒症狀一致，還有一醫生測試了自己已經帶有冠狀病毒抗體，說明自己以前得的不是流感而是冠狀病毒症。

還有前天美國各大主流媒體各大電視廣播新聞網報道美軍情報機構曾在去年11月下旬準確預報武漢將有大瘟疫，而那時武漢還沒有任何病例，這更加增添了事件的詭秘。

[丁丁貓和熊貓貓]

慢慢奔潰額

[BeagleDog]

可能是國內的網民英文太爛？

[鬱二光]

任何這類文章對於追責中國已經無濟於事了。甚至以後有實錘證據病毒起源不在中國都沒有用。關鍵是疫情起源於中國而中國隱瞞疫情，且沒有向WHO和其它國家提供可參考信息。隱瞞疫情和感染人數，通過WHO誤導全世界。使得全世界失去了寶貴的把疫情控製在最初階段的時間。

現在各國政府不會再關注病毒的起源問題。那是一本糊塗賬。交給科學家互相爭吵去吧。那是他們擅長的。而且我相信是不會有結果的。中國政府就是死豬不怕開水燙。要錢沒有，要命來拿！西方國家的索賠舉動不是真正以為中國會賠償，而是在道義上壓中國。好為其它打壓中國的行為建立法理依據。中國這次玩完了！

[鴿哨]

"這篇論文被國內病毒陰謀論翻譯成不是來自於武漢的病毒，欺負中國人英語不好嗎？" +1

[紅米2019]

還沒看這篇，不過與之前版納和稍後上海的文章有很大區別嗎？其實光看早期的序列無法判斷究竟誰先誰後，必須加入兩個條件，第一是采用雲南蝙蝠序列作參考，但我們都知道雲南蝙蝠不是直接源頭，用其為參考有很大不確定性。第二必須參考流行病學信息，簡單說就是病例發生的時間先後和傳染關係，但這樣一來，再推論病毒起源就成了循環論證。所以這類研究我覺得很難得出什麽結論。

[Justness]

哈哈，司馬昭之心路人皆知！

[清漪園]

科學界不乏要獨樹一幟，一心成名的人。至於劍橋這篇文章的論述是否成立，需要全球科學界的英才們斷定。

[valore]

There are two subclusters of A which are distinguished by the synonymous
mutation T29095C. In the T-allele subcluster, four Chinese individuals (from
the southern coastal Chinese province of Guangdong) carry the ancestral
genome, while three Japanese and two American patients differ from it by a
number of mutations. These American patients are reported to have had a
history of residence in the presumed source of the outbreak in Wuhan. The C-
allele subcluster sports relatively long mutational branches and includes
five individuals from Wuhan, two of which are represented in the ancestral
node, and eight other East Asians from China and adjacent countries. It is
noteworthy that nearly half (15/33) of the types in this subcluster, however
, are found outside East Asia, mainly in the United States and Australia.

注意這句話：“four Chinese individuals (from the southern coastal Chinese province of Guangdong) carry the ancestral genome, while three Japanese and two American patients differ from it by a number of mutations.”

也是奇怪，武漢上傳的樣本並不多，和患病人數相比。

[wyhz9311]

Sample of 160 cases is definitely too small to be statistically meaningful. Considering the current population of Covid-19 patients has reached over 1.6 million, I do not see any significance of this research.

[我不是憤青01]

不用大家揣測，美國人自己也會懷疑美國可能最先有新冠肺炎病例

[Rosaline]

Xyz 先生，我在前麵已經回答了您的問題。

[XYZ94538]

美國許多人回憶去年11月份，12月份得的“流感”，其症狀與冠狀病毒症狀一致，還有一醫生測試了自己已經帶有冠狀病毒抗體，說明自己以前得的不是流感而是冠狀病毒症。

還有前天美國各大主流媒體各大電視廣播新聞網報道美軍情報機構曾在去年11月下旬準確預報武漢將有大瘟疫，而那時武漢還沒有任何病例，這更加增添了事件的詭秘。

[Rosaline]

謝謝雅美先生。我們西雅圖地區基本已經控製住了。Washington 的州長己將聯邦給的500個呼吸機退回去了，並且將在市中心體育館剛剛建好的野戰醫院也撒了，請去外州更需要的地方。
如今西雅圖春暖花開，陽光燦爛。

[雅美之途]

回複 'Rosaline' 的評論 : 謝謝！好久未見，祝一切好！

[Rosaline]

我每天跟蹤Twitter 上的Trevor Bedford, and 他的Nextstrain, 也堅信Nextstrain 的結果，因為Trevor Bedford 的分析樣品量大，也與Helen Chu 博士一直合作，Dr.Chu收集了一千多份西雅圖地區的冬季流感病毒樣本。目前的結論仍然未變。一切起源於武漢。

[cawan]

回複 'firecloud' 的評論 :

These authors only analyzed the first 160 sequences. Situation in Australia can be similar to those of WA and CA in the US: The early cases came from China, and the late cases are from US, Iran, and Europe. Nextstrain.org has the most updated information.

[雅美之途]

回複 '曉龍東雲' 的評論 : 就是想說不能證明啊，作者也說不能，隻是有人想往這方麵引伸。

[wumiao]

這篇論文被國內病毒陰謀論翻譯成不是來自於武漢的病毒，欺負中國人英語不好嗎？

[曉龍東雲]

“A類大約有40%存在於武漢或中國人中”，既然有40%，怎麽就能證明新冠不是源於武漢？不明白其中的邏輯。論文有沒有提到各個國家的基因各有多少？如果中國的基因很多的話，B類很多中國基因也正常啊

[firecloud]

cawan

那個傳播路徑圖顯然是錯的，澳大利亞前兩周就說了他們的病毒是美國傳過去的

[iask]

https://www.youtube.com/watch?v=XMJ0EmMfb3U

[iask]

Search on youtube: "The first documentary movie on the origin of CCP virus(Coronavirus)"

[playnice]

如果能得出這樣的結論，真是傻了。

[cawan]

If we go to nextstrain.org to look at the sources of the sequencing data, we can see the submissions from Wuhan are rare and very few were submitted after early February. Would it be possible that "they" only sequenced/submitted sequences related to the seafood market, or just group B to mislead the rest of the world? Even though the authors use RaGT13 as the reference, which is in the hands of a Wuhan research group, this paper does NOT say the virus is originated somewhere else.

Dailymail reported the publication of this paper and the recent discoveries by two American teams. Figure in the paper clearly shows that all three, A, B, and C started from Wuhan.

https://www.dailymail.co.uk/sciencetech/article-8204255/There-THREE-separate-types-coronavirus.html